{"lastupdate": "2021-06-06", "noseqs": 1274683, "lineages": {"B.1.1": {"nsamples": 28043, "lastcoldate": "2021-05-25", "residual": 1.2199080105917146, "max_ndiffs": 48, "mean_ndiffs": 13.344292693363762, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.23": {"nsamples": 80, "lastcoldate": "2020-04-29", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 7.275, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1": {"nsamples": 42849, "lastcoldate": "2021-05-31", "residual": -1.1773508849144803, "max_ndiffs": 45, "mean_ndiffs": 10.664519592055823, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.371": {"nsamples": 640, "lastcoldate": "2020-09-23", "residual": -1.3360788351178197, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 8.328125, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B": {"nsamples": 2671, "lastcoldate": "2021-04-10", "residual": 0.7180475796660464, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 4.048670909771621, "mutations": ["aa:orf3a:G251V"]}, "A.1": {"nsamples": 2425, "lastcoldate": "2020-10-29", "residual": -0.03824441851671322, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 7.241237113402062, "mutations": ["aa:orf1b:P1427L", "aa:orf1b:Y1464C", "aa:orf8:L84S"]}, "B.55": {"nsamples": 130, "lastcoldate": "2020-06-29", "residual": 0.9748133814267953, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 3.423076923076923, "mutations": ["del:1605:3"]}, "B.3": {"nsamples": 561, "lastcoldate": "2020-07-14", "residual": -0.3627030226669899, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 3.8823529411764706, "mutations": ["aa:orf1a:G392D", "aa:orf1a:A876T"]}, "B.1.383": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2020-06-01", "residual": 1.7894612437518274, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 6.032258064516129, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:K61N"]}, "B.30": {"nsamples": 47, "lastcoldate": "2020-08-24", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 5.553191489361702, "mutations": ["aa:orf1a:N1324S", "aa:orf3a:V88A", "aa:orf3a:G251V"]}, "B.52": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2020-07-05", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 6.54054054054054, "mutations": ["del:1605:3", "aa:orf1a:I547V", "aa:orf1a:L2609F"]}, "B.35": {"nsamples": 67, "lastcoldate": "2020-06-07", "residual": 1.4650026396015507, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 7.119402985074627, "mutations": ["aa:orf1a:N2405S", "aa:orf3a:G251V", "aa:N:T205I"]}, "B.40": {"nsamples": 1277, "lastcoldate": "2020-08-20", "residual": 0.935131393856575, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 6.04698512137823, "mutations": ["aa:orf1a:I739V", "aa:orf1a:P765S", "aa:orf3a:G251V"]}, "B.1.391": {"nsamples": 420, "lastcoldate": "2020-08-05", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 8.342857142857143, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A941V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L"]}, "B.39": {"nsamples": 178, "lastcoldate": "2020-06-05", "residual": 1.1802260230214943, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 6.466292134831461, "mutations": ["aa:orf1a:H417R", "aa:orf3a:G251V"]}, "B.10": {"nsamples": 60, "lastcoldate": "2020-05-15", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 8, "mean_ndiffs": 5.033333333333333, "mutations": ["del:1605:3", "aa:orf1a:P2144L", "aa:orf1a:T3579I"]}, "B.6.6": {"nsamples": 839, "lastcoldate": "2021-03-20", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 8.864123957091776, "mutations": ["aa:orf1a:S2015R", "aa:orf1a:T2016K", "aa:orf1b:A88V", "aa:N:P13L"]}, "B.61": {"nsamples": 68, "lastcoldate": "2020-04-23", "residual": 0.24653219806334312, "max_ndiffs": 8, "mean_ndiffs": 4.602941176470588, "mutations": ["aa:orf1a:P765S", "aa:orf3a:G251V"]}, "B.1.1.369": {"nsamples": 1050, "lastcoldate": "2020-12-08", "residual": 0.8557674188712177, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 13.39904761904762, "mutations": ["aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:D103Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.250": {"nsamples": 23, "lastcoldate": "2020-05-13", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 7.869565217391305, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L", "aa:orf8:A51V"]}, "B.1.162": {"nsamples": 130, "lastcoldate": "2020-09-28", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 9.323076923076924, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.320": {"nsamples": 512, "lastcoldate": "2021-01-20", "residual": -0.4023850102372102, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 10.59375, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.4.4": {"nsamples": 42, "lastcoldate": "2020-04-27", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 8.69047619047619, "mutations": ["aa:orf1a:N272H", "aa:orf1a:V378I", "aa:orf1b:A2132V"]}, "B.1.434": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-05-01", "residual": -0.766525601957707, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 8.1, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "A.2.2": {"nsamples": 247, "lastcoldate": "2020-04-27", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 9.805668016194332, "mutations": ["aa:orf1a:F3071Y", "aa:orf3a:G196V", "aa:orf8:L84S", "aa:N:P13L", "aa:N:S197L"]}, "B.29": {"nsamples": 103, "lastcoldate": "2020-06-14", "residual": 0.24653219806334312, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 5.485436893203883, "mutations": ["aa:orf3a:G251V"]}, "A": {"nsamples": 1659, "lastcoldate": "2021-05-16", "residual": 1.9365180211267123, "max_ndiffs": 43, "mean_ndiffs": 10.165762507534659, "mutations": ["aa:orf8:L84S", "aa:N:S202N"]}, "B.4.5": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2020-05-10", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 6.044444444444444, "mutations": ["aa:orf1a:P271S", "aa:orf1a:V378I", "aa:orf8:S24L"]}, "B.23": {"nsamples": 124, "lastcoldate": "2020-06-16", "residual": 1.7894612437518274, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 4.524193548387097, "mutations": ["del:1605:3", "aa:orf1b:A2268V"]}, "B.27": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2020-04-24", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 8, "mean_ndiffs": 3.772727272727273, "mutations": ["del:1605:3"]}, "B.1.369": {"nsamples": 1603, "lastcoldate": "2021-04-23", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 14.248284466625078, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S183Y"]}, "B.45": {"nsamples": 136, "lastcoldate": "2020-06-08", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 4.198529411764706, "mutations": ["del:1605:3", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.164": {"nsamples": 94, "lastcoldate": "2021-03-07", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 9.627659574468085, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.595": {"nsamples": 1962, "lastcoldate": "2021-04-27", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 16.07441386340469, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.1.10": {"nsamples": 494, "lastcoldate": "2021-05-04", "residual": 1.7894612437518274, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 12.868421052631579, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.222": {"nsamples": 135, "lastcoldate": "2021-02-17", "residual": 0.5709908022136198, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 7.044444444444444, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G"]}, "B.1.314": {"nsamples": 115, "lastcoldate": "2021-05-12", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 12.504347826086956, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:M585V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.38": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2020-06-15", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 9.75, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G44V", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.69": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-04-23", "residual": 0.5313088146433994, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 7.8, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.34": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2020-04-08", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 7, "mean_ndiffs": 5.153846153846154, "mutations": ["aa:orf3a:G251V"]}, "A.6": {"nsamples": 121, "lastcoldate": "2020-04-05", "residual": -0.24365706003387064, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 8.826446280991735, "mutations": ["aa:orf1a:L1375F", "aa:orf1b:V2223L", "aa:S:A829T", "aa:orf7b:C41F", "aa:orf8:L84S"]}, "B.4": {"nsamples": 270, "lastcoldate": "2021-04-08", "residual": 1.0144953689970155, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 7.6, "mutations": ["aa:orf1a:V378I"]}, "B.18": {"nsamples": 4, "lastcoldate": "2020-05-11", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 4, "mean_ndiffs": 3.5, "mutations": ["aa:orf1a:S318L"]}, "B.1.1.17": {"nsamples": 50, "lastcoldate": "2021-03-12", "residual": 0.5313088146433994, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 11.26, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A831V", "aa:orf3a:Y189C", "aa:M:T175M", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.1": {"nsamples": 1683, "lastcoldate": "2021-05-30", "residual": 0.8557674188712177, "max_ndiffs": 53, "mean_ndiffs": 17.998811645870468, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "A.5": {"nsamples": 316, "lastcoldate": "2021-03-18", "residual": 1.7894612437518274, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 5.012658227848101, "mutations": ["aa:orf8:L84S"]}, "B.4.7": {"nsamples": 56, "lastcoldate": "2020-07-11", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 11.785714285714286, "mutations": ["aa:orf1a:R207C", "aa:orf1a:V378I", "aa:orf1a:M2796I", "aa:orf1b:D1869G", "aa:orf8:G8*", "aa:N:P199S"]}, "B.1.1.41": {"nsamples": 97, "lastcoldate": "2021-05-07", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 12.989690721649485, "mutations": ["aa:orf1a:T2016K", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.465": {"nsamples": 167, "lastcoldate": "2021-03-29", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 10.32934131736527, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A879S", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.6": {"nsamples": 567, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": -1.011620230967543, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 6.608465608465608, "mutations": ["aa:orf1a:T2016K", "aa:orf1b:A88V", "aa:N:P13L"]}, "B.1.1.8": {"nsamples": 146, "lastcoldate": "2021-04-26", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 11.397260273972602, "mutations": ["aa:orf1a:S2103F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L46F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.89": {"nsamples": 75, "lastcoldate": "2021-05-12", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 11.746666666666666, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf6:W27L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "A.2": {"nsamples": 611, "lastcoldate": "2021-05-10", "residual": -0.9719382433973228, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 8.911620294599018, "mutations": ["aa:orf1a:F3071Y", "aa:orf3a:G196V", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S197L"]}, "B.1.13": {"nsamples": 176, "lastcoldate": "2020-06-16", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 9.159090909090908, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A440V", "aa:orf1b:V2371L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.42": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-03-04", "residual": 0.9748133814267953, "max_ndiffs": 4, "mean_ndiffs": 2.4615384615384617, "mutations": ["aa:orf3a:G251V"]}, "B.1.1.71": {"nsamples": 106, "lastcoldate": "2021-02-08", "residual": 0.5313088146433994, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 11.037735849056604, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.31": {"nsamples": 116, "lastcoldate": "2020-05-20", "residual": -0.0779264060869335, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 7.551724137931035, "mutations": ["aa:orf1b:D54Y", "aa:orf3a:G251V", "aa:N:D22G"]}, "B.1.1.257": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2020-04-30", "residual": 0.8557674188712177, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 10.102564102564102, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:T175M", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.201": {"nsamples": 109, "lastcoldate": "2020-07-05", "residual": 0.5313088146433994, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 6.844036697247707, "mutations": ["aa:orf1a:P892L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.557": {"nsamples": 42, "lastcoldate": "2020-05-18", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 5.904761904761905, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L"]}, "B.1.1.33": {"nsamples": 1334, "lastcoldate": "2021-04-14", "residual": -0.4023850102372102, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 14.124437781109446, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf6:I33T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T"]}, "B.1.264": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2021-02-01", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 9.392857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3885F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.3.1": {"nsamples": 155, "lastcoldate": "2020-06-09", "residual": 1.6237305898048902, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 4.574193548387097, "mutations": ["aa:orf1a:G392D", "aa:orf1a:A876T", "aa:N:S193I"]}, "B.1.212": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-06-29", "residual": -0.0779264060869335, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 8.25, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.439": {"nsamples": 122, "lastcoldate": "2020-09-23", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 10.270491803278688, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.277": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2020-05-21", "residual": -1.011620230967543, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 9.058823529411764, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1b:A440V"]}, "B.5": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-02-24", "residual": 0.0014375689759654256, "max_ndiffs": 5, "mean_ndiffs": 2.1, "mutations": ["aa:orf1b:T1730I"]}, "B.1.105": {"nsamples": 40, "lastcoldate": "2021-01-16", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 7.675, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:D81Y", "aa:orf1a:G519S"]}, "B.1.76": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2021-01-17", "residual": -1.011620230967543, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 8.28, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.319": {"nsamples": 161, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": 1.4650026396015507, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 8.701863354037267, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A3529V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.28": {"nsamples": 144, "lastcoldate": "2020-07-31", "residual": 0.6106727897062983, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 5.097222222222222, "mutations": ["aa:orf3a:G251V", "aa:N:S190I"]}, "C.11": {"nsamples": 197, "lastcoldate": "2021-05-18", "residual": -1.3360788351178197, "max_ndiffs": 45, "mean_ndiffs": 23.776649746192895, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.15": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-04-08", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 6, "mean_ndiffs": 3.727272727272727, "mutations": ["del:1605:3"]}, "B.11": {"nsamples": 108, "lastcoldate": "2020-05-13", "residual": 1.1802260230214943, "max_ndiffs": 8, "mean_ndiffs": 3.9166666666666665, "mutations": ["del:1605:3", "aa:orf1b:R1315C"]}, "B.1.67": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2020-06-30", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 7, "mean_ndiffs": 5.642857142857143, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.44": {"nsamples": 42, "lastcoldate": "2020-06-02", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 11.333333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:P3371S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1706L", "aa:S:D614G", "aa:S:D936Y", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.142": {"nsamples": 147, "lastcoldate": "2020-07-18", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 7.034013605442177, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S425F", "aa:S:D614G"]}, "B.1.395": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2021-05-08", "residual": 0.5313088146433994, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 12.461538461538462, "mutations": ["aa:orf1a:S2242F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.289": {"nsamples": 177, "lastcoldate": "2020-07-15", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 14.983050847457626, "mutations": ["aa:orf1a:G3846S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A54S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:L2039F", "aa:orf10:L17P"]}, "B.1.252": {"nsamples": 43, "lastcoldate": "2020-12-23", "residual": 0.4519448395805005, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 7.27906976744186, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L", "aa:N:D401Y"]}, "B.1.1.372": {"nsamples": 720, "lastcoldate": "2021-05-27", "residual": -1.3360788351178197, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 13.591666666666667, "mutations": ["aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.489": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2021-03-23", "residual": -1.0909842061079837, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 13.428571428571429, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D936Y", "aa:S:A1020V", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:P207L"]}, "B.1.428": {"nsamples": 538, "lastcoldate": "2021-01-15", "residual": -0.0779264060869335, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 10.4182156133829, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T346I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.223": {"nsamples": 169, "lastcoldate": "2020-08-20", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 9.727810650887575, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M657I", "aa:S:D614G"]}, "B.1.93": {"nsamples": 709, "lastcoldate": "2021-02-10", "residual": -0.4023850102372102, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 8.287729196050776, "mutations": ["aa:orf1a:D3511E", "aa:orf1b:T132I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S188L"]}, "B.26": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2020-05-01", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 7, "mean_ndiffs": 3.2857142857142856, "mutations": ["del:1605:3"]}, "B.1.9": {"nsamples": 126, "lastcoldate": "2021-03-17", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 11.928571428571429, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1408L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.211": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2020-04-12", "residual": -1.011620230967543, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 7.2727272727272725, "mutations": ["aa:orf1a:Y118C", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.6": {"nsamples": 43, "lastcoldate": "2020-09-02", "residual": 1.4650026396015507, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 7.813953488372093, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H604Y", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:A2710V"]}, "B.1.40": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-05-23", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 10.571428571428571, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:P271S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:E:L73F"]}, "B.58": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2020-05-18", "residual": -1.011620230967543, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 6.913043478260869, "mutations": ["aa:orf1a:H417R", "aa:orf3a:G251V"]}, "B.1.120": {"nsamples": 40, "lastcoldate": "2020-06-14", "residual": -0.4817489853776507, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 11.2, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S33I", "aa:orf7a:A8T"]}, "B.1.111": {"nsamples": 419, "lastcoldate": "2021-05-10", "residual": -0.4023850102372102, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 19.20525059665871, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:I114T", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:T205I"]}, "B.1.157": {"nsamples": 101, "lastcoldate": "2020-08-08", "residual": -1.3360788351178197, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 8.049504950495049, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1220P", "aa:S:D614G"]}, "B.1.104": {"nsamples": 116, "lastcoldate": "2021-02-17", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 8.327586206896552, "mutations": ["aa:orf1b:A88V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L"]}, "B.1.356": {"nsamples": 361, "lastcoldate": "2021-03-22", "residual": 0.24653219806334312, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 10.28808864265928, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:A99V"]}, "B.1.1.213": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-07-16", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 12.95, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:M:V23L", "aa:orf1a:G112S", "aa:orf1a:W630R"]}, "B.1.610": {"nsamples": 333, "lastcoldate": "2020-12-26", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 12.3003003003003, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:L1748M", "aa:S:L18F", "aa:N:S194L"]}, "B.1.35": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2020-05-21", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 7.076923076923077, "mutations": ["aa:orf1a:S2242F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.190": {"nsamples": 3, "lastcoldate": "2020-05-10", "residual": 0.4519448395805005, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 11.0, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A440V", "aa:S:D614G", "aa:N:D144N", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:C2239F", "aa:S:G769V"]}, "A.3": {"nsamples": 292, "lastcoldate": "2020-08-22", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 14.284246575342467, "mutations": ["aa:orf1a:D75E", "aa:orf1a:P971L", "aa:orf1a:M4071I", "aa:orf1b:F1757L", "aa:orf8:V62L", "aa:orf8:L84S", "aa:N:A208G"]}, "B.57": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2020-04-27", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 7, "mean_ndiffs": 4.354838709677419, "mutations": ["del:1605:3"]}, "A.2.3": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2020-05-29", "residual": -1.2963968475475995, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 10.820512820512821, "mutations": ["aa:orf1a:F3071Y", "aa:orf3a:L108F", "aa:orf3a:G196V", "aa:orf3a:Q213K", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S197L"]}, "B.1.70": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-04-22", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 8, "mean_ndiffs": 7.0, "mutations": ["aa:orf1a:A540V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.8": {"nsamples": 311, "lastcoldate": "2021-02-25", "residual": 1.4650026396015507, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 7.816720257234727, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.32": {"nsamples": 23, "lastcoldate": "2020-05-22", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 5.782608695652174, "mutations": ["aa:orf1a:E441G", "aa:orf3a:G251V"]}, "C.36": {"nsamples": 1107, "lastcoldate": "2021-05-30", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 52, "mean_ndiffs": 32.51219512195122, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:G212V", "aa:orf1a:T4090I", "aa:S:Q677H", "aa:orf1a:A859V", "aa:S:S12F", "aa:orf1a:E102K", "aa:orf1a:D1639N", "aa:orf1a:P2287S", "aa:orf1a:D3222N", "aa:orf1a:L3691S", "aa:S:L452R", "aa:orf7b:A43S", "del:28271:1"]}, "B.1.2": {"nsamples": 56260, "lastcoldate": "2021-05-22", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 47, "mean_ndiffs": 22.401510842516885, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:N1653D", "aa:orf1b:R2613C", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:G172V", "aa:orf8:S24L", "aa:N:P67S", "aa:N:P199L"]}, "B.1.1.323": {"nsamples": 47, "lastcoldate": "2020-06-16", "residual": 1.7894612437518274, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 10.46808510638298, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:T175M", "aa:N:T24N", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.5": {"nsamples": 87, "lastcoldate": "2020-12-25", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 11.873563218390805, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.436": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2020-05-02", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.35897435897436, "mutations": ["aa:orf1a:L1249P", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:T2548I"]}, "B.1.12": {"nsamples": 68, "lastcoldate": "2020-09-18", "residual": -1.011620230967543, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 10.147058823529411, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A1352V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:A99V"]}, "B.1.586": {"nsamples": 75, "lastcoldate": "2020-10-26", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 10.213333333333333, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.518": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2020-06-10", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 11.733333333333333, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G2610S", "aa:orf1b:G2610D", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.178": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-08-02", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 8.444444444444445, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.128": {"nsamples": 1113, "lastcoldate": "2021-04-03", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 12.424079065588499, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:I1674T", "aa:S:D614G", "aa:M:D3G", "aa:orf1a:T1822I", "del:29582:6"]}, "B.1.37": {"nsamples": 61, "lastcoldate": "2020-08-19", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 8.967213114754099, "mutations": ["aa:orf1a:A1420T", "aa:orf1a:L3483F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.370": {"nsamples": 42, "lastcoldate": "2020-12-01", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 12.095238095238095, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:S939F", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.413": {"nsamples": 116, "lastcoldate": "2021-04-22", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 10.663793103448276, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.370": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2021-03-02", "residual": -0.19697236879759433, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.513513513513514, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.91": {"nsamples": 343, "lastcoldate": "2021-04-13", "residual": -0.03824441851671322, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 10.247813411078717, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D839Y"]}, "B.1.22": {"nsamples": 473, "lastcoldate": "2021-01-08", "residual": 1.4650026396015507, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 13.75475687103594, "mutations": ["aa:orf1a:A3615V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.37": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2020-04-16", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 5.84, "mutations": ["aa:orf1a:P2605S", "aa:orf3a:G251V"]}, "A.4": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2020-05-01", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 9.08695652173913, "mutations": ["aa:orf1b:V972I", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S202N"]}, "B.1.139": {"nsamples": 942, "lastcoldate": "2021-04-09", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 15.697452229299364, "mutations": ["aa:orf1a:D144A", "aa:orf1a:K1202N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S235F", "aa:orf1a:P1321S", "aa:orf1a:L2524F", "aa:orf1a:P1803S", "aa:orf1b:Q2070H"]}, "B.1.292": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-07-30", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 9.0, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:A3209V"]}, "B.1.308": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2020-07-14", "residual": -0.766525601957707, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.615384615384615, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3201F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E427G", "aa:orf1b:S2430R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.108": {"nsamples": 100, "lastcoldate": "2021-03-27", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 9.83, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:N482S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.36": {"nsamples": 3079, "lastcoldate": "2021-05-07", "residual": 1.2199080105917146, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 19.194543683013965, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "B.1.147": {"nsamples": 901, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": -1.011620230967543, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 7.855715871254162, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T14I"]}, "B.1.387": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-05-11", "residual": 0.5313088146433994, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 7.083333333333333, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K798R", "aa:S:D614G"]}, "B.1.459": {"nsamples": 140, "lastcoldate": "2021-05-14", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 45, "mean_ndiffs": 21.207142857142856, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:P1640L", "aa:N:A119S"]}, "B.1.378": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 8.347826086956522, "mutations": ["aa:orf1a:K1202N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.142": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2021-04-24", "residual": -0.0779264060869335, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 16.928571428571427, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:P681H"]}, "B.1.143": {"nsamples": 33, "lastcoldate": "2020-12-30", "residual": 0.4519448395805005, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 8.727272727272727, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.338": {"nsamples": 53, "lastcoldate": "2021-04-05", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 12.0, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:A2129V"]}, "B.1.1.198": {"nsamples": 433, "lastcoldate": "2021-05-13", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 19.702078521939953, "mutations": ["aa:orf1a:T999I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:D203Y", "aa:orf8:Q18*", "aa:orf3a:A54S", "aa:orf8:E110*"]}, "B.1.1.515": {"nsamples": 27, "lastcoldate": "2020-10-07", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 13.25925925925926, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2120L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.510": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2020-03-18", "residual": -0.4023850102372102, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 8.0, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D2318Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.94": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2021-01-20", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 9.714285714285714, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1183Y", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.28": {"nsamples": 1654, "lastcoldate": "2021-05-17", "residual": 1.4650026396015507, "max_ndiffs": 43, "mean_ndiffs": 19.15235792019347, "mutations": ["aa:orf1a:L3930F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:V1176F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.446": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2020-07-02", "residual": -0.4817489853776507, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 17.166666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:I2873T", "aa:orf1a:L2874I", "aa:orf1b:G16C", "aa:orf1b:G16D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "del:29867:2"]}, "B.1.555": {"nsamples": 51, "lastcoldate": "2021-05-18", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 12.764705882352942, "mutations": ["aa:orf1b:T243N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.333": {"nsamples": 77, "lastcoldate": "2020-08-13", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 13.857142857142858, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:I2873T", "aa:orf1a:L2874I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "del:29867:2"]}, "B.1.590": {"nsamples": 146, "lastcoldate": "2021-02-06", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 13.595890410958905, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:M902V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:E:V49L", "aa:orf8:S24L", "aa:orf1b:H1213Y"]}, "B.6.3": {"nsamples": 33, "lastcoldate": "2020-06-18", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 6.454545454545454, "mutations": ["aa:orf1a:T2016K", "aa:orf1a:S2625F", "aa:orf1b:A88V", "aa:N:P13L"]}, "C.22": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2021-01-23", "residual": 1.6704152810411665, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 15.181818181818182, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V90F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "N.3": {"nsamples": 114, "lastcoldate": "2021-01-04", "residual": -1.1703481812484242, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 13.719298245614034, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:E:V58F", "aa:orf6:I33T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T"]}, "B.1.195": {"nsamples": 110, "lastcoldate": "2021-03-04", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 10.372727272727273, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.4.6": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2020-04-18", "residual": -0.3627030226669899, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 6.809523809523809, "mutations": ["aa:orf1a:V378I", "aa:orf1b:P1821S"]}, "B.1.1.398": {"nsamples": 180, "lastcoldate": "2021-04-18", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 17.02777777777778, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.97": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-05-02", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 10.0, "mutations": ["aa:orf1a:K837R", "aa:orf1b:A34V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:D3G"]}, "B.1.350": {"nsamples": 197, "lastcoldate": "2020-12-28", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 8.385786802030458, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:G1219C", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.41": {"nsamples": 117, "lastcoldate": "2020-04-01", "residual": 0.32589617312624203, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 4.213675213675214, "mutations": ["aa:orf1a:M1769I", "aa:orf3a:G251V"]}, "B.43": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-03-09", "residual": 1.8688252188147263, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 6.25, "mutations": ["aa:orf1a:H3233Y", "aa:S:L8V", "aa:orf3a:G251V"]}, "B.1.332": {"nsamples": 189, "lastcoldate": "2020-09-23", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 8.365079365079366, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T551I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.507": {"nsamples": 48, "lastcoldate": "2020-08-06", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 12.333333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.59": {"nsamples": 98, "lastcoldate": "2020-09-21", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 9.275510204081632, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A440V", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.231": {"nsamples": 199, "lastcoldate": "2021-04-01", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 16.512562814070353, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q38P", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.513": {"nsamples": 64, "lastcoldate": "2020-06-02", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 8.578125, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M2414I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:S2193F"]}, "B.1.153": {"nsamples": 33, "lastcoldate": "2021-03-12", "residual": 1.7894612437518274, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 8.969696969696969, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M371I", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.75": {"nsamples": 52, "lastcoldate": "2020-07-09", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 11.057692307692308, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A846V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.187": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2020-05-05", "residual": 0.4519448395805005, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 7.379310344827586, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.129": {"nsamples": 90, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.3, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:A8S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:Q675H", "aa:orf3a:A23S"]}, "B.1.208": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2021-05-01", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 11.416666666666666, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1099F", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.416": {"nsamples": 453, "lastcoldate": "2021-04-28", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 17.549668874172184, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:T2432I", "aa:orf3a:T223I", "aa:orf1a:T436I", "aa:orf1a:S2242F"]}, "B.12": {"nsamples": 120, "lastcoldate": "2020-04-22", "residual": -0.8528922807642036, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 3.933333333333333, "mutations": ["aa:orf1b:F1901L"]}, "B.33": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-04-07", "residual": -0.0779264060869335, "max_ndiffs": 7, "mean_ndiffs": 5.15, "mutations": ["aa:orf3a:G251V", "aa:orf1a:K3353R"]}, "B.1.354": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-06-18", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 8.538461538461538, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.61": {"nsamples": 76, "lastcoldate": "2020-08-19", "residual": -0.6871616268172666, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 11.447368421052632, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1811F", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.220": {"nsamples": 64, "lastcoldate": "2020-07-01", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 7.890625, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.578": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2021-02-05", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 18.526315789473685, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:P1640S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P2612L", "aa:orf1b:R2613S", "aa:orf1b:R2613H", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "B.1.609": {"nsamples": 751, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 16.679094540612518, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.494": {"nsamples": 23, "lastcoldate": "2020-05-18", "residual": 1.6704152810411665, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 10.869565217391305, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:P681L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T362I"]}, "B.1.323": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2021-01-15", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 9.64, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.158": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2020-05-21", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 11.5, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1b:M1397I"]}, "B.1.384": {"nsamples": 119, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 9.596638655462185, "mutations": ["aa:orf1a:P1640L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.151": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2020-05-26", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 8.391304347826088, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R1813C", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A72S"]}, "B.1.1.137": {"nsamples": 36, "lastcoldate": "2021-02-11", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 9.027777777777779, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1749V", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.38": {"nsamples": 33, "lastcoldate": "2020-04-29", "residual": -0.4023850102372102, "max_ndiffs": 8, "mean_ndiffs": 6.03030303030303, "mutations": ["aa:orf3a:G251V", "aa:orf10:Y14C"]}, "B.1.249": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2020-06-27", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 8.857142857142858, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2691F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L", "aa:orf1a:H3633Q", "aa:S:G257D", "aa:orf1b:A647S"]}, "B.1.1.331": {"nsamples": 79, "lastcoldate": "2020-03-31", "residual": -1.2963968475475995, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 8.341772151898734, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.51": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-04-14", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 6, "mean_ndiffs": 3.5, "mutations": ["aa:orf1a:F617L"]}, "B.1.521": {"nsamples": 123, "lastcoldate": "2021-05-13", "residual": 0.16716822292290257, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 16.59349593495935, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2548I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L", "aa:orf1b:S961L"]}, "B.1.39": {"nsamples": 215, "lastcoldate": "2020-09-14", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 9.55813953488372, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.118": {"nsamples": 98, "lastcoldate": "2020-07-27", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 11.387755102040817, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T792N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.179": {"nsamples": 202, "lastcoldate": "2021-05-27", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 43, "mean_ndiffs": 7.024752475247524, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.49": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2020-04-13", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 5, "mean_ndiffs": 2.2, "mutations": ["del:1605:3"]}, "B.1.483": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2020-03-24", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 8.333333333333334, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.378": {"nsamples": 49, "lastcoldate": "2021-05-10", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 13.142857142857142, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.302": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2020-08-12", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 8.733333333333333, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:V62L"]}, "B.1.321": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2020-08-15", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 8.954545454545455, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:D340N"]}, "B.1.482": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-07-21", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 10.222222222222221, "mutations": ["aa:orf1a:A2320V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1127Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.166": {"nsamples": 101, "lastcoldate": "2020-06-11", "residual": -1.011620230967543, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 8.316831683168317, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A541V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.343": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2020-07-13", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 8.564102564102564, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:H1160Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.254": {"nsamples": 49, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 14.26530612244898, "mutations": ["aa:orf1a:H388Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.319": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2021-02-01", "residual": 0.8557674188712177, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 12.882352941176471, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T882I"]}, "B.53": {"nsamples": 65, "lastcoldate": "2020-05-17", "residual": -0.9719382433973228, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 5.076923076923077, "mutations": ["aa:S:Y28H", "aa:N:P344S", "aa:orf1a:I849V"]}, "B.1.9.3": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2020-05-23", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.470588235294118, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P821S", "aa:orf1b:S1408L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.240": {"nsamples": 1903, "lastcoldate": "2021-04-28", "residual": -0.766525601957707, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 14.309511297950605, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.96": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-05-11", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 9.771428571428572, "mutations": ["aa:orf1a:Q3777H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:D3G", "aa:orf1a:A3220V", "aa:orf1a:T4249I"]}, "B.1.78": {"nsamples": 71, "lastcoldate": "2020-05-29", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 7.323943661971831, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.185": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-05-01", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 10.0, "mutations": ["aa:orf1a:T2277I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.190": {"nsamples": 66, "lastcoldate": "2020-07-11", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 9.863636363636363, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q2425K", "aa:S:D614G"]}, "B.1.110": {"nsamples": 175, "lastcoldate": "2020-07-27", "residual": 0.8557674188712177, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 8.205714285714286, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:E352K"]}, "B.1.1.307": {"nsamples": 263, "lastcoldate": "2021-01-29", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 12.61977186311787, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:M315I", "aa:orf1a:M3934I"]}, "B.1.1.277": {"nsamples": 1057, "lastcoldate": "2021-04-17", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 18.43803216650899, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:K2029N", "aa:orf1b:D729Y", "aa:S:A626S"]}, "B.1.1.220": {"nsamples": 296, "lastcoldate": "2021-05-23", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 20.875, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.450": {"nsamples": 44, "lastcoldate": "2021-02-20", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 11.568181818181818, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K1447N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.44": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2020-03-24", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 6, "mean_ndiffs": 5.333333333333333, "mutations": ["aa:orf1b:P1936S", "aa:orf3a:G251V", "aa:orf1a:P927L", "aa:orf1b:T1173I"]}, "B.1.83": {"nsamples": 63, "lastcoldate": "2020-05-09", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 8.063492063492063, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.371": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2021-04-07", "residual": -0.4023850102372102, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 17.23076923076923, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:T132I", "aa:orf1b:P218L", "aa:orf1b:S997P", "aa:N:T362I"]}, "B.1.9.5": {"nsamples": 115, "lastcoldate": "2021-02-25", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 15.495652173913044, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1408L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "A.11": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2020-08-20", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 10.142857142857142, "mutations": ["aa:orf8:L84S", "aa:N:S202N", "aa:orf1a:L681F"]}, "B.1.607": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-12-07", "residual": -0.4817489853776507, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 9.692307692307692, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D936Y", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.114": {"nsamples": 4, "lastcoldate": "2020-05-12", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 9.75, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:M109I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.363": {"nsamples": 71, "lastcoldate": "2021-03-24", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 14.070422535211268, "mutations": ["aa:orf1a:Y1734H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:R21I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:R847K", "aa:orf1a:D75G", "aa:orf1a:C2041Y", "aa:orf3a:K136N", "aa:orf3a:N137Y"]}, "B.1.1.249": {"nsamples": 3, "lastcoldate": "2020-04-07", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 10.666666666666666, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1814F", "aa:S:P251L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.49": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-08-07", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 11.727272727272727, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:A119S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.154": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2020-06-11", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.416666666666666, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1717A", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.254": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2020-05-09", "residual": 0.08780424778246201, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 9.076923076923077, "mutations": ["aa:orf1a:N3537D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L", "aa:M:I52T", "aa:orf3a:T175I"]}, "B.1.1.14": {"nsamples": 41, "lastcoldate": "2020-06-27", "residual": -0.2366543563678146, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 10.146341463414634, "mutations": ["aa:orf1a:S279F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:K136E", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A2249V"]}, "B.1.1.43": {"nsamples": 42, "lastcoldate": "2020-05-25", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 9.30952380952381, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:W31C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.215": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2020-08-06", "residual": 1.38563866446111, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 6.666666666666667, "mutations": ["aa:orf1a:S1189N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.268": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2020-08-06", "residual": -1.1703481812484242, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 14.214285714285714, "mutations": ["aa:orf1b:P103S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:I785V", "aa:orf1a:M3627I", "aa:orf1b:T2336I"]}, "B.1.1.208": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2020-06-14", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.11111111111111, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.559": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-04-21", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 8.11111111111111, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1271L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L"]}, "B.1.248": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2020-05-19", "residual": 0.4519448395805005, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 8.28, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L", "aa:N:S190G", "aa:orf1a:E1142K", "aa:orf1a:L3799I"]}, "B.1.1.25": {"nsamples": 1109, "lastcoldate": "2021-05-06", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 16.26961226330027, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:I300F"]}, "B.1.1.3": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2020-07-03", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 13.862068965517242, "mutations": ["aa:orf1a:T3058I", "aa:orf1a:A3333T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:T478I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.197": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-05-27", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 9.272727272727273, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:N1047S", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.124": {"nsamples": 110, "lastcoldate": "2020-12-08", "residual": -1.0909842061079837, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 9.936363636363636, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P970L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.26": {"nsamples": 169, "lastcoldate": "2020-08-17", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 11.420118343195266, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1116I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.16": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-12-10", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 15.75, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A892S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.210": {"nsamples": 327, "lastcoldate": "2021-02-09", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 11.782874617737003, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.110.1": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-10-16", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.777777777777779, "mutations": ["aa:orf1a:E352K", "aa:orf1a:G894S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "del:508:15", "aa:orf1a:T512I", "aa:orf1b:R1315C", "aa:N:P199S"]}, "B.1.284": {"nsamples": 49, "lastcoldate": "2020-10-17", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.061224489795919, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L", "aa:orf1a:P927L", "aa:orf1b:A440V", "aa:S:T572I"]}, "B.1.276": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2020-07-20", "residual": -0.766525601957707, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 11.5625, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:T3579I", "aa:orf8:S67F", "aa:N:H145Y"]}, "B.1.572": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-07-13", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 11.166666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L1556I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.424": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2020-06-03", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 10.533333333333333, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G572E", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.149": {"nsamples": 63, "lastcoldate": "2021-04-08", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 18.396825396825395, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1127Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S171L", "aa:orf3a:G224V"]}, "B.4.1": {"nsamples": 27, "lastcoldate": "2020-04-26", "residual": -0.766525601957707, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 9.481481481481481, "mutations": ["aa:orf1a:R207C", "aa:orf1a:V378I", "del:3333:3", "aa:orf1a:M2796I", "aa:orf1b:A1225D"]}, "B.1.36.8": {"nsamples": 705, "lastcoldate": "2021-05-27", "residual": 1.021498072740613, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 18.09645390070922, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "B.1.145": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2021-02-03", "residual": -1.4948067853987008, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 10.4, "mutations": ["aa:orf1a:S1534I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L320I", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.366": {"nsamples": 56, "lastcoldate": "2020-06-29", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 13.107142857142858, "mutations": ["aa:orf1a:D1036E", "aa:orf1a:L3644F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:D103Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.4.2": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2020-04-08", "residual": -0.3627030226669899, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 7.833333333333333, "mutations": ["aa:orf1a:V378I", "aa:orf1a:G661S", "aa:orf1a:A2994V"]}, "B.56": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2020-07-06", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 7, "mean_ndiffs": 3.96, "mutations": ["aa:orf1b:A390V"]}, "B.50": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-06-14", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 6, "mean_ndiffs": 3.888888888888889, "mutations": []}, "B.1.112": {"nsamples": 81, "lastcoldate": "2020-08-11", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 9.777777777777779, "mutations": ["aa:orf1a:S2083R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:E1192D"]}, "B.1.3": {"nsamples": 197, "lastcoldate": "2021-02-11", "residual": 0.048122260289783364, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 14.197969543147208, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:Q675R", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.359": {"nsamples": 23, "lastcoldate": "2020-09-11", "residual": 1.140544035451274, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 9.91304347826087, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:A35S"]}, "B.6.1": {"nsamples": 36, "lastcoldate": "2020-05-04", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 6.916666666666667, "mutations": ["aa:orf1a:T2016K", "aa:orf1b:A88V", "aa:N:P13L"]}, "B.6.4": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2020-07-29", "residual": 1.3062746893206696, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.285714285714286, "mutations": ["aa:orf1a:S2015R", "aa:orf1a:T2016K", "aa:orf1b:A88V", "aa:N:P13L"]}, "B.6.7": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2020-11-25", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 8.709677419354838, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.13": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2020-04-17", "residual": 1.6704152810411665, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 6.526315789473684, "mutations": ["aa:orf1a:I1525V"]}, "B.1.14": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-05-01", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 4, "mean_ndiffs": 2.8333333333333335, "mutations": ["aa:orf1a:A2033V"]}, "B.20": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-04-13", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 3, "mean_ndiffs": 2.05, "mutations": ["aa:orf1a:A76T"]}, "B.19": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2020-04-20", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 5, "mean_ndiffs": 2.8, "mutations": ["aa:orf1a:L3338F"]}, "B.1.119": {"nsamples": 51, "lastcoldate": "2020-09-17", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 7.1568627450980395, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.426": {"nsamples": 421, "lastcoldate": "2021-05-14", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 14.365795724465558, "mutations": ["aa:orf1a:F190L", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D253G", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.199": {"nsamples": 84, "lastcoldate": "2021-02-07", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 10.988095238095237, "mutations": ["aa:orf1a:P892S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.137": {"nsamples": 48, "lastcoldate": "2020-06-18", "residual": -1.4551247978284805, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 8.958333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:V1085F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf10:*39Q"]}, "B.1.1.70": {"nsamples": 1968, "lastcoldate": "2021-05-21", "residual": 0.5313088146433994, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 21.202235772357724, "mutations": ["aa:orf1a:G3334S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2084I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.263": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2020-05-11", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 8.941176470588236, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:H2092Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.46": {"nsamples": 44, "lastcoldate": "2020-05-13", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 7, "mean_ndiffs": 4.318181818181818, "mutations": ["aa:orf1a:I4098V", "aa:orf3a:T175I", "aa:orf6:D53G"]}, "B.1.1.350": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2020-06-16", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 10.583333333333334, "mutations": ["aa:orf1b:A37S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:L147F"]}, "B.1.470": {"nsamples": 499, "lastcoldate": "2021-05-11", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 23.03607214428858, "mutations": ["aa:orf1b:P218L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S220I", "aa:orf7b:E39*", "aa:N:T205I", "aa:orf1a:L397V", "aa:orf3a:D155H", "del:11288:9"]}, "C.14": {"nsamples": 120, "lastcoldate": "2021-02-10", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 17.333333333333332, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.214": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2021-04-17", "residual": 1.3062746893206696, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 21.137931034482758, "mutations": ["aa:orf1a:I1398V", "aa:orf1a:T1881I", "aa:orf1a:A4016V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.84": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2020-07-28", "residual": 0.37258086444005994, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 11.166666666666666, "mutations": ["aa:orf1b:I162V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.260": {"nsamples": 88, "lastcoldate": "2021-02-24", "residual": -1.0909842061079837, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 8.113636363636363, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.471": {"nsamples": 264, "lastcoldate": "2021-03-24", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 16.428030303030305, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:R209I", "aa:orf1b:K2579N"]}, "B.1.161": {"nsamples": 38, "lastcoldate": "2020-06-04", "residual": 1.38563866446111, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 10.868421052631579, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.134": {"nsamples": 144, "lastcoldate": "2020-08-28", "residual": 1.3459566768908897, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 7.722222222222222, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D2505N", "aa:S:D614G"]}, "B.1.245": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2020-08-21", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 10.380952380952381, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K469N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.243": {"nsamples": 7068, "lastcoldate": "2021-05-04", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 52, "mean_ndiffs": 17.212507074136955, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:S:P681H"]}, "B.1.400": {"nsamples": 1008, "lastcoldate": "2021-03-30", "residual": 0.6970394685903366, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 17.96527777777778, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A2168T", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:V306F", "aa:orf1a:P3359L", "aa:orf1a:V3892I"]}, "B.1.558": {"nsamples": 102, "lastcoldate": "2021-03-23", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 17.92156862745098, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.358": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2020-05-04", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 8.842105263157896, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T346I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S180I"]}, "B.1.523": {"nsamples": 219, "lastcoldate": "2021-03-10", "residual": -0.4817489853776507, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 19.19634703196347, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:orf7a:S81P"]}, "B.1.468": {"nsamples": 110, "lastcoldate": "2021-04-27", "residual": 0.6106727897062983, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 18.29090909090909, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:A876T", "aa:orf1a:L2062F", "aa:orf8:V62L"]}, "B.1.360": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2020-10-26", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 9.758620689655173, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7b:S31L"]}, "B.1.1.166": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2021-03-12", "residual": -0.4817489853776507, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 13.923076923076923, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.274": {"nsamples": 114, "lastcoldate": "2021-04-13", "residual": 1.6704152810411665, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 18.67543859649123, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G174C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.285": {"nsamples": 119, "lastcoldate": "2021-03-20", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 10.789915966386555, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.418": {"nsamples": 51, "lastcoldate": "2020-06-25", "residual": -0.8855715646683678, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 7.666666666666667, "mutations": ["aa:orf1a:S2517F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.232": {"nsamples": 851, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 19.35370152761457, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:V32L", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:C1847R", "aa:orf1a:P1862S", "aa:orf1a:T2007I"]}, "B.1.1.134": {"nsamples": 34, "lastcoldate": "2021-04-14", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 12.411764705882353, "mutations": ["aa:orf1a:T2106I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.13": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2021-02-15", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 11.857142857142858, "mutations": ["aa:orf1a:K1315Q", "aa:orf1a:Q3859H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.379": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-04-24", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 8, "mean_ndiffs": 6.3076923076923075, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:R214L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.81": {"nsamples": 23, "lastcoldate": "2021-03-16", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 6.869565217391305, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.270": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2020-06-25", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 11.666666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:Q455H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:L96F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.167": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2021-02-26", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 9.555555555555555, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L1683F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.229": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2020-09-08", "residual": -0.4817489853776507, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 9.644444444444444, "mutations": ["aa:orf1a:K2511N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.83": {"nsamples": 168, "lastcoldate": "2021-03-17", "residual": 0.16716822292290257, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 10.678571428571429, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.55": {"nsamples": 34, "lastcoldate": "2020-06-26", "residual": 1.3062746893206696, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 13.088235294117647, "mutations": ["aa:orf1a:E754A", "aa:orf1a:A3392V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:S1252P", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:Q1208H"]}, "B.1.1.256": {"nsamples": 51, "lastcoldate": "2020-07-03", "residual": 0.3328988768698397, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 13.529411764705882, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T151I", "aa:orf8:A65V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.268": {"nsamples": 84, "lastcoldate": "2020-05-02", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 7.357142857142857, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:E1209D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.503": {"nsamples": 178, "lastcoldate": "2021-02-06", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 13.573033707865168, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:Q185H"]}, "B.1.1.122": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2021-02-15", "residual": -1.4551247978284805, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 11.222222222222221, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:T20I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf8:G66V"]}, "C.27": {"nsamples": 36, "lastcoldate": "2020-07-04", "residual": 1.2665927017504492, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 16.916666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:I186V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:T2432I", "aa:orf3a:G254*"]}, "B.1.247": {"nsamples": 41, "lastcoldate": "2020-07-14", "residual": 0.008440272719563092, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 12.560975609756097, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.496": {"nsamples": 4, "lastcoldate": "2020-05-28", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 12.75, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:A134V", "aa:N:R195I"]}, "B.1.334": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2020-09-14", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 14.205128205128204, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S190G", "aa:N:P383L", "aa:orf1a:Q3777R", "aa:orf1b:A373V", "aa:orf3a:G49S", "aa:N:G179S"]}, "B.1.453": {"nsamples": 151, "lastcoldate": "2021-02-08", "residual": 0.49162682715072076, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 11.105960264900663, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.598": {"nsamples": 38, "lastcoldate": "2020-05-26", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 10.026315789473685, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E1288D", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T24I", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.499": {"nsamples": 581, "lastcoldate": "2021-04-23", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 15.060240963855422, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S197L"]}, "B.1.552": {"nsamples": 58, "lastcoldate": "2021-04-27", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 11.948275862068966, "mutations": ["aa:orf1a:D1547Y", "aa:orf1a:M1647I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:T859I", "aa:S:P1263L", "aa:S:D614G"]}, "A.15": {"nsamples": 60, "lastcoldate": "2020-08-10", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 16.816666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:M3655I", "aa:orf1b:P1727L", "aa:orf8:L84S", "aa:orf8:E92K", "aa:N:S202N", "aa:orf1a:P748L", "aa:orf1b:D2179Y", "aa:S:D1084Y"]}, "N.4": {"nsamples": 187, "lastcoldate": "2021-02-21", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 16.06951871657754, "mutations": ["aa:orf1a:K737R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf6:I33T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T"]}, "B.1.1.360": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2020-04-29", "residual": 1.3459566768908897, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 10.166666666666666, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:R21I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W69L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.82": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-06-16", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 10.272727272727273, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.564": {"nsamples": 1335, "lastcoldate": "2021-03-10", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 17.55880149812734, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S183Y", "aa:orf1a:R1170C"]}, "B.36": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-04-11", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 6.777777777777778, "mutations": ["aa:orf3a:G251V", "aa:orf10:R24C"]}, "B.1.205": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-11-30", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 10.708333333333334, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H604Y", "aa:S:I119V", "aa:S:D614G", "aa:M:D3G", "aa:orf1a:T1881I"]}, "B.1.115": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-09-21", "residual": 0.16716822292290257, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 14.291666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A2344S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:G25C", "aa:S:A706S", "aa:orf3a:G44V", "aa:N:G215V"]}, "B.1.1.50": {"nsamples": 1161, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": -0.4817489853776507, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 23.837209302325583, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W131C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:M657I"]}, "B.1.505": {"nsamples": 179, "lastcoldate": "2021-01-27", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 20.446927374301676, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:A1397V", "aa:E:T9I"]}, "B.1.310": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-04-30", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.76923076923077, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S2430R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:W131L", "aa:orf1b:R1605K"]}, "B.1.1.46": {"nsamples": 129, "lastcoldate": "2021-05-01", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 16.217054263565892, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:S318L"]}, "B.1.420": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2021-02-24", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 12.736842105263158, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:G1073E"]}, "B.1.225": {"nsamples": 49, "lastcoldate": "2020-05-25", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 7.1020408163265305, "mutations": ["aa:orf1a:T4217I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.178": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2020-07-22", "residual": 0.3328988768698397, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 14.142857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:V1295A", "aa:orf1a:K2589R", "aa:orf1a:T4087I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W69C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:6501:3"]}, "B.1.1.149": {"nsamples": 55, "lastcoldate": "2020-11-25", "residual": -1.5344887729689212, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 12.436363636363636, "mutations": ["aa:orf1a:A537S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:R21I", "aa:S:D614G", "aa:orf8:S67F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:29789:2"]}, "B.1.1.74": {"nsamples": 204, "lastcoldate": "2021-02-17", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 15.073529411764707, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:G993S", "aa:orf1a:E2619Q", "aa:orf8:E64*"]}, "B.1.256": {"nsamples": 33, "lastcoldate": "2020-06-01", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.333333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:A1049V", "aa:orf1a:P1207L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:S:D614G"]}, "B.1.168": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2020-05-19", "residual": -0.8855715646683678, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 9.838709677419354, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S2517P", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M1582I", "aa:orf1b:Y1784C", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.355": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2020-07-13", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 13.311111111111112, "mutations": ["aa:orf1a:V2356A", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:G30A", "aa:N:R191L"]}, "B.1.415": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2020-12-20", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 10.130434782608695, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.162": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2021-01-14", "residual": 0.16716822292290257, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 11.0, "mutations": ["aa:orf1a:H1113Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.127": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2020-09-24", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 10.933333333333334, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.36.16": {"nsamples": 284, "lastcoldate": "2021-05-29", "residual": 0.9421340976001726, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 16.119718309859156, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "B.1.324": {"nsamples": 258, "lastcoldate": "2021-04-25", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 14.321705426356589, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S206F"]}, "C.10": {"nsamples": 3, "lastcoldate": "2020-05-08", "residual": 0.9818160851703929, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 16.0, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:K2143R", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.306": {"nsamples": 1438, "lastcoldate": "2021-04-10", "residual": 0.7367214561605568, "max_ndiffs": 48, "mean_ndiffs": 16.319888734353267, "mutations": ["aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.261": {"nsamples": 91, "lastcoldate": "2020-09-08", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 13.703296703296703, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:E:S68F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:T205I"]}, "B.1.1.462": {"nsamples": 104, "lastcoldate": "2021-03-20", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 11.711538461538462, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:E583D", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.91": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2020-07-14", "residual": -1.2100301688186446, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 13.2, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.311": {"nsamples": 1901, "lastcoldate": "2021-05-09", "residual": 0.7367214561605568, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 19.27774855339295, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:P207L", "aa:orf1a:T4087I", "aa:orf1b:V1905L", "aa:N:Q9H", "aa:N:T135I", "aa:N:T391I"]}, "B.1.442": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-12-21", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 11.0, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A23S", "aa:orf3a:V55F", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:A65S"]}, "B.1.491": {"nsamples": 3, "lastcoldate": "2020-05-21", "residual": 0.617675493449896, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 13.333333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:Q946H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D936Y", "aa:orf3a:Q57H", "aa:E:R69I", "aa:M:T7I", "aa:orf8:D75V"]}, "B.1.1.296": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 13.115384615384615, "mutations": ["aa:orf1a:K399R", "aa:orf1a:T1822I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:M2025I"]}, "B.1.1.409": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2020-10-27", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 9.717948717948717, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:I4114V"]}, "B.1.1.88": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2021-02-26", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 11.11111111111111, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:L90F", "aa:M:L124F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.422": {"nsamples": 359, "lastcoldate": "2020-09-28", "residual": 0.16716822292290257, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 12.35933147632312, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:R32H", "aa:orf1b:L605F"]}, "A.17": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-03-28", "residual": 0.8557674188712177, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 8.9, "mutations": ["aa:orf3a:L53F", "aa:orf3a:Q116H", "aa:orf3a:Q185H", "aa:orf8:L84S"]}, "B.1.1.101": {"nsamples": 65, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 16.815384615384616, "mutations": ["aa:orf1a:Q2702H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:D371V", "aa:orf1a:V3718F"]}, "B.1.435": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2020-06-15", "residual": -1.4551247978284805, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 10.827586206896552, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T1538I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "L.2": {"nsamples": 62, "lastcoldate": "2020-09-21", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 12.806451612903226, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.219": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2020-08-17", "residual": -0.766525601957707, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 12.326086956521738, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P909L", "aa:S:E281V", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.339": {"nsamples": 80, "lastcoldate": "2020-12-26", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 12.125, "mutations": ["aa:orf1a:A2529V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:I870V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.258": {"nsamples": 8919, "lastcoldate": "2021-05-12", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 23.855813431999103, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6"]}, "B.1.408": {"nsamples": 137, "lastcoldate": "2021-04-01", "residual": -0.6404769356585318, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 19.335766423357665, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:N:T393I", "aa:orf1a:V757F", "aa:orf3a:T223N", "aa:N:M210I"]}, "B.1.1.57": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2021-01-22", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 13.64864864864865, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P2256L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.540": {"nsamples": 59, "lastcoldate": "2021-03-15", "residual": 1.38563866446111, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 14.457627118644067, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:E110*"]}, "A.9": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2020-05-24", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 9.352941176470589, "mutations": ["aa:orf8:L84S", "aa:N:S202N"]}, "B.1.1.317": {"nsamples": 1461, "lastcoldate": "2021-05-20", "residual": 1.38563866446111, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 22.09034907597536, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:A211V", "aa:orf1a:D589G", "aa:orf1a:K2533R", "aa:S:Q675R", "aa:S:A522S", "aa:orf1a:D203N", "aa:orf1a:S2396I", "aa:S:D138Y", "aa:S:S477N", "aa:S:A845S"]}, "A.7": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-05-10", "residual": 1.5513693183305055, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 8.5, "mutations": ["aa:orf8:L84S", "aa:N:G18V", "aa:N:S202N"]}, "B.1.1.388": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2021-01-27", "residual": 0.6573574810201163, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 14.666666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:P1921S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1404M", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.545": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-11-21", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 8.875, "mutations": ["aa:orf1a:L642F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "D.2": {"nsamples": 8698, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 14.959990802483329, "mutations": ["aa:orf1a:I300F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.164": {"nsamples": 55, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": 1.226910714180229, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 13.854545454545455, "mutations": ["aa:orf1a:N313D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:T4083M", "aa:N:R203K"]}, "B.1.1.99": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2021-05-24", "residual": 0.41226285201028023, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 13.473684210526315, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:P38S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.431": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-05-15", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 8.375, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:A88V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.9.1": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-05-18", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 12.4, "mutations": ["aa:orf1b:A241V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1408L", "aa:S:D614G", "aa:S:F1121L", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.279": {"nsamples": 598, "lastcoldate": "2020-12-18", "residual": 0.16716822292290257, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.471571906354516, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1798S", "aa:S:R21I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A385V", "aa:orf1a:A1298V", "aa:orf1a:P2685T", "aa:M:L17I"]}, "B.1.1.419": {"nsamples": 102, "lastcoldate": "2021-05-13", "residual": -0.11760839365715378, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 17.50980392156863, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf8:D35Y"]}, "B.1.117": {"nsamples": 49, "lastcoldate": "2020-05-16", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.510204081632653, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T568I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:G179C", "aa:N:K387N"]}, "B.1.1.27": {"nsamples": 159, "lastcoldate": "2020-12-26", "residual": 0.16716822292290257, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 12.849056603773585, "mutations": ["aa:orf1a:G3334S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "A.22": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-05-19", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 8.692307692307692, "mutations": ["aa:orf1a:T945N", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S202N"]}, "B.1.1.201": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2020-10-18", "residual": 1.2665927017504492, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 13.625, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.340": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2020-08-19", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 12.5, "mutations": ["aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1a:A3143V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.441": {"nsamples": 62, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 16.532258064516128, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:L139F", "aa:N:S194L"]}, "B.1.241": {"nsamples": 667, "lastcoldate": "2021-05-19", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 19.071964017991004, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.267": {"nsamples": 33, "lastcoldate": "2020-08-12", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 11.666666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:I2663V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:T3032I", "aa:S:C1250F"]}, "B.1.528": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2020-05-05", "residual": 0.048122260289783364, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 9.428571428571429, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1681F", "aa:S:D614G"]}, "B.1.198": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-07-21", "residual": 1.6307332934709462, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 9.5, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q1867K", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.171": {"nsamples": 157, "lastcoldate": "2020-12-23", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 11.80891719745223, "mutations": ["aa:orf1a:S391F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:E57G"]}, "B.1.1.168": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2020-11-21", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 14.206896551724139, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:M177I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:P971L"]}, "B.1.1.482": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2020-09-17", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 11.125, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:H125Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.103": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-05-22", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 6.8, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:G18C"]}, "B.1.110.3": {"nsamples": 426, "lastcoldate": "2021-05-03", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 19.856807511737088, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:G8R", "aa:orf1a:Q4189H", "del:28254:1", "aa:N:S202C", "aa:orf3a:D183N", "aa:N:D377Y"]}, "B.1.567": {"nsamples": 152, "lastcoldate": "2021-05-12", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 19.55921052631579, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R2613H", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L", "aa:N:P199S", "aa:orf1a:T1168I", "aa:orf1a:H2125Q", "aa:orf1a:T2825I"]}, "B.1.390": {"nsamples": 63, "lastcoldate": "2021-02-11", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 9.11111111111111, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R209I"]}, "N.1": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2021-01-06", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 15.052631578947368, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T175I", "aa:orf6:I33T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T", "aa:orf1b:P1727L"]}, "B.1.479": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2020-05-26", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 8.071428571428571, "mutations": ["aa:orf1a:A3456S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.473": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-05-22", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 8.375, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:S:D138Y", "aa:S:P521R"]}, "B.1.1.282": {"nsamples": 79, "lastcoldate": "2021-04-26", "residual": -1.0909842061079837, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 13.810126582278482, "mutations": ["aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.125": {"nsamples": 73, "lastcoldate": "2020-07-22", "residual": 1.1872287266875503, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 9.136986301369863, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.194": {"nsamples": 106, "lastcoldate": "2021-05-03", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 13.056603773584905, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:K1073N", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.37": {"nsamples": 3697, "lastcoldate": "2021-05-17", "residual": 1.3062746893206696, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 15.202055720854746, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:A647S"]}, "B.1.173": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2020-07-01", "residual": -0.9649355398088084, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 9.5625, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.294": {"nsamples": 397, "lastcoldate": "2021-05-07", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 20.277078085642316, "mutations": ["aa:orf1a:D1036E", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.200": {"nsamples": 89, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": 0.4519448395805005, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 9.426966292134832, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:V1211F"]}, "B.1.1.221": {"nsamples": 73, "lastcoldate": "2020-12-12", "residual": -0.4817489853776507, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 16.684931506849313, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:P3395L", "aa:orf1a:M3934T", "aa:orf3a:Y107H", "aa:orf8:V81F"]}, "B.1.1.438": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2020-11-12", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 11.11111111111111, "mutations": ["aa:orf1a:E386K", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.485": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2020-05-22", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 7.6875, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.515": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2020-05-29", "residual": -1.1703481812484242, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 9.772727272727273, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:S698L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:S:T22N"]}, "B.1.595.4": {"nsamples": 132, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 13.181818181818182, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A516V", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L", "aa:orf1a:P1921S"]}, "B.1.116": {"nsamples": 84, "lastcoldate": "2020-05-23", "residual": -0.4817489853776507, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.380952380952381, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:P1158S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:Y264C", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.222": {"nsamples": 1982, "lastcoldate": "2021-05-12", "residual": 0.7367214561605568, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 20.988395560040363, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:T732A", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.291": {"nsamples": 1037, "lastcoldate": "2021-04-02", "residual": -0.27633634393803486, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 14.433944069431051, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:E1167D"]}, "B.1.495": {"nsamples": 84, "lastcoldate": "2020-08-17", "residual": 0.37258086444005994, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 11.964285714285714, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:P25L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:W45L"]}, "B.1.592": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2020-05-07", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 12.368421052631579, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:P1541S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M454I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.270": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2020-06-23", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 8.928571428571429, "mutations": ["aa:orf1a:P885L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.181": {"nsamples": 58, "lastcoldate": "2020-06-22", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 12.10344827586207, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.47": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2020-05-27", "residual": 0.5313088146433994, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 3.642857142857143, "mutations": ["del:1605:3", "aa:orf1a:K3573E", "aa:orf1a:G3846S"]}, "B.1.1.161": {"nsamples": 80, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": -1.011620230967543, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 8.9625, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.48": {"nsamples": 312, "lastcoldate": "2020-12-30", "residual": 1.38563866446111, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 10.51602564102564, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:V70I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.405": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2021-02-18", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 17.272727272727273, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:S911F", "aa:orf1a:M3669I", "aa:orf1a:T3750I", "aa:orf10:V32L"]}, "B.1.349": {"nsamples": 740, "lastcoldate": "2021-03-23", "residual": 1.38563866446111, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 16.758108108108107, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:T781I", "aa:N:P207S"]}, "B.1.1.186": {"nsamples": 200, "lastcoldate": "2021-03-01", "residual": -0.2366543563678146, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 16.56, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A1283V", "aa:S:D138H", "aa:orf1a:T1881I", "aa:orf1a:A1043V", "aa:orf3a:S60Y"]}, "B.1.1.113": {"nsamples": 47, "lastcoldate": "2021-03-31", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 11.574468085106384, "mutations": ["aa:orf1a:M3695V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.315": {"nsamples": 40, "lastcoldate": "2020-08-19", "residual": 0.41226285201028023, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 10.475, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:N856S", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.175": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-06-20", "residual": 1.2665927017504492, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 13.5, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:N211Y", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T1496I"]}, "B.1.1.383": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2020-09-04", "residual": -1.5741707605391415, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 12.142857142857142, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1666L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.40": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2020-09-09", "residual": 0.6573574810201163, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 12.473684210526315, "mutations": ["aa:orf1b:T310I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.381": {"nsamples": 61, "lastcoldate": "2020-12-21", "residual": 0.6970394685903366, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 13.540983606557377, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.448": {"nsamples": 224, "lastcoldate": "2020-12-29", "residual": 0.9024521100299524, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 13.714285714285714, "mutations": ["aa:orf1a:Y4080H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:R126S"]}, "B.1.1.56": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-11-04", "residual": 1.1872287266875503, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 14.416666666666666, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:G769V", "aa:S:A1078S"]}, "B.1.237": {"nsamples": 103, "lastcoldate": "2020-12-17", "residual": -0.8855715646683678, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 14.815533980582524, "mutations": ["aa:orf1a:E633D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.386": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-09-26", "residual": -0.3953823064936125, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 15.25, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V121L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.117": {"nsamples": 48, "lastcoldate": "2021-04-07", "residual": 1.3459566768908897, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 12.6875, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A688V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.459": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2021-02-03", "residual": 1.2665927017504492, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 15.9375, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K2557R", "aa:S:D614G", "aa:S:A846V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.273": {"nsamples": 120, "lastcoldate": "2020-11-16", "residual": 0.8627701225372737, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 14.391666666666667, "mutations": ["aa:orf1a:R2267G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.165": {"nsamples": 34, "lastcoldate": "2020-06-10", "residual": 0.008440272719563092, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 8.764705882352942, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A2529V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P2256S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.9.2": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-07-13", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 14.4, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1408L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:G465D", "aa:orf1a:I1525V"]}, "B.1.180": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-09-03", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 10.75, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.464": {"nsamples": 406, "lastcoldate": "2021-04-02", "residual": -0.8458895770981476, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 17.810344827586206, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:L590F", "aa:orf1a:C433R"]}, "B.1.336": {"nsamples": 207, "lastcoldate": "2021-05-16", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 14.70048309178744, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.163": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-07-22", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 10.685714285714285, "mutations": ["aa:orf1a:V3510F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:S:I1172V", "aa:orf3a:V90L", "aa:orf7a:V74I"]}, "B.1.589": {"nsamples": 75, "lastcoldate": "2020-08-28", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 12.893333333333333, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1a:L4037F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.113": {"nsamples": 61, "lastcoldate": "2020-06-20", "residual": -0.7198409107214307, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 14.459016393442623, "mutations": ["aa:orf1a:Q676P", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1701F", "aa:S:L54F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.458": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2021-02-23", "residual": 0.9024521100299524, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 15.941176470588236, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K2557R", "aa:S:D614G", "aa:N:G34W", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.159": {"nsamples": 52, "lastcoldate": "2020-08-28", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 11.884615384615385, "mutations": ["aa:orf1a:Q2702H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1b:D870Y", "aa:orf1b:E1242A"]}, "B.1.1.119": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-05-05", "residual": 0.6970394685903366, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 9.307692307692308, "mutations": ["aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.395": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-05-18", "residual": 0.3328988768698397, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.88888888888889, "mutations": ["aa:orf1a:K1817N", "aa:orf1a:T2836I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.535": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2020-04-26", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 7.4, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.500": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2021-01-23", "residual": -1.4551247978284805, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 16.84375, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:P804S", "aa:orf1b:S1089L"]}, "B.1.520": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2021-02-24", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 11.846153846153847, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G445V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S202I"]}, "B.1.458": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-05-25", "residual": 0.8627701225372737, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 12.0, "mutations": ["aa:orf1a:D1089Y", "aa:orf1a:I2490T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:V213A", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.326": {"nsamples": 376, "lastcoldate": "2021-03-18", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 15.61968085106383, "mutations": ["aa:orf1a:S2103F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L46F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.548": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2020-08-03", "residual": 0.5383115183869971, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 12.588235294117647, "mutations": ["aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:A3143V"]}, "B.1.126": {"nsamples": 131, "lastcoldate": "2021-03-29", "residual": -0.9252535522385882, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 16.671755725190838, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D215Y", "aa:S:D614G", "aa:N:S194A", "aa:orf1b:T2084I"]}, "B.1.238": {"nsamples": 56, "lastcoldate": "2020-07-23", "residual": 0.9024521100299524, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 10.0, "mutations": ["aa:orf1a:A4357V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.95": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2021-01-13", "residual": -0.07092370234333584, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 11.117647058823529, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.253": {"nsamples": 288, "lastcoldate": "2020-12-30", "residual": -1.2497121563888647, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 15.493055555555555, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A3620V", "aa:orf1b:T794I", "aa:orf3a:S166L", "aa:orf1b:S442I"]}, "B.1.1.29": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2020-06-15", "residual": 1.3062746893206696, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 17.72222222222222, "mutations": ["aa:orf1a:A656V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S37P", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf7b:T40I", "del:27879:1", "aa:orf7b:H42L", "del:27882:1", "aa:orf7b:A43V"]}, "B.1.1.379": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2020-06-04", "residual": -0.6007949480883116, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 9.5, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1342S", "aa:S:R21I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.237": {"nsamples": 134, "lastcoldate": "2020-09-08", "residual": 0.25353490180694077, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 11.708955223880597, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:R21I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf7b:C41F", "aa:N:I84V", "aa:orf3a:F207L"]}, "B.1.1.262": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-08-06", "residual": 0.9024521100299524, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 14.208333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:K1230N", "del:6329:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Y91H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:S698L"]}, "B.1.1.255": {"nsamples": 236, "lastcoldate": "2021-02-05", "residual": 1.1872287266875503, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 13.775423728813559, "mutations": ["aa:orf1a:S771C", "aa:orf1a:T1637I", "aa:orf1a:P2046S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.107": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2020-08-27", "residual": -0.11060568991355611, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 10.666666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:A1074D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:L1130F", "aa:orf3a:H78Y"]}, "B.1.1.115": {"nsamples": 88, "lastcoldate": "2021-03-13", "residual": -1.2497121563888647, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 11.045454545454545, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.417": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2020-11-04", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 13.619047619047619, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:S2493I", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:T1022I", "aa:S:S939F"]}, "B.1.504": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2021-01-11", "residual": 0.37258086444005994, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.12, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:L275F"]}, "B.1.1.135": {"nsamples": 139, "lastcoldate": "2021-05-04", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 44, "mean_ndiffs": 14.107913669064748, "mutations": ["aa:orf1a:P3371S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.90": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-07-16", "residual": -1.2893941438815435, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 13.5, "mutations": ["aa:orf1a:T1854I", "aa:orf1a:A3548V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.172": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2020-07-14", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 12.135135135135135, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.224": {"nsamples": 38, "lastcoldate": "2020-05-24", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 8.631578947368421, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:S939F", "aa:N:P344L"]}, "B.1.416": {"nsamples": 336, "lastcoldate": "2021-04-13", "residual": -1.1703481812484242, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 13.87202380952381, "mutations": ["aa:orf1a:L454F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S187L"]}, "B.1.329": {"nsamples": 199, "lastcoldate": "2020-07-04", "residual": -1.2893941438815435, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 8.743718592964823, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.538": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2021-04-02", "residual": -0.9649355398088084, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 16.7, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:A1812D"]}, "B.1.1.217": {"nsamples": 195, "lastcoldate": "2020-11-25", "residual": 0.6573574810201163, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 17.17948717948718, "mutations": ["aa:orf1a:S1102G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:M:A2V", "aa:N:R40C"]}, "B.1.1.301": {"nsamples": 614, "lastcoldate": "2021-02-14", "residual": -0.6801589231512105, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 14.768729641693811, "mutations": ["aa:orf1a:G3334S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "C.3": {"nsamples": 89, "lastcoldate": "2020-07-19", "residual": -1.2893941438815435, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 15.123595505617978, "mutations": ["aa:orf1a:G728C", "aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H1550Y", "aa:S:V213L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.45": {"nsamples": 57, "lastcoldate": "2020-07-02", "residual": 0.25353490180694077, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 9.31578947368421, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S442C", "aa:orf1b:R1315C", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.170": {"nsamples": 71, "lastcoldate": "2021-04-07", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 16.732394366197184, "mutations": ["aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S235F", "aa:orf1b:P314L"]}, "B.1.1.147": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-07-05", "residual": -1.6535347356020402, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 18.555555555555557, "mutations": ["aa:orf1a:S2625F", "aa:orf1a:I3341V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:N185S", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.231": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-07-23", "residual": 0.41226285201028023, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 12.35, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.38": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-07-16", "residual": 0.8627701225372737, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 12.454545454545455, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T3058I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "del:26155:3", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "C.17": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2021-05-06", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 24.0, "mutations": ["aa:orf1a:T4090I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:Q677H", "aa:N:G212V", "aa:orf1a:T1246I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:E102K", "aa:orf1a:D1639N", "aa:orf1a:P2287S", "aa:orf1a:D2980N", "aa:orf1a:D3222N", "aa:orf1b:D1028Y", "aa:S:R346S", "aa:S:L452R"]}, "B.1.36.19": {"nsamples": 67, "lastcoldate": "2021-03-15", "residual": -0.1502876774837764, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 19.074626865671643, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:A65S", "aa:N:S194L", "aa:orf8:A51V", "aa:N:D377Y"]}, "B.1.1.192": {"nsamples": 224, "lastcoldate": "2021-04-18", "residual": 0.16716822292290257, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 16.566964285714285, "mutations": ["aa:orf1a:V1287A", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.283": {"nsamples": 42, "lastcoldate": "2020-07-09", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.333333333333334, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "A.16": {"nsamples": 60, "lastcoldate": "2020-03-29", "residual": -1.2567148600549207, "max_ndiffs": 7, "mean_ndiffs": 4.6, "mutations": ["aa:orf1a:E972K", "aa:orf8:L84S"]}, "B.1.1.189": {"nsamples": 475, "lastcoldate": "2021-04-27", "residual": 1.021498072740613, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 19.623157894736842, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:G519S"]}, "B.1.1.218": {"nsamples": 65, "lastcoldate": "2021-01-07", "residual": 0.2932168892996194, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 18.26153846153846, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:T76I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.136": {"nsamples": 52, "lastcoldate": "2021-03-01", "residual": -0.7198409107214307, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 14.134615384615385, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.313": {"nsamples": 62, "lastcoldate": "2021-05-17", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 13.5, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A498V", "aa:orf1a:P1640S", "aa:orf1a:T4090I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D253G", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.133": {"nsamples": 91, "lastcoldate": "2021-05-03", "residual": -0.766525601957707, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 16.043956043956044, "mutations": ["aa:orf1a:T1567I", "aa:orf1a:N2603D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "D.3": {"nsamples": 119, "lastcoldate": "2020-09-28", "residual": -0.7595228982141093, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.857142857142858, "mutations": ["aa:orf1a:I300F", "aa:orf1a:K2511N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.293": {"nsamples": 40, "lastcoldate": "2021-01-04", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 14.325, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q813H", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1b:A2431V", "aa:N:S180T"]}, "B.1.509": {"nsamples": 615, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": 1.3062746893206696, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 16.008130081300813, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:A65V", "aa:orf1a:H374Y", "aa:orf1a:G993S"]}, "B.1.1.465": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2020-04-24", "residual": 0.048122260289783364, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 11.4, "mutations": ["aa:orf1a:D1036E", "aa:orf1a:L3644F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:orf3a:L15F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.490": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-05-03", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 9.7, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D936Y", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.181": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-07-17", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 8.942857142857143, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:T366R"]}, "B.1.36.10": {"nsamples": 168, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 15.172619047619047, "mutations": ["aa:N:S194L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.466": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2021-02-11", "residual": 0.3328988768698397, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 18.580645161290324, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I", "aa:orf1a:D335N", "aa:orf1a:T3750I", "aa:N:A35V"]}, "B.1.1.54": {"nsamples": 189, "lastcoldate": "2021-04-16", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 14.677248677248677, "mutations": ["aa:orf1a:T2166I", "aa:orf1a:Y4080H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:R126S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.566": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2021-02-11", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 11.3, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.330": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2020-07-17", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.72, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G400S", "aa:orf1a:R2431K", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.399": {"nsamples": 202, "lastcoldate": "2021-02-23", "residual": 0.6573574810201163, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 14.391089108910892, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:N:T205I"]}, "B.1.397": {"nsamples": 81, "lastcoldate": "2021-03-22", "residual": 0.6970394685903366, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 13.481481481481481, "mutations": ["aa:orf1a:K290N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.132": {"nsamples": 65, "lastcoldate": "2021-03-04", "residual": 1.3459566768908897, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 11.03076923076923, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:Q229H"]}, "B.1.405": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2021-03-02", "residual": 0.3328988768698397, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 15.228571428571428, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:E654K", "aa:N:S194L", "aa:orf3a:N119H", "aa:orf1b:I1611V"]}, "B.1.239": {"nsamples": 309, "lastcoldate": "2021-04-14", "residual": 0.9818160851703929, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 15.802588996763754, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1092I", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.576": {"nsamples": 379, "lastcoldate": "2021-03-27", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 13.696569920844327, "mutations": ["aa:orf1a:R24C", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1b:S1391L", "aa:E:P71S"]}, "B.1.556": {"nsamples": 87, "lastcoldate": "2021-02-16", "residual": -0.4350642940638328, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 13.827586206896552, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:N:E367D"]}, "B.1.1.380": {"nsamples": 50, "lastcoldate": "2021-03-31", "residual": 1.1078647515471098, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 13.02, "mutations": ["aa:orf1a:M584V", "aa:orf1a:D2032G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.128": {"nsamples": 63, "lastcoldate": "2021-03-06", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 15.634920634920634, "mutations": ["aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.93": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2020-10-12", "residual": 0.7834061473968331, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 16.566666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T1035I", "aa:orf1a:A3454V", "aa:orf1a:Q3826H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L46F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:28890:12"]}, "B.1.281": {"nsamples": 36, "lastcoldate": "2020-11-16", "residual": 0.41226285201028023, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 13.555555555555555, "mutations": ["aa:orf1a:T891I", "aa:orf1a:Q2702H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.36.36": {"nsamples": 538, "lastcoldate": "2021-02-20", "residual": -0.7198409107214307, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 18.152416356877325, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:V561A", "aa:orf1a:V1291F", "aa:orf1a:T3959I", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:Q7K", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.59": {"nsamples": 131, "lastcoldate": "2020-07-22", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 9.099236641221374, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.275": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2021-01-23", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 14.222222222222221, "mutations": ["aa:orf1a:G989S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.299": {"nsamples": 56, "lastcoldate": "2020-07-15", "residual": 0.25353490180694077, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.892857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:G3334S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:T549A", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.232": {"nsamples": 422, "lastcoldate": "2021-05-09", "residual": 0.4519448395805005, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 15.317535545023697, "mutations": ["aa:orf1a:L758V", "aa:orf1a:V3976F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:S1905F", "aa:orf1a:M3221I", "aa:orf1b:S598I"]}, "B.1.294": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2020-09-22", "residual": 0.7834061473968331, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 12.0, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T2952I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D2666G", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G18S", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.447": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2021-03-02", "residual": -0.9252535522385882, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 13.55, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:E59*", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.304": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2020-09-21", "residual": 0.8230881349670535, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 11.428571428571429, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T1682I", "aa:orf1a:T4010I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S40L", "aa:orf3a:Q57H", "del:29743:6"]}, "B.1.401": {"nsamples": 71, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": -1.368758119021984, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 13.47887323943662, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.344": {"nsamples": 52, "lastcoldate": "2021-02-19", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 16.076923076923077, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:V70F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.508": {"nsamples": 27, "lastcoldate": "2020-08-12", "residual": 0.617675493449896, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 11.0, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:orf1b:S1893F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.58": {"nsamples": 97, "lastcoldate": "2021-04-07", "residual": 0.41226285201028023, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 18.649484536082475, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P2256S", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:V2223L", "aa:orf8:A55T"]}, "C.35": {"nsamples": 852, "lastcoldate": "2021-04-01", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 19.02699530516432, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2089F", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:K1895N", "aa:orf1a:G3278S"]}, "B.1.146": {"nsamples": 134, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": 1.0681827639768895, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 16.02238805970149, "mutations": ["aa:orf1a:A3523V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:G215V"]}, "B.1.1.163": {"nsamples": 90, "lastcoldate": "2021-03-15", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 19.8, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:V3653F"]}, "AE.2": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2020-11-11", "residual": 1.0681827639768895, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 15.5, "mutations": ["aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:V2368F"]}, "AE.4": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2021-03-12", "residual": 1.0681827639768895, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 17.11111111111111, "mutations": ["aa:orf1a:P927L", "aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T3308I", "aa:orf1b:S106A", "aa:orf7a:R118I"]}, "B.1.462": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2021-02-13", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 15.73076923076923, "mutations": ["aa:orf1a:R2115G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.487": {"nsamples": 93, "lastcoldate": "2021-04-06", "residual": -0.766525601957707, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 19.956989247311828, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:I2303V", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:V2624M", "aa:S:T22I", "aa:S:T385I", "aa:S:L452R", "aa:N:G212C"]}, "B.1.301": {"nsamples": 70, "lastcoldate": "2021-04-02", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 12.8, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.106": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2020-08-13", "residual": 0.048122260289783364, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 8.470588235294118, "mutations": ["aa:orf1a:P2605S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.425": {"nsamples": 149, "lastcoldate": "2021-04-23", "residual": 0.617675493449896, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 15.523489932885907, "mutations": ["aa:orf1a:F190L", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:C3147F", "aa:orf1a:M3752I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L", "aa:N:R209K"]}, "B.1.1.84": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-07-30", "residual": -0.7992048857843297, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 10.555555555555555, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A653V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.140": {"nsamples": 51, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": 1.0681827639768895, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 18.45098039215686, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:D3G"]}, "B.1.1.62": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2020-08-06", "residual": 1.0681827639768895, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 12.045454545454545, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H1979Y", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:G18V"]}, "C.1": {"nsamples": 145, "lastcoldate": "2021-05-05", "residual": -0.7198409107214307, "max_ndiffs": 46, "mean_ndiffs": 16.20689655172414, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.456": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2020-11-26", "residual": -1.0839815024419277, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 15.058823529411764, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K2307R", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:T1774I", "aa:S:E154Q", "aa:S:I834V", "aa:S:F490S", "aa:N:A208S", "aa:N:Q389H"]}, "C.9": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2020-10-06", "residual": 0.4192655556763363, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 17.642857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "C.6": {"nsamples": 3, "lastcoldate": "2020-07-20", "residual": 0.4192655556763363, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 16.666666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:K292E"]}, "C.2": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2021-01-11", "residual": 0.4192655556763363, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 21.724137931034484, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:L293S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1609S", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:M657T", "aa:S:N501T", "aa:orf3a:H78Y", "aa:orf10:Q29*"]}, "A.21": {"nsamples": 137, "lastcoldate": "2021-04-09", "residual": -1.4551247978284805, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 23.963503649635037, "mutations": ["aa:orf1a:V3718F", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S202N", "aa:S:D614N", "aa:orf3a:A99S", "aa:orf1a:T1881I", "aa:orf1b:D1572N", "aa:S:R190S", "aa:S:L452R", "aa:orf3a:G224C"]}, "B.1.493": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2020-10-01", "residual": 0.41226285201028023, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 11.666666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:D210Y"]}, "B.1.1.160": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-05-16", "residual": 0.9421340976001726, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 10.0, "mutations": ["aa:orf1a:P3371S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T3665I"]}, "B.1.377": {"nsamples": 118, "lastcoldate": "2021-03-16", "residual": 0.37258086444005994, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 14.533898305084746, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:Q9H", "aa:N:G204R", "aa:N:Q242R"]}, "B.1.1.39": {"nsamples": 1276, "lastcoldate": "2021-04-13", "residual": 0.4192655556763363, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 19.778996865203762, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:V72I", "aa:N:P199S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.47": {"nsamples": 133, "lastcoldate": "2021-03-23", "residual": -1.2497121563888647, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 19.090225563909776, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2099I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.236": {"nsamples": 546, "lastcoldate": "2021-03-23", "residual": -0.11060568991355611, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 16.13919413919414, "mutations": ["aa:orf1a:D4165G", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1609S", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.456": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2021-02-17", "residual": 0.895449406441438, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 19.08108108108108, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:V1287M"]}, "B.6.2": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2020-06-11", "residual": -0.6801589231512105, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.0625, "mutations": ["aa:orf1a:T2016K", "aa:orf1a:T4355I", "aa:orf1b:A88V", "aa:M:L29F", "aa:N:P13L"]}, "B.1.1.44": {"nsamples": 287, "lastcoldate": "2021-05-05", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 15.348432055749129, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:G204V", "aa:orf1a:N1898S", "aa:orf1b:P2612L", "aa:orf1b:R2613S", "aa:orf1b:R2613H", "aa:orf1a:R1464W"]}, "B.1.1.421": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2021-01-13", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 14.5, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:G769V", "aa:S:V1104I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.401": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-06-27", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.9, "mutations": ["aa:orf1a:S2285F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L95F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.269": {"nsamples": 338, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 15.325443786982248, "mutations": ["aa:orf1a:T1597I", "aa:orf1a:M3862I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D1084Y", "aa:M:H125Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:A440V"]}, "B.1.1.410": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-07-18", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 10.846153846153847, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M2414I", "aa:S:D614G", "aa:N:S33I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.485": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2021-02-25", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 16.28, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.430": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2021-01-11", "residual": -1.368758119021984, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 12.5, "mutations": ["aa:orf1a:N1172S", "aa:orf1a:V1295F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.202": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2020-05-24", "residual": 1.226910714180229, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 10.666666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T1240I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q813H", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.242": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-08-02", "residual": 1.392641368127166, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 10.028571428571428, "mutations": ["aa:orf1a:P2046L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A1078S", "aa:N:S194L"]}, "B.1.498": {"nsamples": 41, "lastcoldate": "2020-12-07", "residual": -0.27633634393803486, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 13.048780487804878, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.501": {"nsamples": 65, "lastcoldate": "2020-08-31", "residual": -0.27633634393803486, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 16.676923076923078, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T3398I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:M2259I", "aa:orf1a:L3711I"]}, "B.1.366": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2021-04-16", "residual": -0.27633634393803486, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 15.666666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.205": {"nsamples": 135, "lastcoldate": "2021-05-18", "residual": -0.9649355398088084, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 12.503703703703703, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M2667I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:L2105F"]}, "B.1.1.376": {"nsamples": 101, "lastcoldate": "2021-02-05", "residual": 0.2932168892996194, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 12.485148514851485, "mutations": ["aa:orf1a:S2151G", "aa:orf1a:Q3777H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.537": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2021-02-19", "residual": -1.61385274803182, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 12.125, "mutations": ["aa:orf1a:S2103F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L46F"]}, "B.1.1.412": {"nsamples": 120, "lastcoldate": "2020-12-21", "residual": 0.4192655556763363, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 12.533333333333333, "mutations": ["aa:orf1a:D3728N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.290": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-07-30", "residual": 0.2932168892996194, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 12.314285714285715, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.341": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2020-07-11", "residual": 1.5910513059007259, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 12.821428571428571, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:I4098L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "del:29867:2"]}, "B.1.1.158": {"nsamples": 49, "lastcoldate": "2021-01-13", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 13.551020408163266, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1540I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.594": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2020-06-23", "residual": -1.3290761314517636, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 16.642857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:F190L", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T2532I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:F1214Y", "aa:S:A344S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G49S", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.1.116": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2021-01-04", "residual": -0.1502876774837764, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 14.923076923076923, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1779I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:T2165M"]}, "B.1.554": {"nsamples": 40, "lastcoldate": "2020-08-18", "residual": -1.5344887729689212, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 13.35, "mutations": ["aa:orf1a:E754D", "aa:orf1a:A2388V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:A2V", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.34": {"nsamples": 72, "lastcoldate": "2021-05-21", "residual": 1.226910714180229, "max_ndiffs": 43, "mean_ndiffs": 20.22222222222222, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G1129V", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.263": {"nsamples": 381, "lastcoldate": "2021-04-05", "residual": -0.8855715646683678, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 14.356955380577428, "mutations": ["aa:orf1a:V1887I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.354": {"nsamples": 122, "lastcoldate": "2021-04-30", "residual": 0.379583568106116, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 18.778688524590162, "mutations": ["aa:orf1a:D3042N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D138Y", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:R209I"]}, "B.1.189": {"nsamples": 117, "lastcoldate": "2021-04-20", "residual": 1.6307332934709462, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 15.666666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:V2047F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203M"]}, "B.1.1.63": {"nsamples": 831, "lastcoldate": "2021-03-27", "residual": -1.732898710742481, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 17.18170878459687, "mutations": ["aa:orf1a:A903V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A2282V", "aa:S:S12F", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.300": {"nsamples": 67, "lastcoldate": "2020-07-21", "residual": -1.368758119021984, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.17910447761194, "mutations": ["aa:orf1a:G3334S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.36.22": {"nsamples": 620, "lastcoldate": "2021-05-10", "residual": 1.6307332934709462, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 15.916129032258064, "mutations": ["aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:K2761N", "aa:S:G181V"]}, "B.1.452": {"nsamples": 48, "lastcoldate": "2021-01-06", "residual": -0.6404769356585318, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 12.104166666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:H1113Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1099F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.6.5": {"nsamples": 1, "lastcoldate": "2020-03-19", "residual": -1.37576082268804, "max_ndiffs": 5, "mean_ndiffs": 5.0, "mutations": ["aa:orf1a:T2016K", "aa:orf1b:A88V", "aa:N:P13L"]}, "B.1.451": {"nsamples": 103, "lastcoldate": "2021-03-09", "residual": 1.3062746893206696, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 9.718446601941748, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:T89I"]}, "B.1.9.4": {"nsamples": 104, "lastcoldate": "2021-03-12", "residual": -0.22965165262421694, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 23.875, "mutations": ["aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1a:M3752I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:Q229R", "aa:orf1b:S1408L", "aa:orf1a:A3924V", "aa:orf3a:Q213L", "aa:orf7b:A15S", "aa:N:R209I"]}, "B.1.1.228": {"nsamples": 143, "lastcoldate": "2021-02-16", "residual": -1.5741707605391415, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 17.692307692307693, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E2274G", "aa:S:D614G", "aa:N:P122H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.52": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-08-10", "residual": -1.0442995148717074, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 19.363636363636363, "mutations": ["aa:orf1a:I2873T", "aa:orf1a:L2874I", "aa:orf1b:G16C", "aa:orf1b:G16D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:29867:2"]}, "B.1.169": {"nsamples": 61, "lastcoldate": "2020-08-14", "residual": -0.031241714850657184, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 19.721311475409838, "mutations": ["aa:orf1a:I2873T", "aa:orf1a:L2874I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:orf7a:F87L", "del:29867:2"]}, "B.1.206": {"nsamples": 634, "lastcoldate": "2020-12-14", "residual": -0.521430972947871, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 10.421135646687697, "mutations": ["aa:orf1a:E673K", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1391L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.279": {"nsamples": 1716, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 14.996503496503497, "mutations": ["aa:orf1a:R550C", "aa:orf1a:E755K", "aa:orf1a:T4087I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D2183Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:Y109C"]}, "B.1.574": {"nsamples": 326, "lastcoldate": "2021-01-02", "residual": -1.0442995148717074, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 14.47239263803681, "mutations": ["aa:orf1a:R24C", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:C689G", "aa:orf1a:T2952I", "aa:orf1a:K3978Q", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.77": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2020-08-15", "residual": 1.4720053432676068, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 12.647058823529411, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:E106*", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf8:D34N"]}, "B.1.1.216": {"nsamples": 468, "lastcoldate": "2021-04-05", "residual": 1.5513693183305055, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 20.262820512820515, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.306": {"nsamples": 101, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": -0.7198409107214307, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 16.415841584158414, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:L129F", "aa:N:R209I", "aa:orf1a:A372V", "aa:orf3a:A99V"]}, "B.1.1.244": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2021-02-10", "residual": 1.4323233556973864, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 15.6875, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.437": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2020-09-10", "residual": -0.4350642940638328, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.2, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G345S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "del:28912:6"]}, "B.1.1.180": {"nsamples": 63, "lastcoldate": "2021-02-24", "residual": 1.4323233556973864, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 10.825396825396826, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.595.1": {"nsamples": 126, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": 0.7834061473968331, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 15.34920634920635, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1089L", "aa:orf1b:V2237F", "aa:S:D614G", "aa:S:N1187Y", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.502": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-08-17", "residual": -1.0839815024419277, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 14.272727272727273, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.258": {"nsamples": 196, "lastcoldate": "2021-01-20", "residual": -0.07092370234333584, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 16.489795918367346, "mutations": ["aa:orf1a:K2511N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:I1690V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A143T", "aa:orf7a:S36P", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.233": {"nsamples": 60, "lastcoldate": "2020-11-19", "residual": 0.7834061473968331, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 8.45, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:N:T334K"]}, "B.1.357": {"nsamples": 101, "lastcoldate": "2020-08-17", "residual": 1.1872287266875503, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 12.158415841584159, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:H417Y", "aa:orf1a:P2605S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:V1300A", "aa:orf1b:M1573I"]}, "B.1.582": {"nsamples": 1043, "lastcoldate": "2021-04-10", "residual": -1.004617527301487, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 14.575263662511984, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S190I"]}, "B.1.188": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2020-12-11", "residual": -0.8785688609247703, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 14.564102564102564, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.328": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2020-08-24", "residual": -0.6801589231512105, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 10.533333333333333, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I"]}, "B.1.600": {"nsamples": 76, "lastcoldate": "2021-02-17", "residual": 1.3459566768908897, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 11.105263157894736, "mutations": ["aa:orf1a:T1840I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:P30L"]}, "B.1.340": {"nsamples": 110, "lastcoldate": "2021-03-02", "residual": -0.3557003189233922, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 14.872727272727273, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S674N", "aa:orf1a:E1311G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T148S", "aa:orf1a:Q2563H"]}, "B.1.182": {"nsamples": 87, "lastcoldate": "2020-05-05", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 7.609195402298851, "mutations": ["aa:orf1a:I2010T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.318": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2021-01-27", "residual": -1.4084401065922043, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 16.473684210526315, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:P3371S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:R203G", "aa:N:P364S"]}, "B.1.1.225": {"nsamples": 92, "lastcoldate": "2021-01-15", "residual": -1.4084401065922043, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 14.83695652173913, "mutations": ["aa:orf1a:R184C", "aa:orf1a:A1049V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1662V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L15F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.385": {"nsamples": 54, "lastcoldate": "2020-12-03", "residual": -0.7992048857843297, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.037037037037036, "mutations": ["aa:orf1a:G345S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G18V", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S193I"]}, "B.1.448": {"nsamples": 110, "lastcoldate": "2021-03-09", "residual": 0.6970394685903366, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 16.227272727272727, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M2025I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:M:A2V", "aa:N:S183Y"]}, "B.1.565": {"nsamples": 572, "lastcoldate": "2021-03-30", "residual": -1.732898710742481, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 16.678321678321677, "mutations": ["aa:orf1a:D144A", "aa:orf1a:K1202N", "aa:orf1a:T2007I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P2321L", "aa:S:D614G", "aa:N:S235F"]}, "B.1.542": {"nsamples": 4, "lastcoldate": "2021-02-02", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 12.5, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.400": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2021-01-30", "residual": -0.31601833150825515, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 18.625, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:D295Y", "aa:S:L560Q", "aa:orf3a:G188S", "aa:orf8:E59*", "aa:orf10:Q29*", "aa:orf1a:G298C"]}, "B.1.497": {"nsamples": 2634, "lastcoldate": "2021-05-13", "residual": -0.9252535522385882, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 19.11731207289294, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q2403L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.406": {"nsamples": 100, "lastcoldate": "2021-03-03", "residual": -0.15729038122737404, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 16.24, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:G1251V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:S2900L"]}, "B.1.367": {"nsamples": 501, "lastcoldate": "2021-05-01", "residual": 0.05512496395583941, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 28.998003992015967, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T945I", "aa:orf1a:T1567I", "aa:orf1a:A2994V", "aa:orf1a:Q3346K", "aa:orf1a:V3475F", "aa:orf1a:M3862I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D80Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7a:R80I", "aa:N:S186Y", "aa:N:D377Y", "aa:orf1b:P255T"]}, "B.1.406": {"nsamples": 123, "lastcoldate": "2021-03-26", "residual": -0.8388868733545499, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 15.674796747967479, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D1163Y", "aa:N:S194L"]}, "B.1.177": {"nsamples": 50941, "lastcoldate": "2021-05-26", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 18.70640544944151, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:S:L18F"]}, "B.1.342": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-12-09", "residual": -0.6801589231512105, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 15.3, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:I158V", "aa:orf3a:S177I", "aa:N:T205I"]}, "B.1.227": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2021-02-17", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 14.444444444444445, "mutations": ["aa:orf1a:S2600A", "aa:orf1a:A3518V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V256F", "aa:orf1a:T1854I", "aa:orf1a:T4249I"]}, "B.1.614": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-07-12", "residual": -1.6932167231722606, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 13.375, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:E647D", "aa:orf1a:P2144L", "aa:orf1a:A2345V", "aa:orf1b:T17I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D936Y", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.174": {"nsamples": 141, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": 1.38563866446111, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 13.680851063829786, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.305": {"nsamples": 163, "lastcoldate": "2021-02-07", "residual": 1.3459566768908897, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 16.834355828220858, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.350.1": {"nsamples": 4, "lastcoldate": "2020-06-12", "residual": 0.8627701225372737, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 12.5, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:Q677H", "aa:S:G1219C", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.36.17": {"nsamples": 1425, "lastcoldate": "2021-03-22", "residual": 0.05512496395583941, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 15.154385964912281, "mutations": ["aa:orf1a:V561A", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "B.1.280": {"nsamples": 67, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": 0.7437241598266129, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 14.716417910447761, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1050I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I"]}, "B.1.131": {"nsamples": 85, "lastcoldate": "2021-05-05", "residual": -1.004617527301487, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 20.341176470588234, "mutations": ["aa:orf1a:N449D", "aa:orf1a:L3027F", "aa:orf1a:A4357V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2117L", "aa:S:D614G", "aa:N:T205I"]}, "B.1.527": {"nsamples": 140, "lastcoldate": "2021-04-08", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 16.685714285714287, "mutations": ["aa:orf1a:S2030L", "aa:orf1a:M3221I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:V1025L", "aa:orf1b:D1848Y", "aa:orf3a:Y184H"]}, "B.1.1.243": {"nsamples": 170, "lastcoldate": "2021-04-26", "residual": -0.8855715646683678, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 21.305882352941175, "mutations": ["aa:orf1a:P1692S", "aa:orf1a:N3212T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.516": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2021-02-15", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 17.714285714285715, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2117L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:S171L", "aa:N:M210I"]}, "B.1.1.328": {"nsamples": 43, "lastcoldate": "2021-04-07", "residual": 1.1078647515471098, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 23.906976744186046, "mutations": ["aa:orf1a:A2320T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G224V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:S171L", "aa:orf1a:S2797F", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1a:A3454V", "aa:orf1a:T3750I", "aa:orf1b:L1351F", "aa:orf1b:I1598V"]}, "B.1.1.389": {"nsamples": 138, "lastcoldate": "2021-04-07", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 19.52173913043478, "mutations": ["aa:orf1a:W2769C", "aa:orf1a:P3359S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:T1117I", "aa:N:H145Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.291": {"nsamples": 47, "lastcoldate": "2021-01-22", "residual": -1.3290761314517636, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 13.297872340425531, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S2406L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:L140F"]}, "A.12": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2020-12-11", "residual": -1.4551247978284805, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 15.8, "mutations": ["aa:orf1a:A3518V", "aa:orf1b:P2162S", "aa:E:V62F", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S202N"]}, "B.1.533": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2021-04-21", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 20.25, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.398": {"nsamples": 208, "lastcoldate": "2021-02-15", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 21.134615384615383, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:V1291I", "aa:S:T95I", "aa:orf1a:S2535L", "aa:N:T391I"]}, "B.1.36.9": {"nsamples": 186, "lastcoldate": "2021-02-23", "residual": -1.4948067853987008, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 21.198924731182796, "mutations": ["aa:orf1a:A3220V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:L590F", "aa:orf1a:T753I", "aa:orf1a:T1822I", "aa:orf1a:A3615V", "del:22189:3", "aa:S:T859N"]}, "B.1.1.423": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-09-16", "residual": -0.3557003189233922, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 11.444444444444445, "mutations": ["aa:orf1a:L4037F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:H1101Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:N8I"]}, "B.1.1.441": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2020-11-06", "residual": -0.8855715646683678, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 11.833333333333334, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:A182S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:K120N"]}, "B.1.1.304": {"nsamples": 222, "lastcoldate": "2021-04-04", "residual": -0.31601833150825515, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 14.995495495495495, "mutations": ["aa:orf1a:T224I", "aa:orf1a:Q998H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:A27S"]}, "B.1.362": {"nsamples": 367, "lastcoldate": "2021-04-17", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 20.732970027247955, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:P2046L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "aa:orf3a:W193L", "aa:orf3a:W193*", "aa:orf1b:D2179Y", "aa:S:L452R", "aa:S:L1063F"]}, "B.1.1.4": {"nsamples": 260, "lastcoldate": "2020-10-03", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 17.46923076923077, "mutations": ["aa:orf1a:I4049V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1774I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:P104L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.51": {"nsamples": 455, "lastcoldate": "2021-03-24", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 14.8989010989011, "mutations": ["aa:orf1a:K1305N", "aa:orf1a:L3644F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "AD.2": {"nsamples": 3210, "lastcoldate": "2021-04-26", "residual": -1.2030274650750468, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 20.64485981308411, "mutations": ["aa:orf1a:I300F", "aa:orf1a:P1786L", "aa:orf1b:E245D", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M2025I", "aa:orf1b:T2084I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:A398V"]}, "B.1.221": {"nsamples": 9766, "lastcoldate": "2021-05-21", "residual": 0.20685021049312285, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 20.54525906205202, "mutations": ["aa:orf1a:H1113Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S98F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q38R", "aa:orf3a:G172R", "aa:orf3a:V202L", "aa:N:P199L"]}, "B.1.1.297": {"nsamples": 314, "lastcoldate": "2021-05-12", "residual": 0.05512496395583941, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 15.433121019108281, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q2425H", "aa:S:D614G", "aa:orf8:I10T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T4161N"]}, "B.1.1.444": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2021-02-19", "residual": 0.015442976385619133, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 13.333333333333334, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A688V", "aa:orf8:L95F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.402": {"nsamples": 74, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": 1.392641368127166, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 16.2972972972973, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:T307I", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.437": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2020-11-25", "residual": 1.4323233556973864, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 17.258064516129032, "mutations": ["aa:orf1a:E1614A", "aa:orf1a:G2581S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.265": {"nsamples": 480, "lastcoldate": "2021-04-27", "residual": -1.0513022185377634, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 17.879166666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L", "aa:N:S187L"]}, "B.1.423": {"nsamples": 56, "lastcoldate": "2021-03-31", "residual": 0.4192655556763363, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 19.589285714285715, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G1419C", "aa:orf1a:L4037F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A440V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S171L", "aa:orf8:S24L", "aa:N:A220V", "aa:orf1a:I3108V", "aa:N:D377Y"]}, "B.1.436": {"nsamples": 185, "lastcoldate": "2021-02-22", "residual": 0.7040421722563927, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 11.783783783783784, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S206F", "aa:orf1a:V2116A"]}, "B.1.218": {"nsamples": 155, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": -0.5144282692042733, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 19.75483870967742, "mutations": ["aa:orf1a:D992N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A2623S", "aa:S:D614G", "aa:N:D128N", "aa:N:R203K", "aa:orf1a:M2259I"]}, "B.1.389": {"nsamples": 560, "lastcoldate": "2021-03-15", "residual": 1.233913417846285, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 19.226785714285715, "mutations": ["aa:orf1a:Q2702H", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1643V", "aa:orf1b:K2385N", "aa:orf1b:D2386Y", "aa:orf1b:D2386V", "aa:S:D614G", "aa:S:T723I", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.266": {"nsamples": 75, "lastcoldate": "2020-10-05", "residual": -0.6801589231512105, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 16.36, "mutations": ["aa:orf1a:K1763N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D2142Y", "aa:S:S459Y", "aa:S:D614G", "aa:S:M1229I", "aa:orf3a:G254*", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf7a:H47Y"]}, "B.1.605": {"nsamples": 76, "lastcoldate": "2021-05-08", "residual": -0.6404769356585318, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 17.526315789473685, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:T76I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:T1116N", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf6:M19I", "del:28029:2", "aa:N:T205I"]}, "B.1.1.139": {"nsamples": 36, "lastcoldate": "2020-12-18", "residual": -0.1502876774837764, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 13.88888888888889, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "A.24": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-12-07", "residual": 1.3132773929867256, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 12.090909090909092, "mutations": ["aa:orf1a:M3655I", "aa:S:D614A", "aa:orf8:L84S", "aa:orf8:E92K", "aa:N:S202N"]}, "B.1.36.29": {"nsamples": 807, "lastcoldate": "2021-05-14", "residual": 0.7437241598266129, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 22.37174721189591, "mutations": ["aa:orf1a:T1001I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L2523F", "aa:S:N440K", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:E261*", "aa:orf8:S97I", "aa:N:S2P", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.227": {"nsamples": 181, "lastcoldate": "2020-09-20", "residual": 0.17417092666650025, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 16.88950276243094, "mutations": ["aa:orf1a:K120N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1092F", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:A2222T"]}, "B.1.580": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2021-02-23", "residual": -0.26933364019443723, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.743589743589743, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S190I"]}, "N.2": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-10-14", "residual": -0.7992048857843297, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 18.4, "mutations": ["aa:orf1a:Q611L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:T747I", "aa:orf6:I33T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T"]}, "B.1.1.203": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2020-10-30", "residual": -1.2893941438815435, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 13.0625, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T512K", "aa:orf3a:E194K", "aa:orf7b:W29C", "aa:orf1a:L590F", "aa:orf1a:V3331A"]}, "B.1.1.391": {"nsamples": 112, "lastcoldate": "2020-09-20", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 12.339285714285714, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "A.25": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-12-03", "residual": -1.4084401065922043, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 12.75, "mutations": ["aa:orf1a:T1760I", "aa:orf1a:M3655I", "aa:orf8:L84S", "aa:orf8:E92K", "aa:N:S202N"]}, "B.1.274": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2020-05-30", "residual": -0.6007949480883116, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 9.133333333333333, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:T151A"]}, "B.1.1.284": {"nsamples": 8732, "lastcoldate": "2021-05-04", "residual": 0.25353490180694077, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 18.325469537333944, "mutations": ["aa:orf1a:S1361P", "aa:orf1a:P3371S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A414V", "aa:S:D614G", "aa:N:P151L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:M153T"]}, "B.1.595.3": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2021-01-07", "residual": -1.4481220941624244, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 17.933333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1a:T3487A", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:T638A", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.1.362": {"nsamples": 82, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": 0.4986295308167768, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 15.829268292682928, "mutations": ["aa:orf1a:N704H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:M210I"]}, "B.1.1.112": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2020-07-06", "residual": -0.31601833150825515, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 11.25, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:V2061F", "aa:N:S180I"]}, "B.1.1.209": {"nsamples": 73, "lastcoldate": "2021-03-31", "residual": 1.5513693183305055, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.136986301369863, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G2005S", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.36.23": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2020-11-04", "residual": 0.015442976385619133, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 18.355555555555554, "mutations": ["aa:orf1a:T2016I", "aa:orf1a:T4083M", "aa:orf1b:G219C", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A522V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:P13L", "aa:N:S194L", "aa:N:R209S", "aa:orf3a:P25H"]}, "B.1.240.1": {"nsamples": 36, "lastcoldate": "2021-02-10", "residual": -0.6334742319149341, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 16.52777777777778, "mutations": ["aa:orf1a:V3449F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.416.1": {"nsamples": 414, "lastcoldate": "2021-04-28", "residual": -0.5937922443447139, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 14.342995169082126, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S187L", "aa:orf1a:T814I"]}, "B.1.1.407": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2021-02-14", "residual": 0.4986295308167768, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 14.083333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:Q1592R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.184": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2020-07-18", "residual": -1.0839815024419277, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 13.714285714285714, "mutations": ["aa:S:D614G", "aa:S:H1083Q", "aa:M:S214R", "aa:N:S194L", "aa:orf1b:P314L"]}, "C.28": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-11-24", "residual": 0.3328988768698397, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 16.272727272727273, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:Q27*", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.349": {"nsamples": 38, "lastcoldate": "2021-03-09", "residual": -0.6334742319149341, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 18.842105263157894, "mutations": ["aa:orf1a:A3497V", "aa:orf1a:L3644F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D839Y", "aa:E:E8D", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.606": {"nsamples": 88, "lastcoldate": "2020-11-13", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 14.875, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:F548L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M454I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:M:A83S", "aa:N:S194L"]}, "B.1.444": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2021-01-19", "residual": 1.1872287266875503, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 19.642857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K734R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S21N", "aa:N:S194L", "aa:orf1b:S2338L"]}, "B.1.258.2": {"nsamples": 109, "lastcoldate": "2020-11-22", "residual": -1.4481220941624244, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 16.44954128440367, "mutations": ["aa:orf1a:G400D", "aa:orf1a:M1769I", "aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.241": {"nsamples": 225, "lastcoldate": "2021-05-05", "residual": 0.6246781971159521, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 14.453333333333333, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:V3G", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.513": {"nsamples": 76, "lastcoldate": "2020-05-15", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 11.513157894736842, "mutations": ["aa:orf1a:G3334S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.506": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2020-08-13", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 13.84, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T3308I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.443": {"nsamples": 47, "lastcoldate": "2021-01-11", "residual": 1.3062746893206696, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 12.893617021276595, "mutations": ["aa:orf1a:M3661L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D796G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T247I"]}, "B.1.1.98": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2021-02-08", "residual": 0.37258086444005994, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 15.7, "mutations": ["aa:orf1a:E2031K", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P2531S", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.335": {"nsamples": 53, "lastcoldate": "2021-04-04", "residual": -0.6404769356585318, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 12.981132075471699, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.612": {"nsamples": 385, "lastcoldate": "2021-05-15", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 17.007792207792207, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S190I"]}, "B.1.602": {"nsamples": 68, "lastcoldate": "2021-03-12", "residual": 1.6377359971370022, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 15.514705882352942, "mutations": ["aa:orf1a:A566T", "aa:orf1a:T3032I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.234": {"nsamples": 4194, "lastcoldate": "2021-05-11", "residual": 1.7100972686113867, "max_ndiffs": 43, "mean_ndiffs": 18.30472103004292, "mutations": ["aa:orf1a:V665I", "aa:orf1a:K2059R", "aa:orf1a:D2980G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:N:T391I"]}, "B.1.1.87": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-05-14", "residual": -1.4551247978284805, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 12.0, "mutations": ["aa:orf1a:P1054L", "aa:orf1a:H1141Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:G1171V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.480": {"nsamples": 225, "lastcoldate": "2021-03-29", "residual": 1.5583720219965616, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 19.36888888888889, "mutations": ["aa:orf1a:L204F", "aa:orf1a:S3547G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:M1229I", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "aa:S:N439K", "aa:N:D377A", "aa:orf1b:P2116S"]}, "K.1": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2020-10-07", "residual": 0.3399015805358957, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 15.413793103448276, "mutations": ["aa:orf1a:M598K", "aa:orf1b:K82R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.547": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2020-08-09", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 7.619047619047619, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V579L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.36.38": {"nsamples": 226, "lastcoldate": "2021-03-18", "residual": 1.4323233556973864, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 19.601769911504423, "mutations": ["aa:orf1a:V561A", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:S2695G", "aa:orf1b:P970L"]}, "B.1.588": {"nsamples": 493, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": 1.233913417846285, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 24.59026369168357, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:T20I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:D155Y", "aa:orf8:S24L", "aa:N:M234I", "aa:N:D401Y"]}, "B.1.344": {"nsamples": 59, "lastcoldate": "2020-05-06", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 8.372881355932204, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S26A", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.337": {"nsamples": 203, "lastcoldate": "2021-03-20", "residual": 1.0285007764066691, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 28.0935960591133, "mutations": ["aa:orf1a:T727I", "aa:orf1a:S1520F", "aa:orf1a:A2123V", "aa:orf1a:L3899I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A1078T", "aa:orf3a:M125I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:F1779L"]}, "B.1.382": {"nsamples": 40, "lastcoldate": "2020-11-09", "residual": -0.8458895770981476, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 8.75, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:Q52H", "aa:N:P199L"]}, "B.1.203": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2021-03-09", "residual": 0.09480695152605968, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 14.857142857142858, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H716Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G251S", "aa:orf1a:K837R", "aa:S:N658D", "aa:N:M210I"]}, "B.1.305": {"nsamples": 189, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": 0.4986295308167768, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 15.677248677248677, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S2214A", "aa:orf1b:A176V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1351F", "aa:orf1b:M2667I", "aa:S:L54F", "aa:S:A520S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S92L"]}, "C.25": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2020-08-27", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 15.142857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "C.13": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2021-02-16", "residual": -0.4817489853776507, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 18.2, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1a:P4197S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q2555R", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "C.33": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": -0.1502876774837764, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 17.22222222222222, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.138": {"nsamples": 119, "lastcoldate": "2020-12-13", "residual": 0.7367214561605568, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 18.756302521008404, "mutations": ["aa:orf1a:A1679V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T1881I", "aa:orf8:H40Y", "aa:orf1a:Y182H"]}, "B.1.1.408": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-08-10", "residual": 1.3132773929867256, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 15.875, "mutations": ["aa:orf1a:Q1592R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S202C", "aa:N:S202T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:T362I"]}, "B.1.258.3": {"nsamples": 369, "lastcoldate": "2021-03-31", "residual": -0.8388868733545499, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 21.92140921409214, "mutations": ["aa:orf1a:G400D", "aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1001L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:S1779I", "aa:S:P25S", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:S:C1253F"]}, "B.1.1.311": {"nsamples": 2051, "lastcoldate": "2021-05-01", "residual": -1.5274860693028651, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 13.742077035592393, "mutations": ["aa:orf1a:M3655I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:K75N", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:M3712I", "del:29730:49"]}, "B.1.1.196": {"nsamples": 114, "lastcoldate": "2020-12-09", "residual": -0.7128382069778331, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 18.263157894736842, "mutations": ["aa:orf1a:G963S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D198G", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.532": {"nsamples": 126, "lastcoldate": "2020-12-16", "residual": 1.0285007764066691, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 18.206349206349206, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M657I", "aa:orf1b:T1637I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S58I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.282": {"nsamples": 53, "lastcoldate": "2020-08-31", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 16.62264150943396, "mutations": ["aa:orf1a:A206V", "aa:orf1a:Q2702H", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1427S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:G212C"]}, "B.1.177.7": {"nsamples": 4801, "lastcoldate": "2021-04-28", "residual": 0.16716822292290257, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 17.90252030826911, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.36.1": {"nsamples": 614, "lastcoldate": "2021-04-26", "residual": -0.5541102567744935, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 22.144951140065146, "mutations": ["aa:orf1a:R3993C", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "B.6.8": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2021-01-20", "residual": -0.26933364019443723, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 10.96774193548387, "mutations": ["aa:orf1a:T2016K", "aa:orf1b:A88V", "aa:orf8:L95F", "aa:N:P13L", "aa:orf1a:T2152I"]}, "S.1": {"nsamples": 167, "lastcoldate": "2021-04-16", "residual": 1.154549442783386, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 25.281437125748504, "mutations": ["aa:orf1a:Q1021R", "aa:orf1a:S1102G", "aa:orf1a:S3195G", "aa:orf1a:P4312T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A110S", "aa:M:A2V", "aa:orf8:E64*", "aa:N:R40C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.488": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2021-02-10", "residual": -0.5541102567744935, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 16.6, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K798N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D936Y", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T24I", "aa:orf1a:G2868S", "aa:S:R847T"]}, "B.1.1.302": {"nsamples": 379, "lastcoldate": "2021-03-25", "residual": -0.8388868733545499, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 21.07915567282322, "mutations": ["aa:orf1a:T2952I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1522I", "aa:orf1b:P2256S", "aa:S:D614G", "aa:S:V1122L", "aa:orf7a:Q94L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:P309S"]}, "B.1.1.365": {"nsamples": 131, "lastcoldate": "2020-08-26", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 11.877862595419847, "mutations": ["aa:orf1a:D1554A", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:R21I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A103T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.12": {"nsamples": 102, "lastcoldate": "2021-03-21", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 15.22549019607843, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:L3930F"]}, "B.1.235": {"nsamples": 254, "lastcoldate": "2020-12-20", "residual": 1.4323233556973864, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 14.220472440944881, "mutations": ["aa:orf1a:L1748M", "aa:orf1a:T4087I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2061L", "aa:orf1b:V2564A", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.303": {"nsamples": 268, "lastcoldate": "2021-03-15", "residual": 1.1078647515471098, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 18.57089552238806, "mutations": ["aa:orf1a:G3541R", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1271L", "aa:orf1b:T1522I", "aa:orf1b:Q1546H", "aa:orf1b:C1732S", "aa:S:D614G", "aa:S:A688V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:D173G", "aa:orf1b:G2068R"]}, "B.1.160": {"nsamples": 16820, "lastcoldate": "2021-05-19", "residual": -0.4350642940638328, "max_ndiffs": 44, "mean_ndiffs": 25.845481569560047, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "B.1.1.286": {"nsamples": 268, "lastcoldate": "2021-02-10", "residual": -1.4084401065922043, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.044776119402986, "mutations": ["aa:orf1a:V1020F", "aa:orf1a:P1640S", "aa:orf1a:A3209V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R1736K", "aa:S:D614G", "aa:N:N196S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.97": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-07-29", "residual": 1.5513693183305055, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 13.833333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:E102K", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1493L", "aa:orf1b:M1573I", "aa:S:H207R", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.309": {"nsamples": 144, "lastcoldate": "2021-04-30", "residual": -0.8458895770981476, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 13.277777777777779, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:K75N", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.53": {"nsamples": 178, "lastcoldate": "2021-04-01", "residual": 0.30021959296567546, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 19.578651685393258, "mutations": ["aa:orf1a:A903V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.67": {"nsamples": 184, "lastcoldate": "2021-03-18", "residual": -0.4420669978074304, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 12.429347826086957, "mutations": ["aa:orf1a:D3728N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:T29I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.36.12": {"nsamples": 53, "lastcoldate": "2020-10-13", "residual": 1.1078647515471098, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.39622641509434, "mutations": ["aa:orf1a:T3750I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:V1068F", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "B.1.177.17": {"nsamples": 940, "lastcoldate": "2021-03-25", "residual": 1.233913417846285, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 16.875531914893617, "mutations": ["aa:orf1a:D48G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:S:L176F"]}, "C.30": {"nsamples": 432, "lastcoldate": "2021-01-25", "residual": 0.9094548136960084, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 21.46759259259259, "mutations": ["aa:orf1a:E913D", "aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:T1542I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S255F", "aa:S:D614G", "aa:S:K1073N", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.56": {"nsamples": 1030, "lastcoldate": "2021-03-05", "residual": -1.2823914402154875, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 17.941747572815533, "mutations": ["aa:orf1a:A2554V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "D.4": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-08-21", "residual": -0.9976148235578894, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 17.545454545454547, "mutations": ["aa:orf1a:I300F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1099F", "aa:orf1b:R2257S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S171L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:M210I"]}, "B.1.177.57": {"nsamples": 2524, "lastcoldate": "2021-03-14", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 19.10380348652932, "mutations": ["aa:orf1a:T2181I", "aa:orf1a:A2554V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.130": {"nsamples": 51, "lastcoldate": "2020-12-17", "residual": -0.30901562776465746, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 12.627450980392156, "mutations": ["aa:orf1a:G493D", "aa:orf1a:A1074V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:D27Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.204": {"nsamples": 158, "lastcoldate": "2021-03-31", "residual": -0.4023850102372102, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 17.90506329113924, "mutations": ["aa:orf1a:I1203T", "aa:orf1a:N2603D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.213": {"nsamples": 52, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": 1.226910714180229, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 13.51923076923077, "mutations": ["aa:orf1a:N2256D", "aa:orf1b:K50N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.15": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2020-08-25", "residual": -1.4084401065922043, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 14.966666666666667, "mutations": ["aa:orf1a:T999I", "aa:orf1a:P1786S", "aa:orf1a:G3072C", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E2274A", "aa:S:D614G", "aa:N:R68L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.145": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2021-02-24", "residual": -1.2893941438815435, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 14.3, "mutations": ["aa:orf1a:E622V", "aa:orf1a:L969F", "aa:orf1a:S2024L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2165M", "aa:orf1b:G2180V", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:Q94*", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.4.8": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-11-02", "residual": -1.6932167231722606, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 18.1, "mutations": ["aa:orf1a:V378I", "aa:orf1a:L1507F", "aa:orf1a:T1760I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V112F", "aa:orf3a:T223A", "aa:N:A220V"]}, "B.1.160.30": {"nsamples": 280, "lastcoldate": "2021-04-04", "residual": -0.02423901118460114, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 21.060714285714287, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M2667I", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:N:P365S", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.234": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-12-11", "residual": 0.015442976385619133, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 18.771428571428572, "mutations": ["aa:orf1a:A1306S", "aa:orf1a:E1687D", "aa:orf1a:P1810L", "aa:orf1a:S2103F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:M153I", "aa:S:D614G", "aa:S:S691A", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:V2199F"]}, "B.1.1.170": {"nsamples": 601, "lastcoldate": "2021-03-20", "residual": 0.6643601846861723, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 19.898502495840265, "mutations": ["aa:orf1a:P1640H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:D4187N"]}, "B.1.1.347": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2021-02-04", "residual": 0.6643601846861723, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 21.16216216216216, "mutations": ["aa:orf1a:S2193F", "aa:orf1a:A3497V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:K1305N", "aa:orf1b:K2063N", "aa:orf3a:V202L", "aa:orf1a:K2059N", "aa:orf1b:P452S"]}, "B.1.77": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2020-06-21", "residual": 0.5779935059572173, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 9.466666666666667, "mutations": ["aa:orf1a:V1025L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S247G", "aa:S:D614G", "aa:N:S412N"]}, "W.3": {"nsamples": 131, "lastcoldate": "2021-01-25", "residual": -0.0639209986772798, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 17.87786259541985, "mutations": ["aa:orf1a:A903V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:M1229T", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.44": {"nsamples": 1294, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": 0.5849962095457318, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 19.25888717156105, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M2667I", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.280": {"nsamples": 119, "lastcoldate": "2021-04-08", "residual": 0.6246781971159521, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 15.84873949579832, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:M153T", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.81": {"nsamples": 3246, "lastcoldate": "2021-05-14", "residual": 0.5849962095457318, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 20.566235366605053, "mutations": ["aa:orf1a:P3952S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S166L", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.298": {"nsamples": 234, "lastcoldate": "2021-04-05", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 16.145299145299145, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:V1583F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S190R", "aa:orf3a:L86F"]}, "B.1.177.79": {"nsamples": 1154, "lastcoldate": "2021-05-10", "residual": -0.9976148235578894, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 20.10311958405546, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V77F", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.60": {"nsamples": 1887, "lastcoldate": "2021-05-10", "residual": 0.8697728262033297, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 21.008479067302595, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V77F", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.221.1": {"nsamples": 256, "lastcoldate": "2021-03-03", "residual": -0.0639209986772798, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 18.65234375, "mutations": ["aa:orf1a:H1113Y", "aa:orf1a:V1393L", "aa:orf1a:T2087I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S98F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q38R", "aa:orf3a:G172R", "aa:orf3a:V202L", "aa:N:P199L"]}, "AP.1": {"nsamples": 541, "lastcoldate": "2021-02-24", "residual": 1.1148674552131659, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 27.282809611829943, "mutations": ["aa:orf1a:S944L", "aa:orf1a:H2357Y", "aa:orf1a:G3334S", "aa:orf1a:P3395L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2084I", "aa:orf1b:A2268V", "aa:orf1b:M2322I", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Y156C", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:Q9H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.15": {"nsamples": 1143, "lastcoldate": "2021-03-22", "residual": 0.5056322344828329, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 20.388451443569554, "mutations": ["aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.287": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2021-03-23", "residual": 0.008440272719563092, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 11.774193548387096, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:E2050G", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S2363F", "aa:S:E180V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.230": {"nsamples": 66, "lastcoldate": "2020-10-21", "residual": -1.61385274803182, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 11.818181818181818, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:G96R", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.53": {"nsamples": 3, "lastcoldate": "2021-01-27", "residual": 0.6246781971159521, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 18.666666666666668, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:V627F", "aa:orf1a:T2016I", "aa:orf1a:V2047F", "aa:orf1a:N2081S", "aa:S:P681H", "aa:orf3a:D173G", "aa:orf7a:I88V"]}, "B.1.1.433": {"nsamples": 596, "lastcoldate": "2021-03-19", "residual": 1.5186900344263414, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 24.323825503355703, "mutations": ["aa:orf1a:E3909G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S477R", "aa:S:D614G", "aa:S:S673T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T1581M", "aa:orf1b:A373T", "aa:orf1b:T794I", "aa:orf3a:T223I", "aa:orf1a:V1143F", "aa:S:N679K", "aa:orf3a:L275F", "aa:orf8:F3L"]}, "B.1.177.23": {"nsamples": 220, "lastcoldate": "2021-03-17", "residual": 0.8697728262033297, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 18.990909090909092, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1271L", "aa:orf1b:I2273F", "aa:orf1b:I2273T", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:E121V", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:S:V90F"]}, "B.1.403": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2021-01-10", "residual": -1.6535347356020402, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 11.933333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:T1444N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K1873N", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:orf1b:T1637I"]}, "B.1.1.176": {"nsamples": 1234, "lastcoldate": "2021-03-01", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 23.429497568881686, "mutations": ["aa:orf1a:T2648I", "aa:orf1a:S3001N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q185H", "aa:N:G30R", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:T20I", "aa:S:R357K", "aa:orf1a:E352D", "del:11286:6", "aa:orf1b:A434S", "aa:N:A211V"]}, "C.32": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2020-10-16", "residual": 0.617675493449896, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 16.884615384615383, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "C.4": {"nsamples": 48, "lastcoldate": "2021-02-12", "residual": -0.3557003189233922, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 20.666666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A1078S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.381": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2021-02-10", "residual": 0.008440272719563092, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 14.75, "mutations": ["aa:orf1a:L2146F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A3209V", "aa:orf3a:K136N"]}, "B.1.1.110": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2020-08-27", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 12.5, "mutations": ["aa:orf1a:I473V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:T299I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.337": {"nsamples": 85, "lastcoldate": "2021-02-20", "residual": -1.2030274650750468, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 15.705882352941176, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:Q39L", "aa:orf3a:T223I"]}, "B.1.1.432": {"nsamples": 351, "lastcoldate": "2021-04-03", "residual": -0.8855715646683678, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 23.811965811965813, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S74F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:G174C"]}, "B.1.1.512": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2021-01-31", "residual": -1.2030274650750468, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 19.0, "mutations": ["aa:orf1a:G3334S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A1078S", "aa:S:I1232F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.596": {"nsamples": 6233, "lastcoldate": "2021-05-10", "residual": 1.021498072740613, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 22.220920904861224, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:N1653D", "aa:orf1b:R2613C", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:G172V", "aa:orf8:S24L", "aa:N:P67S", "aa:N:P199L"]}, "B.1.1.251": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2021-02-11", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 17.23913043478261, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D111N", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.242": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2020-11-07", "residual": -1.5274860693028651, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 13.8, "mutations": ["aa:orf1a:T4090I", "aa:orf1b:T76I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1746Y", "aa:orf1b:R2257K", "aa:S:D614G", "aa:N:P13S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.310": {"nsamples": 52, "lastcoldate": "2021-02-13", "residual": -0.8458895770981476, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 10.288461538461538, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:K75N", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:E2212G"]}, "A.26": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-04-27", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 8.4, "mutations": ["aa:orf1a:M3655I", "aa:orf8:L84S", "aa:orf8:E92K", "aa:N:S202N"]}, "B.1.110.2": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2020-04-12", "residual": 1.6704152810411665, "max_ndiffs": 10, "mean_ndiffs": 9.6, "mutations": ["aa:orf1a:S505P", "aa:orf1a:T1242I", "aa:orf1a:G3514R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:P631S", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.521": {"nsamples": 168, "lastcoldate": "2021-04-20", "residual": -0.031241714850657184, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 19.976190476190474, "mutations": ["aa:orf1a:A3143V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.50": {"nsamples": 313, "lastcoldate": "2021-03-21", "residual": 0.8557674188712177, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 16.88817891373802, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.570": {"nsamples": 23, "lastcoldate": "2021-02-01", "residual": -1.5671680568730855, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 19.0, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:E3608K", "aa:orf1a:A4396V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A2565V", "aa:S:D614G", "aa:S:P681L", "aa:orf3a:K21N", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:K2200N", "aa:orf1a:A3143V", "aa:orf1a:L3483F", "aa:S:T1120S"]}, "AN.1": {"nsamples": 34, "lastcoldate": "2021-02-10", "residual": 1.6377359971370022, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 15.0, "mutations": ["del:1598:6", "aa:orf1a:V1211F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:L2146F", "aa:orf1a:L3951F"]}, "B.1.177.5": {"nsamples": 502, "lastcoldate": "2021-05-09", "residual": -0.10360298624750007, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 19.54183266932271, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A23V", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:H110Y"]}, "B.1.1.240": {"nsamples": 147, "lastcoldate": "2021-02-01", "residual": -1.6465320318584427, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 16.93877551020408, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q2425H", "aa:S:D614G", "aa:S:K1073N", "aa:orf8:A65V", "aa:N:P13S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf10:V30L", "aa:S:C1250F"]}, "B.1.177.8": {"nsamples": 939, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": -1.3617554152783864, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 18.5346112886049, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.3": {"nsamples": 99, "lastcoldate": "2021-03-18", "residual": 1.154549442783386, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 16.050505050505052, "mutations": ["aa:orf1a:V2027L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "AA.1": {"nsamples": 84, "lastcoldate": "2021-03-25", "residual": -0.3486976153348778, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 23.035714285714285, "mutations": ["aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:S:Q677H"]}, "B.1.492": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2020-05-21", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 8.89655172413793, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:A152S"]}, "B.1.160.14": {"nsamples": 314, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": 0.5056322344828329, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 26.10828025477707, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf3a:A72S"]}, "C.5": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-11-12", "residual": -0.42806159039777675, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 18.22222222222222, "mutations": ["aa:orf1a:E910D", "aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:Y1536H", "aa:orf1a:L2062F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1967S", "aa:S:D614G", "aa:orf7b:L18P", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf6:D61Y"]}, "C.31": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2021-03-12", "residual": -0.3486976153348778, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 26.233333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P970L", "aa:orf1b:L2213F", "aa:orf1b:R2652S", "aa:S:D614G", "aa:S:K1073N", "aa:N:D3Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:S98F", "aa:S:E309Q", "aa:orf3a:T223N"]}, "B.1.396": {"nsamples": 963, "lastcoldate": "2021-04-18", "residual": -0.4350642940638328, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 18.218068535825545, "mutations": ["aa:orf1a:P309L", "aa:orf1a:L3086I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:orf10:I4V"]}, "B.1.346": {"nsamples": 479, "lastcoldate": "2021-05-07", "residual": -0.8458895770981476, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 20.526096033402922, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1099F", "aa:orf1b:T2432I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I", "aa:orf1a:N2228T", "aa:orf1b:A374S"]}, "B.1.577": {"nsamples": 944, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": 1.38563866446111, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 21.689618644067796, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1076I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L", "aa:orf1a:F406Y", "aa:N:P207S"]}, "B.1.1.320": {"nsamples": 41, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": 0.5056322344828329, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 18.29268292682927, "mutations": ["aa:orf1a:P371L", "aa:orf1a:E797G", "aa:orf1a:P3371S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T175I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T753I", "aa:orf1b:K798E", "aa:orf3a:Q185H", "aa:N:K342R"]}, "B.1.380": {"nsamples": 117, "lastcoldate": "2021-01-21", "residual": -1.011620230967543, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 13.273504273504274, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S209A"]}, "B.1.1.148": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2021-02-11", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 11.428571428571429, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2336I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.326": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2021-01-28", "residual": 1.5910513059007259, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 11.217391304347826, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:E554D", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:T1542I", "aa:orf1a:T1597I"]}, "B.1.1.210": {"nsamples": 116, "lastcoldate": "2020-09-08", "residual": 0.41226285201028023, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 10.948275862068966, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:A2S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:M3733I"]}, "B.1.511": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-07-08", "residual": -1.5344887729689212, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 8.846153846153847, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.169": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2021-02-06", "residual": 0.008440272719563092, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 12.054054054054054, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:V111L"]}, "B.1.1.402": {"nsamples": 41, "lastcoldate": "2020-10-22", "residual": -0.6404769356585318, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 11.634146341463415, "mutations": ["aa:orf1a:C655R", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T899I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.226": {"nsamples": 104, "lastcoldate": "2021-04-13", "residual": -1.4948067853987008, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 12.971153846153847, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L85F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.118": {"nsamples": 59, "lastcoldate": "2020-09-15", "residual": 0.2932168892996194, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 10.59322033898305, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2336I", "aa:S:D614G", "aa:S:S640F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.432": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2020-12-22", "residual": 0.8230881349670535, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 10.911111111111111, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G519S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G662V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.325": {"nsamples": 67, "lastcoldate": "2020-09-14", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 15.35820895522388, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L1556I", "aa:orf1a:G3072C", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1218I", "aa:orf1b:L1681F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T379I"]}, "B.1.571": {"nsamples": 64, "lastcoldate": "2021-01-24", "residual": -1.6932167231722606, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 17.40625, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:P240S", "aa:N:S183Y"]}, "B.1.546": {"nsamples": 141, "lastcoldate": "2020-10-19", "residual": -0.7198409107214307, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 9.27659574468085, "mutations": ["aa:orf1a:E673K", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1391L", "aa:S:D614G", "aa:S:L822F"]}, "B.1.487": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2021-01-19", "residual": -1.61385274803182, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 9.85, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T490I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:S:A701V"]}, "B.1.194": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-07-21", "residual": 0.4986295308167768, "max_ndiffs": 11, "mean_ndiffs": 9.222222222222221, "mutations": ["aa:orf1a:G894S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D1146H"]}, "B.1.1.177": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2020-08-10", "residual": -1.6535347356020402, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 10.5, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T899I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.440": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2020-08-27", "residual": -0.1502876774837764, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 9.847826086956522, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.367": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-08-24", "residual": -1.368758119021984, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 12.11111111111111, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.342": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-07-21", "residual": 1.392641368127166, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 12.11111111111111, "mutations": ["aa:orf1a:P1158S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.445": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2020-07-07", "residual": -1.1703481812484242, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 11.25, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:I3512T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E427G", "aa:orf1b:S2430R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.356": {"nsamples": 53, "lastcoldate": "2020-09-02", "residual": -1.2893941438815435, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 12.547169811320755, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.581": {"nsamples": 51, "lastcoldate": "2020-10-28", "residual": 1.392641368127166, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 12.92156862745098, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S190I"]}, "B.1.285": {"nsamples": 2, "lastcoldate": "2020-07-13", "residual": -0.4350642940638328, "max_ndiffs": 9, "mean_ndiffs": 8.0, "mutations": ["aa:orf1a:R24C", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1391L", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:W161C", "aa:orf1b:A2211V", "aa:E:P71S"]}, "B.1.36.18": {"nsamples": 866, "lastcoldate": "2021-04-29", "residual": 0.22085561790277655, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 20.9919168591224, "mutations": ["aa:orf1a:V2588F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:V561A", "aa:orf1b:M657I", "aa:S:G75R", "aa:orf8:S67F", "aa:orf1b:L1504F"]}, "B.1.587": {"nsamples": 290, "lastcoldate": "2021-03-28", "residual": 0.048122260289783364, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 21.0, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S2212I", "aa:orf1b:T2217I", "aa:S:D178G", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:D155Y", "aa:N:D401Y", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.177.83": {"nsamples": 395, "lastcoldate": "2021-05-03", "residual": 0.22085561790277655, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 22.670886075949365, "mutations": ["aa:orf1a:T2007I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:A262S", "aa:S:P272L", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "C.12": {"nsamples": 57, "lastcoldate": "2020-09-11", "residual": -1.2823914402154875, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 13.403508771929825, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.239": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2021-02-03", "residual": -0.30901562776465746, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 13.772727272727273, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.463": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-08-03", "residual": 0.2932168892996194, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 11.363636363636363, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.309": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2021-01-20", "residual": -1.1236634900121478, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 16.846153846153847, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:Q575H", "aa:orf1a:P892S", "aa:orf1a:I1667V", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S997L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T24I"]}, "B.1.1.514": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-09-30", "residual": -1.5344887729689212, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 14.0, "mutations": ["aa:orf1a:G3334S", "aa:orf1a:G4178V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L106F", "aa:orf3a:E241Q", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "C.23": {"nsamples": 100, "lastcoldate": "2021-04-25", "residual": 0.2932168892996194, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 22.49, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:K1305N", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:1604:6", "aa:N:M234I", "aa:S:T20I"]}, "B.1.177.14": {"nsamples": 134, "lastcoldate": "2020-10-12", "residual": -0.9182508484949905, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 15.059701492537313, "mutations": ["aa:orf1a:T2007I", "aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.219": {"nsamples": 161, "lastcoldate": "2021-03-30", "residual": -1.242709452645267, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 25.608695652173914, "mutations": ["aa:orf1a:M1769I", "aa:orf1a:Q2034L", "aa:orf1a:C3059G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W128C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:P1821S", "aa:S:F157L", "aa:orf3a:P240S", "aa:N:S193I"]}, "B.1.177.10": {"nsamples": 843, "lastcoldate": "2021-05-04", "residual": -0.42806159039777675, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 18.02135231316726, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:A262S", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:K3577N"]}, "B.1.1.308": {"nsamples": 63, "lastcoldate": "2020-11-15", "residual": 1.4393260593634425, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 11.53968253968254, "mutations": ["aa:orf1a:G442V", "aa:orf1a:I3619V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:K75N", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "Z.1": {"nsamples": 297, "lastcoldate": "2021-05-12", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 21.164983164983166, "mutations": ["aa:orf1a:P3952S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L85F", "aa:orf3a:S166L", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.16": {"nsamples": 1073, "lastcoldate": "2021-03-27", "residual": -1.07697879869833, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 16.058713886300094, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:P13T", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.82": {"nsamples": 1470, "lastcoldate": "2021-04-29", "residual": -0.7128382069778331, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 21.79047619047619, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:A262S", "aa:S:P272L", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1b:M1573I"]}, "B.1.177.87": {"nsamples": 966, "lastcoldate": "2021-04-30", "residual": -0.7128382069778331, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 19.0703933747412, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:A262S", "aa:S:P272L", "aa:S:D614G", "aa:N:H145Y", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "W.4": {"nsamples": 461, "lastcoldate": "2021-02-15", "residual": -1.6465320318584427, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 19.09110629067245, "mutations": ["aa:orf1a:A903V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:I2378L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:S33I", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.258.7": {"nsamples": 353, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": -0.10360298624750007, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 20.6685552407932, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:N:A182S"]}, "B.1.1.86": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2020-06-25", "residual": 0.25353490180694077, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 14.571428571428571, "mutations": ["aa:orf1a:L3180M", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T151I", "aa:orf7b:F19S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A3523V"]}, "B.1.1.109": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2021-01-28", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 14.411764705882353, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.123": {"nsamples": 40, "lastcoldate": "2020-07-02", "residual": 0.5779935059572173, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.925, "mutations": ["aa:orf1a:T814I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:G769V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf10:S23F"]}, "B.1.1.387": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2020-10-01", "residual": -0.6334742319149341, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 13.142857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:H110Y", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L"]}, "B.1.251": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-07-15", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 8.342857142857143, "mutations": ["aa:orf1a:K292N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L", "aa:orf8:S69L"]}, "B.1.1.361": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2020-06-25", "residual": -1.6535347356020402, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.428571428571429, "mutations": ["aa:orf1a:N2187S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.92": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-06-24", "residual": 0.4986295308167768, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 9.9, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A99S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.155": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-06-19", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 11.1, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:Q1813H", "aa:orf1a:P4389L"]}, "B.1.467": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2020-11-24", "residual": 1.511687330837827, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 14.133333333333333, "mutations": ["aa:orf1a:M1647I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S201I"]}, "B.1.177.19": {"nsamples": 423, "lastcoldate": "2021-02-20", "residual": -1.3617554152783864, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 16.10874704491726, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:E583D", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.165": {"nsamples": 52, "lastcoldate": "2020-11-12", "residual": 0.8300908386331095, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 14.326923076923077, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:L3495F", "aa:orf8:Q91K"]}, "B.1.177.4": {"nsamples": 3242, "lastcoldate": "2021-03-25", "residual": -0.7198409107214307, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 19.73072177668106, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:K3839R"]}, "B.1.1.120": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2020-07-14", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 14.76, "mutations": ["aa:orf1a:A566V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1996M", "aa:S:F565L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:I58L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:29752:9"]}, "B.1.407": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-07-30", "residual": 0.4986295308167768, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 14.384615384615385, "mutations": ["aa:orf1a:Q663K", "aa:orf1a:V3660L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A110S", "aa:orf7a:H47Y", "aa:N:S194L", "aa:N:T271I"]}, "B.1.1.325": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2021-02-23", "residual": 0.05512496395583941, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 18.34375, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:R1350K", "aa:orf1b:S2031I", "aa:orf7b:C41F", "aa:orf1a:K120N", "aa:orf1b:P1287L", "aa:orf1b:V1983L", "aa:S:A222V"]}, "B.1.177.52": {"nsamples": 405, "lastcoldate": "2021-03-18", "residual": -0.0639209986772798, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 18.730864197530863, "mutations": ["aa:orf1a:M1586I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:P1162R", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.469": {"nsamples": 217, "lastcoldate": "2021-05-20", "residual": 0.5453142220530531, "max_ndiffs": 47, "mean_ndiffs": 20.322580645161292, "mutations": ["aa:orf1a:N3937S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K2557R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T198I", "aa:orf1b:M2025I", "aa:orf1b:V2117L", "aa:S:P681H", "aa:orf3a:F105L"]}, "B.1.1.425": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-11-09", "residual": 0.22085561790277655, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 21.90909090909091, "mutations": ["aa:orf1a:P2685T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1884S", "aa:orf1b:M2408I", "aa:S:V62I", "aa:S:D614G", "aa:S:D867G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:K623E", "aa:N:T362I"]}, "B.1.1.187": {"nsamples": 92, "lastcoldate": "2020-12-18", "residual": 0.13448893909627996, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 11.271739130434783, "mutations": ["aa:orf1a:Q3332R", "aa:orf1a:M3539V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.65": {"nsamples": 1199, "lastcoldate": "2021-03-07", "residual": 0.5056322344828329, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 18.319432860717264, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.434": {"nsamples": 1683, "lastcoldate": "2021-04-28", "residual": 0.13448893909627996, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 20.07427213309566, "mutations": ["aa:orf1a:T224I", "aa:orf1a:I693V", "aa:orf1a:Q998H", "aa:orf1a:L3776F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1219S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:E226G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.438": {"nsamples": 83, "lastcoldate": "2021-05-07", "residual": 1.392641368127166, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 19.349397590361445, "mutations": ["aa:orf1a:M297V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:D401Y"]}, "B.1.1.364": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2021-01-26", "residual": 0.25353490180694077, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 13.916666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:V3751F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:V114F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:A251V"]}, "B.1.1.30": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2020-06-03", "residual": 0.5779935059572173, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 11.416666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:S443F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:R21I", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:T28I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.77": {"nsamples": 1019, "lastcoldate": "2021-05-12", "residual": -1.242709452645267, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 19.506378802747793, "mutations": ["aa:orf1b:T17I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf3a:S165F"]}, "AE.1": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2020-09-03", "residual": -1.6535347356020402, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 16.26923076923077, "mutations": ["aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "AE.5": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2021-02-13", "residual": -0.18996966505399665, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 14.473684210526315, "mutations": ["aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1a:T2300I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.372": {"nsamples": 87, "lastcoldate": "2020-09-14", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 9.977011494252874, "mutations": ["del:686:9", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:D936Y", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:V32I"]}, "B.1.1.144": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2020-11-28", "residual": 0.22085561790277655, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 16.612903225806452, "mutations": ["aa:orf1a:D1417N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:N141S", "aa:orf1b:G219C", "aa:orf1b:M1397I", "aa:orf1b:V2287A"]}, "B.1.177.33": {"nsamples": 282, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": -0.42806159039777675, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 19.47163120567376, "mutations": ["aa:orf1a:T2274I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:G639S", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:N:P365S"]}, "B.1.1.315": {"nsamples": 71, "lastcoldate": "2021-04-30", "residual": 1.4790080469336628, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 21.732394366197184, "mutations": ["aa:orf1a:I300F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf1b:E245D", "aa:orf1b:M2025I", "aa:orf1b:T2084I", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:A398V"]}, "B.1.1.207": {"nsamples": 440, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": 0.26053760539545523, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 20.706818181818182, "mutations": ["aa:orf1a:A3571V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:M:V70F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.466": {"nsamples": 33, "lastcoldate": "2020-08-18", "residual": -1.2030274650750468, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 11.424242424242424, "mutations": ["aa:orf1a:D1036E", "aa:orf1a:S3099L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.329": {"nsamples": 121, "lastcoldate": "2021-04-06", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 17.60330578512397, "mutations": ["aa:orf1a:K623Q", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.424": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2021-02-05", "residual": -1.5344887729689212, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 19.3125, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:S443F", "aa:orf1a:L1130F", "aa:N:P6L"]}, "B.1.36.28": {"nsamples": 132, "lastcoldate": "2021-01-05", "residual": -0.14328497381772035, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 20.977272727272727, "mutations": ["aa:orf1a:V561A", "aa:orf1a:E2088G", "aa:orf1a:V2943I", "aa:orf1a:A3523V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "B.1.177.20": {"nsamples": 485, "lastcoldate": "2021-03-31", "residual": 1.1148674552131659, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 16.278350515463917, "mutations": ["aa:orf1a:A3454V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:E583D", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:Q4100H"]}, "B.1.362.2": {"nsamples": 99, "lastcoldate": "2021-02-02", "residual": 0.5056322344828329, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 19.454545454545453, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:P2046L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1248F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L52F", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:W193L", "aa:orf3a:W193*", "aa:N:S194L"]}, "B.1.177.2": {"nsamples": 162, "lastcoldate": "2021-01-26", "residual": -1.3617554152783864, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 18.166666666666668, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:F43V", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.160.23": {"nsamples": 125, "lastcoldate": "2021-01-19", "residual": -1.686214019428663, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 25.064, "mutations": ["aa:orf1a:S1478Y", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7a:F6L", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:N:R385K"]}, "B.1.258.5": {"nsamples": 61, "lastcoldate": "2020-11-28", "residual": -0.14328497381772035, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 25.491803278688526, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:P976L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:L189F", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:S:V772I", "aa:orf3a:Q185H", "aa:N:T334I"]}, "B.1.258.6": {"nsamples": 39, "lastcoldate": "2021-02-08", "residual": -1.07697879869833, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 21.23076923076923, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G"]}, "B.1.177.38": {"nsamples": 74, "lastcoldate": "2021-03-17", "residual": 1.399644071870764, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 21.04054054054054, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:K1045N", "aa:N:A220V", "aa:N:P365S", "aa:orf10:R24L", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.236": {"nsamples": 96, "lastcoldate": "2021-02-26", "residual": 0.5056322344828329, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 19.260416666666668, "mutations": ["aa:orf1a:T727I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:M:A2V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:M322I", "aa:orf3a:G254V", "aa:orf1b:T794I"]}, "B.1.1.351": {"nsamples": 123, "lastcoldate": "2021-04-02", "residual": -1.07697879869833, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 24.024390243902438, "mutations": ["aa:orf1a:K3162E", "aa:orf1a:P3504H", "aa:orf1b:K134Q", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1064I", "aa:orf1b:G1450R", "aa:S:L54F", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.460": {"nsamples": 34, "lastcoldate": "2021-02-19", "residual": -1.07697879869833, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 20.264705882352942, "mutations": ["aa:orf1a:T2800I", "aa:orf1a:T4087I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:E972G", "aa:orf1a:T4249I", "aa:orf1b:A576S", "aa:M:L17F", "aa:N:D3Y", "aa:N:M234I"]}, "B.1.177.55": {"nsamples": 312, "lastcoldate": "2021-02-24", "residual": 0.8300908386331095, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 18.352564102564102, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:M:D209Y", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.43": {"nsamples": 416, "lastcoldate": "2021-03-25", "residual": -1.606850044365764, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 18.826923076923077, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:I1539T", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.9": {"nsamples": 383, "lastcoldate": "2021-02-17", "residual": -1.07697879869833, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 17.48302872062663, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D80Y", "aa:S:N164T", "aa:S:A222V", "aa:S:A262S", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.258.4": {"nsamples": 184, "lastcoldate": "2021-02-28", "residual": -1.3617554152783864, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 25.907608695652176, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:P976L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:L189F", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:S:V772I", "aa:S:G1219V", "aa:orf3a:Q185H", "aa:N:T334I"]}, "B.1.177.11": {"nsamples": 435, "lastcoldate": "2021-01-02", "residual": 0.18117363033255626, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 18.944827586206898, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:D1163Y", "aa:S:G1167V", "aa:N:A220V", "aa:N:P365S", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:A3571V"]}, "G.1": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2020-11-20", "residual": -1.07697879869833, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 19.944444444444443, "mutations": ["aa:orf1a:G400D", "aa:orf1a:G603S", "aa:orf1a:M1769I", "aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:orf7b:H37L", "aa:orf7b:H37Q"]}, "B.1.1.288": {"nsamples": 474, "lastcoldate": "2020-12-20", "residual": -0.26933364019443723, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 17.82278481012658, "mutations": ["aa:orf1a:S376L", "aa:orf1a:P3371L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A572S", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:D377Y", "aa:N:K374R"]}, "B.1.177.54": {"nsamples": 1116, "lastcoldate": "2021-05-05", "residual": -0.7525201945480533, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 20.942652329749105, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V163I", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.413": {"nsamples": 52, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": -1.686214019428663, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 21.634615384615383, "mutations": ["aa:orf1a:S944L", "aa:orf1b:G128C", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D138Y", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:M:I73M", "del:28090:6", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "AK.1": {"nsamples": 53, "lastcoldate": "2020-12-19", "residual": -1.3617554152783864, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 21.0188679245283, "mutations": ["aa:orf1a:L758V", "aa:orf1a:S2103F", "aa:orf1a:A2994V", "aa:orf1a:V3976F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P2162S", "aa:S:D614G", "aa:S:V1122L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:G993C"]}, "B.1.177.84": {"nsamples": 88, "lastcoldate": "2021-01-31", "residual": 0.141491642762336, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 18.886363636363637, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2376I", "aa:S:A222V", "aa:S:A262S", "aa:S:P272L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:R68I", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.214": {"nsamples": 16546, "lastcoldate": "2021-05-07", "residual": -0.031241714850657184, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 18.900459325516742, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1567L", "aa:orf1b:R2684I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:M234I"]}, "B.1.273": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2021-03-01", "residual": 0.8160854313009974, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 11.294117647058824, "mutations": ["aa:orf1a:S4398L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:P2046S"]}, "B.1.597": {"nsamples": 50, "lastcoldate": "2021-03-25", "residual": 1.38563866446111, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 19.02, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S186Y"]}, "AH.2": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2021-01-25", "residual": -0.0639209986772798, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 16.0, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D2179A", "aa:S:V3G", "aa:S:D614G", "aa:S:L841F", "aa:S:T859I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.184": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-09-23", "residual": -0.31601833150825515, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 8.76923076923077, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.506": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2021-03-29", "residual": 0.9024521100299524, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 19.3125, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1351F", "aa:orf1b:T2084I", "aa:S:D614G", "aa:N:T166I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.396": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2021-02-24", "residual": -1.5274860693028651, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 15.555555555555555, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:M153T", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.36.34": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2021-01-11", "residual": -0.4350642940638328, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 21.678571428571427, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:T1543I", "aa:orf1b:S1779C", "aa:orf7a:E121*", "aa:orf7a:*122L"]}, "B.1.1.121": {"nsamples": 168, "lastcoldate": "2021-04-21", "residual": 1.14754673911733, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 13.285714285714286, "mutations": ["aa:orf1a:H2659Y", "aa:orf1a:R3339S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:A98V"]}, "B.1.1.417": {"nsamples": 89, "lastcoldate": "2021-03-09", "residual": 1.0681827639768895, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 20.865168539325843, "mutations": ["aa:orf1a:N869S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1273L", "aa:orf1b:D1869Y", "aa:S:D80Y", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:P1177L"]}, "B.1.1.157": {"nsamples": 649, "lastcoldate": "2021-02-11", "residual": -1.2893941438815435, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 16.26502311248074, "mutations": ["aa:orf1a:M3669I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1404M", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A1298V", "aa:orf1b:K1383R"]}, "B.1.316": {"nsamples": 2, "lastcoldate": "2020-06-16", "residual": 1.2665927017504492, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 12.0, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1848Y", "aa:orf1b:D2090Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:D75E"]}, "B.1.1.453": {"nsamples": 89, "lastcoldate": "2021-03-09", "residual": -0.9976148235578894, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 15.213483146067416, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:G212C", "aa:orf1a:A405D", "aa:orf1a:A2636V", "aa:orf6:I26M"]}, "B.1.361": {"nsamples": 335, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": 1.233913417846285, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 19.692537313432837, "mutations": ["aa:orf1a:D147G", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G400S", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1567L", "aa:orf1b:K2538R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S190I"]}, "B.1.500": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-09-20", "residual": 0.015442976385619133, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 15.7, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:D3240A", "aa:orf1a:V3810F", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:orf1b:T2517I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G18V", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:V3005I"]}, "B.1.595.2": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2020-11-05", "residual": -1.0839815024419277, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 17.454545454545453, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T2977K", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1a:V3747I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:M:D209Y", "aa:orf8:S24L", "aa:orf1a:T1542I"]}, "B.1.544": {"nsamples": 102, "lastcoldate": "2021-03-20", "residual": -0.7992048857843297, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 22.313725490196077, "mutations": ["aa:orf1a:P1220H", "aa:orf1a:T1665I", "aa:orf1a:A2690V", "aa:orf1a:N3491S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:P26L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S202R", "aa:S:Q675H"]}, "C.18": {"nsamples": 142, "lastcoldate": "2021-01-17", "residual": 0.4192655556763363, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 18.514084507042252, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S2563A", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.69": {"nsamples": 404, "lastcoldate": "2021-03-25", "residual": 0.141491642762336, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 17.13118811881188, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:S:S929T"]}, "B.1.177.18": {"nsamples": 547, "lastcoldate": "2021-03-15", "residual": -1.4014374028486065, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 17.6581352833638, "mutations": ["aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:E583D", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:K16N", "aa:orf7a:T120I", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.36.20": {"nsamples": 47, "lastcoldate": "2020-12-16", "residual": 1.4790080469336628, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 16.76595744680851, "mutations": ["aa:orf1a:H110Y", "aa:orf1a:M3312T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "ins:29594:2"]}, "B.1.421": {"nsamples": 47, "lastcoldate": "2020-12-26", "residual": 1.5583720219965616, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 17.72340425531915, "mutations": ["aa:orf1a:A1679V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A2168T", "aa:S:D614G", "aa:orf8:A65S", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:H110Y", "aa:orf1a:T727I"]}, "B.1.258.10": {"nsamples": 72, "lastcoldate": "2020-12-05", "residual": -0.1829669613879406, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 20.041666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:S2552A", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G"]}, "B.1.240.2": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2021-01-02", "residual": 1.154549442783386, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 20.346153846153847, "mutations": ["aa:orf1a:K1077N", "aa:orf1a:T2158I", "aa:orf1b:K82R", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q1441H", "aa:S:D614G", "aa:orf8:L4F", "aa:N:S194L", "aa:S:W64L"]}, "B.1.177.6": {"nsamples": 691, "lastcoldate": "2021-03-07", "residual": -1.1166607862685503, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 18.908827785817657, "mutations": ["aa:orf1a:P2018S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:S:Q23H", "aa:orf1a:E3608D"]}, "B.1.36.2": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": 0.10180965519211573, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 22.244444444444444, "mutations": ["aa:orf1a:V561A", "aa:orf1a:K798N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A2028S", "aa:S:D614G", "aa:S:P1263T", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:Q185H", "aa:orf3a:G224C", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:T3255A", "aa:S:A771S", "aa:orf7a:Q62*"]}, "B.1.160.13": {"nsamples": 34, "lastcoldate": "2021-02-18", "residual": -1.7258960069988831, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 27.38235294117647, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:H93Y", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf1b:M897I", "aa:orf1b:K1828N", "aa:orf8:S54L"]}, "B.1.177.59": {"nsamples": 38, "lastcoldate": "2021-03-22", "residual": 0.7904088510628892, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 21.31578947368421, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:N1555S", "aa:orf8:T11I"]}, "B.1.1.426": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2020-12-02", "residual": -1.0839815024419277, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 13.0, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A869V", "aa:orf1b:V957I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.541": {"nsamples": 165, "lastcoldate": "2021-02-24", "residual": 0.4192655556763363, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 18.6, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M1499I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S187L", "aa:S:A67S"]}, "L.1": {"nsamples": 444, "lastcoldate": "2020-05-14", "residual": -1.0909842061079837, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 15.731981981981981, "mutations": ["aa:orf1a:P2046L", "del:6427:63", "aa:orf1a:P2221S", "aa:orf1a:N3985H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:M1237T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.48": {"nsamples": 238, "lastcoldate": "2021-01-27", "residual": -0.5074255655382173, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 18.945378151260503, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.560": {"nsamples": 43, "lastcoldate": "2021-04-18", "residual": -1.5741707605391415, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 16.325581395348838, "mutations": ["aa:orf1a:D3042N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.341": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2020-10-07", "residual": -1.4014374028486065, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 16.333333333333332, "mutations": ["aa:orf1a:L1434I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R2257S", "aa:S:D178N", "aa:S:D614G", "aa:S:V1104L", "aa:orf3a:A99S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.7": {"nsamples": 620311, "lastcoldate": "2021-06-02", "residual": -0.5541102567744935, "max_ndiffs": 55, "mean_ndiffs": 38.77163068202886, "mutations": ["aa:orf1a:T1001I", "aa:orf1a:A1708D", "aa:orf1a:I2230T", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "del:21765:6", "del:21991:3", "aa:S:N501Y", "aa:S:A570D", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:T716I", "aa:S:S982A", "aa:S:D1118H", "aa:orf8:Q27*", "aa:orf8:R52I", "aa:orf8:Y73C", "aa:N:D3H", "aa:N:D3V", "aa:N:D3E", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:S235F", "del:28271:1"]}, "B.1.177.58": {"nsamples": 503, "lastcoldate": "2021-03-03", "residual": -1.4411193904188269, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 19.284294234592444, "mutations": ["aa:orf1a:P2260L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T64I", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.516": {"nsamples": 177, "lastcoldate": "2020-08-14", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 13.322033898305085, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:R209I", "aa:orf10:R24L"]}, "B.1.160.28": {"nsamples": 155, "lastcoldate": "2021-03-24", "residual": 0.4262682593423923, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 25.348387096774193, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:G25C", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf1b:D2090Y"]}, "C.8": {"nsamples": 186, "lastcoldate": "2021-01-04", "residual": 1.0611800603108335, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 15.053763440860216, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.599": {"nsamples": 106, "lastcoldate": "2021-03-03", "residual": -0.26933364019443723, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 20.20754716981132, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:M153I", "aa:S:D614G", "aa:S:Q675H", "aa:orf3a:L15F", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:P207L"]}, "L.4": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-09-11", "residual": -1.1236634900121478, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 17.692307692307693, "mutations": ["aa:orf1a:A2199V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1881G", "aa:S:D614G", "aa:S:V1104L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:Q923H"]}, "B.1.1.72": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2021-01-04", "residual": 0.5056322344828329, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 16.625, "mutations": ["aa:orf1a:L2688F", "aa:orf1a:V2715I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:T747I", "aa:E:F26L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:27968:2"]}, "B.1.593": {"nsamples": 59, "lastcoldate": "2021-01-11", "residual": 0.4659502469126126, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 16.796610169491526, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A1397V", "aa:orf1a:R3993H", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1245S", "aa:orf1b:P1652S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L"]}, "B.1.1.271": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2020-05-06", "residual": -0.7268436143874868, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 12.6875, "mutations": ["aa:orf1a:D1036E", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A2132V", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:R134H", "aa:orf1a:S944L", "aa:S:Q677H"]}, "B.1.36.39": {"nsamples": 144, "lastcoldate": "2021-01-25", "residual": -1.1166607862685503, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 18.72222222222222, "mutations": ["aa:orf1a:V561A", "aa:orf1a:F685S", "aa:orf1a:S2103F", "aa:orf1a:T3224N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S171L", "aa:N:S194L"]}, "B.1.258.12": {"nsamples": 66, "lastcoldate": "2021-03-24", "residual": -0.1829669613879406, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 21.393939393939394, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "aa:orf1b:V1706I", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.159": {"nsamples": 144, "lastcoldate": "2021-03-29", "residual": -0.6731562194851545, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 22.04861111111111, "mutations": ["aa:orf1a:G30A", "aa:orf1a:K2200N", "aa:orf1a:T2952I", "aa:orf1a:D2980A", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q813H", "aa:S:D614G", "aa:N:P6L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:A414S"]}, "B.1.362.1": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-11-12", "residual": 0.7507268634926689, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 17.4, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G295C", "aa:orf1a:P926S", "aa:orf1a:P2046L", "aa:orf1a:N2498K", "aa:orf1a:A3523V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:A684V", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "AS.2": {"nsamples": 42, "lastcoldate": "2021-02-26", "residual": -0.5471075531084375, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 20.142857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:D203N", "aa:orf1a:D589G", "aa:orf1a:S2396I", "aa:orf1a:K2533R", "aa:orf1a:G4203S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A522S", "aa:S:D614G", "aa:S:Q675R", "aa:S:D936H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:A211V"]}, "B.1.36.35": {"nsamples": 262, "lastcoldate": "2021-05-03", "residual": -1.4411193904188269, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 21.18702290076336, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:K16N", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "aa:S:L452R", "aa:S:E583D", "aa:orf1b:T794N"]}, "B.1.177.75": {"nsamples": 630, "lastcoldate": "2021-04-20", "residual": -0.42806159039777675, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 19.78253968253968, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.36.7": {"nsamples": 104, "lastcoldate": "2021-05-07", "residual": 0.8697728262033297, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 14.403846153846153, "mutations": ["aa:orf1a:Y3649C", "aa:orf1b:P314L", "del:22189:3", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L"]}, "K.3": {"nsamples": 120, "lastcoldate": "2020-12-09", "residual": -0.10360298624750007, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 17.8, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D729Y", "aa:orf1b:P1570L", "aa:S:D614G", "aa:S:A626S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf7b:H42Y"]}, "B.1.486": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-09-09", "residual": -1.2100301688186446, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 22.555555555555557, "mutations": ["aa:orf1a:I201V", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A3070V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1038I", "del:21985:9", "aa:S:T478K", "aa:S:S494P", "aa:S:D614G", "aa:S:I870V", "aa:orf3a:Q57H", "aa:E:T30I", "aa:orf7a:S83L", "aa:S:Q183H", "aa:S:N501Y", "aa:M:A2V"]}, "B.1.160.7": {"nsamples": 277, "lastcoldate": "2021-02-18", "residual": 1.3202800967303232, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 24.96028880866426, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:S:H655Y", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "del:29747:12"]}, "B.1.177.26": {"nsamples": 75, "lastcoldate": "2020-12-28", "residual": 0.06212766762189545, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 24.413333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:P1640S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:E583Q", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:A66T", "aa:N:A55S", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:K2589R"]}, "B.1.177.63": {"nsamples": 282, "lastcoldate": "2021-03-21", "residual": -1.1960247614089907, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 22.28723404255319, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:M2796I"]}, "B.1.1.152": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2021-03-12", "residual": -1.3617554152783864, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 14.0, "mutations": ["aa:orf1a:A486V", "aa:orf1a:V1291F", "aa:orf1a:V3660M", "aa:orf1a:T4087I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2236F", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.373": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2021-03-01", "residual": -0.02423901118460114, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 19.15, "mutations": ["aa:orf1a:P1158S", "aa:orf1a:T1567I", "aa:orf1a:A2344V", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "ins:28251:3", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:28254:1"]}, "B.1.1.449": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2020-10-19", "residual": 1.1148674552131659, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 12.0, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:E180G", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:D377Y", "aa:N:P383L"]}, "B.1.1.31": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-09-25", "residual": 1.5186900344263414, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 14.461538461538462, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.141": {"nsamples": 294, "lastcoldate": "2021-05-15", "residual": 1.2735954054165053, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 17.867346938775512, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:M153T", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:D222Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:V3976F", "aa:N:A308S"]}, "B.1.264.1": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2021-02-11", "residual": 0.18117363033255626, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 17.933333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3711F", "aa:orf1a:S3885F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:P42L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:P207H"]}, "B.1.1.397": {"nsamples": 274, "lastcoldate": "2021-04-27", "residual": -1.1166607862685503, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 20.405109489051096, "mutations": ["aa:orf1a:A516V", "aa:orf1a:T708I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2453I", "aa:S:D138Y", "aa:S:M153T", "aa:S:D614G", "aa:orf7b:T40I", "aa:orf8:V62L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:M234I"]}, "B.1.524": {"nsamples": 441, "lastcoldate": "2021-05-21", "residual": 1.2735954054165053, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 19.426303854875282, "mutations": ["aa:orf1a:T2016I", "aa:orf1a:T2791I", "aa:orf1a:T3287A", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1351F", "aa:S:D614G", "aa:S:A701V", "aa:N:S194L"]}, "B.1.591": {"nsamples": 55, "lastcoldate": "2021-02-23", "residual": -1.6465320318584427, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 20.12727272727273, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A2330S", "aa:orf1a:V3107G", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1a:P4337S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:S24L", "aa:N:T205I"]}, "B.1.1.267": {"nsamples": 53, "lastcoldate": "2021-03-10", "residual": 0.7764034437307771, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 11.79245283018868, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A440V", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:Q240K"]}, "B.1.1.193": {"nsamples": 4, "lastcoldate": "2020-11-17", "residual": 0.7110448759224487, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 19.5, "mutations": ["aa:orf1a:A2785V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A2268S", "aa:S:D614G", "aa:S:L938F", "aa:M:K15N", "aa:orf8:G8*", "aa:orf8:D35Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.272": {"nsamples": 171, "lastcoldate": "2020-10-04", "residual": 0.8697728262033297, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 17.5906432748538, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E1264D", "aa:S:A520S", "aa:S:D614G", "aa:N:D22G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:S944L"]}, "B.1.1.153": {"nsamples": 684, "lastcoldate": "2021-04-27", "residual": 0.9094548136960084, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 22.285087719298247, "mutations": ["aa:orf1a:A3143V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S997P", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:A54S", "aa:N:G204V"]}, "B.1.36.31": {"nsamples": 287, "lastcoldate": "2021-04-10", "residual": -1.4808013779890472, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 27.700348432055748, "mutations": ["aa:orf1a:A486V", "aa:orf1a:V3653F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:R102S", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T24I", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:T175I", "aa:orf7b:A15S", "aa:N:S194L"]}, "B.1.177.24": {"nsamples": 700, "lastcoldate": "2021-03-16", "residual": 0.8697728262033297, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 17.735714285714284, "mutations": ["aa:orf1a:L2869F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf3a:D27Y", "aa:orf8:D35Y"]}, "B.1.1.452": {"nsamples": 3, "lastcoldate": "2020-09-16", "residual": -1.07697879869833, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 14.0, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:M153T", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.427": {"nsamples": 4, "lastcoldate": "2020-09-26", "residual": -1.5274860693028651, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 21.0, "mutations": ["aa:orf1a:K680N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:F1960L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S40P", "aa:orf3a:G174C", "aa:N:A182S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:A398V", "aa:orf1a:E743D", "aa:orf1a:T4249I"]}, "B.1.160.15": {"nsamples": 142, "lastcoldate": "2021-03-12", "residual": 0.7110448759224487, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 27.06338028169014, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "B.1.160.26": {"nsamples": 326, "lastcoldate": "2021-04-08", "residual": -1.4411193904188269, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 27.13803680981595, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:T151I", "aa:orf7b:C41F", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf1a:V3593I"]}, "B.1.258.9": {"nsamples": 177, "lastcoldate": "2021-01-25", "residual": 1.4393260593634425, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 22.214689265536723, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:S:G1223S", "aa:orf7b:A15S"]}, "B.1.160.16": {"nsamples": 703, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": 0.7110448759224487, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 26.773826458036986, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7a:T14I", "aa:orf8:S24L", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "B.1.160.31": {"nsamples": 100, "lastcoldate": "2021-03-19", "residual": 0.06212766762189545, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 27.53, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:D27Y", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "B.1.160.22": {"nsamples": 94, "lastcoldate": "2021-02-13", "residual": 0.995821492502505, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 24.106382978723403, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:N:R385K"]}, "B.1.160.11": {"nsamples": 130, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": 0.06212766762189545, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 27.423076923076923, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:S:V6F", "aa:orf1a:R3993L"]}, "B.1.177.86": {"nsamples": 4086, "lastcoldate": "2021-05-06", "residual": -1.1166607862685503, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 20.43979441997063, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf7b:E39*", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.474": {"nsamples": 363, "lastcoldate": "2021-03-22", "residual": -1.1166607862685503, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 24.40495867768595, "mutations": ["aa:orf1a:L92F", "aa:orf1a:A2785T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1149L", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:D796Y", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S216P", "aa:orf8:T26N", "aa:N:T205I"]}, "B.1.160.32": {"nsamples": 136, "lastcoldate": "2021-03-26", "residual": -1.1563427738387706, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 22.71323529411765, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:T588S", "aa:S:D614G", "aa:S:V1104L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "B.1.177.51": {"nsamples": 120, "lastcoldate": "2021-04-20", "residual": 0.995821492502505, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 17.666666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:H374Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.35": {"nsamples": 1223, "lastcoldate": "2021-03-19", "residual": -1.4411193904188269, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 20.313164349959116, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:N:P365S", "aa:orf10:V30L"]}, "AE.8": {"nsamples": 1157, "lastcoldate": "2021-03-12", "residual": -0.3486976153348778, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 17.238547968885047, "mutations": ["aa:orf1a:P361L", "aa:orf1a:R560C", "aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1b:G170C", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.32": {"nsamples": 491, "lastcoldate": "2021-03-30", "residual": -1.7655779945691035, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 17.272912423625254, "mutations": ["aa:orf1a:A1812V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.36.27": {"nsamples": 216, "lastcoldate": "2021-04-16", "residual": -1.7258960069988831, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 18.944444444444443, "mutations": ["aa:orf1a:V561A", "aa:orf1a:V1056L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:S194L"]}, "C.16": {"nsamples": 478, "lastcoldate": "2021-04-22", "residual": -1.732898710742481, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 26.232217573221757, "mutations": ["aa:orf1a:E1013K", "aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:A3143V", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1a:T4175I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L452R", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.21": {"nsamples": 6674, "lastcoldate": "2021-04-05", "residual": 1.154549442783386, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 19.12121666167216, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "W.1": {"nsamples": 75, "lastcoldate": "2021-03-27", "residual": 0.6713628883522283, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 22.64, "mutations": ["aa:orf1a:A903V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W131C", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.25": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2020-10-29", "residual": -0.6264715282488781, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 18.2972972972973, "mutations": ["aa:orf1a:Y534C", "aa:orf1a:K2208N", "aa:orf1a:P4220S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1521V", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.392": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2021-01-04", "residual": 0.141491642762336, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 13.055555555555555, "mutations": ["aa:orf1a:K1132R", "aa:orf1a:V2149F", "aa:orf1a:P3371S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1427L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:S904L"]}, "B.1.476": {"nsamples": 2, "lastcoldate": "2020-09-22", "residual": -0.8785688609247703, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 18.5, "mutations": ["aa:orf1a:T512I", "aa:orf1a:Q2702H", "aa:orf1b:V193I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S165F", "aa:N:P199L"]}, "A.19": {"nsamples": 44, "lastcoldate": "2021-02-22", "residual": -1.6535347356020402, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 15.386363636363637, "mutations": ["aa:orf1a:I4098V", "aa:S:D614G", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S202N"]}, "B.1.388": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2020-09-09", "residual": -0.4350642940638328, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 13.0, "mutations": ["aa:orf1a:H2125N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V839L", "del:21765:6", "aa:S:D614G", "aa:N:P365S"]}, "A.18": {"nsamples": 4, "lastcoldate": "2020-10-19", "residual": -1.5671680568730855, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 13.0, "mutations": ["aa:orf1a:Q990L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S202N"]}, "B.1.613": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-06-01", "residual": -1.1306661936782039, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 9.542857142857143, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T346I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "C.7": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2020-07-13", "residual": 0.2932168892996194, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 15.535714285714286, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:D27Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.28": {"nsamples": 82, "lastcoldate": "2021-03-03", "residual": 0.9561395050098264, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 16.378048780487806, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2073L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.41": {"nsamples": 309, "lastcoldate": "2021-04-08", "residual": -0.1829669613879406, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 22.72491909385113, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S961L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:P1162S", "aa:N:A220V", "aa:N:P365S", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.191": {"nsamples": 198, "lastcoldate": "2020-10-19", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 10.383838383838384, "mutations": ["del:1598:6", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:G769V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:D341N"]}, "B.1.258.11": {"nsamples": 2160, "lastcoldate": "2021-04-05", "residual": -1.4014374028486065, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 24.304166666666667, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:L4064F", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:S1733C", "aa:orf1a:S1733I", "aa:S:V143F"]}, "B.1.221.3": {"nsamples": 1142, "lastcoldate": "2021-03-01", "residual": -1.4014374028486065, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 19.21891418563923, "mutations": ["aa:orf1a:H1113Y", "aa:orf1a:G3278C", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S98F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q38R", "aa:orf3a:G172R", "aa:orf3a:V202L", "aa:orf8:A65V", "aa:N:P199L"]}, "B.1.1.224": {"nsamples": 27, "lastcoldate": "2021-02-12", "residual": 1.4393260593634425, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 18.037037037037038, "mutations": ["aa:orf1a:G1069R", "aa:orf1a:S2517F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1427S", "aa:orf1b:P1821S", "aa:S:D138Y", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.12": {"nsamples": 5972, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": -1.4154428102582604, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 19.6280977896852, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:R122I", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:N:P365S"]}, "AQ.2": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-09-21", "residual": 1.154549442783386, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 14.777777777777779, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M1765V", "aa:S:R346S", "aa:S:D614G", "aa:N:V72I", "aa:N:P199S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.298": {"nsamples": 674, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": 1.4323233556973864, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 20.287833827893174, "mutations": ["del:516:3", "del:6506:3", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T730I", "del:21765:6", "aa:S:Y453F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:H182Y", "aa:N:S194L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:29726:1", "aa:orf1a:L2062F"]}, "B.1.1.431": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2020-10-20", "residual": 1.0285007764066691, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 17.244444444444444, "mutations": ["aa:orf1a:T4207I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1003G", "aa:orf1b:L1203I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A1352T", "aa:orf1a:S2797F", "aa:orf1b:Y2018H"]}, "B.1.258.17": {"nsamples": 4321, "lastcoldate": "2021-05-18", "residual": 0.8300908386331095, "max_ndiffs": 50, "mean_ndiffs": 32.50867854663272, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:P976L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "aa:orf1b:P1570L", "aa:orf1b:E1977D", "del:21765:6", "aa:S:L189F", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:S:V772I", "aa:orf3a:Q185H", "aa:orf8:E64*", "aa:N:M234I"]}, "B.1.536": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2021-02-15", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 17.470588235294116, "mutations": ["aa:orf1a:L3027F", "aa:orf1a:T3567N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:I1755T", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:D27Y", "aa:orf3a:T229I", "aa:orf8:E19*", "aa:N:G215V", "aa:orf1b:L1220F"]}, "B.1.36.33": {"nsamples": 122, "lastcoldate": "2021-03-29", "residual": -0.2623309365283812, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 22.401639344262296, "mutations": ["aa:orf1a:A2891T", "aa:orf1a:T3459M", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1219T", "aa:orf1b:K1383R", "aa:orf1b:P1851S", "del:22189:3", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:Q83R", "aa:N:D144N", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:R24C", "aa:orf1a:L1145F"]}, "B.1.177.27": {"nsamples": 99, "lastcoldate": "2021-03-03", "residual": -0.2623309365283812, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 21.434343434343436, "mutations": ["aa:orf1a:D1933A", "aa:orf1a:M3221I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:Q613H", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L41F", "aa:orf3a:G100C", "aa:N:A220V", "aa:N:P383S", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.160.8": {"nsamples": 639, "lastcoldate": "2021-03-25", "residual": -0.5471075531084375, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 26.380281690140844, "mutations": ["aa:orf1a:V1550F", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S253F", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "del:29588:1", "aa:orf1a:L2688F", "aa:orf1a:T1754I"]}, "B.1.88.1": {"nsamples": 169, "lastcoldate": "2021-03-25", "residual": -1.0909842061079837, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 14.603550295857989, "mutations": ["aa:orf1a:K1655N", "aa:orf1a:R3480S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V13L", "aa:orf3a:T175I", "aa:orf3a:V202I", "aa:N:S194L"]}, "B.1.1.377": {"nsamples": 622, "lastcoldate": "2021-04-21", "residual": 0.022445680051675174, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 14.993569131832798, "mutations": ["aa:orf1a:A1268V", "aa:orf1b:P255S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:I233V", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "C.30.1": {"nsamples": 106, "lastcoldate": "2020-12-28", "residual": -0.5471075531084375, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 25.12264150943396, "mutations": ["aa:orf1a:E913D", "aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:T1542I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S255F", "aa:S:D614G", "aa:S:K1073N", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:T151I", "aa:orf1b:V157L"]}, "C.20": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2021-02-10", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 16.833333333333332, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.40": {"nsamples": 150, "lastcoldate": "2021-03-10", "residual": -0.6731562194851545, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 20.713333333333335, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:N:P365S"]}, "B.1.177.42": {"nsamples": 777, "lastcoldate": "2021-03-22", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 20.214929214929214, "mutations": ["aa:orf1a:S166G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:N:D377Y", "aa:N:S33G", "aa:N:P365S"]}, "B.1.1.100": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-11-09", "residual": -1.1166607862685503, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 19.125, "mutations": ["aa:orf1a:A1078V", "aa:orf1a:G1946S", "aa:orf1a:K2622N", "aa:orf1a:S3732A", "aa:orf1a:V3976F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K709N", "aa:S:T385I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.346": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2020-10-26", "residual": -1.1166607862685503, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 13.53125, "mutations": ["del:222:1", "aa:orf1a:Q607H", "aa:orf1a:M2194I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T797I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.463": {"nsamples": 120, "lastcoldate": "2020-10-31", "residual": -1.07697879869833, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 16.125, "mutations": ["aa:orf1a:S944L", "aa:orf1a:H2520Q", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:F59Y", "aa:S:P384L", "aa:S:D614G", "aa:S:P812S", "aa:orf3a:W45L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:D144Y", "aa:N:N196I"]}, "B.1.1.355": {"nsamples": 50, "lastcoldate": "2021-01-30", "residual": 0.2138529142367205, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 19.22, "mutations": ["aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "del:27869:1", "aa:orf7b:E39Q", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:V862I", "aa:orf1b:E735D"]}, "B.1.1.359": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2021-01-12", "residual": -0.8388868733545499, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 16.31578947368421, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:N11S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "AS.1": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2020-12-20", "residual": -1.4808013779890472, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 18.451612903225808, "mutations": ["aa:orf1a:P3395S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V345L", "aa:S:L54F", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:A211V"]}, "B.1.127": {"nsamples": 466, "lastcoldate": "2021-03-13", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 18.817596566523605, "mutations": ["aa:orf1a:A206V", "aa:orf1a:D992Y", "aa:orf1a:H2092Y", "aa:orf1a:V3510F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H873R", "aa:orf1b:A1219T", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G174D", "aa:M:D3G"]}, "B.1.1.428": {"nsamples": 70, "lastcoldate": "2021-04-13", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 19.214285714285715, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.36.25": {"nsamples": 355, "lastcoldate": "2021-02-15", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 20.963380281690142, "mutations": ["aa:orf1a:K1202N", "aa:orf1a:V2795I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:S813I", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:V77F", "aa:orf7a:Q62H", "aa:N:N8Y", "aa:N:S194L", "aa:N:P383S"]}, "AA.3": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2021-01-30", "residual": -1.844941969709544, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 22.448275862068964, "mutations": ["aa:orf1a:E37K", "aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "N.6": {"nsamples": 116, "lastcoldate": "2021-02-03", "residual": 1.5910513059007259, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 15.956896551724139, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf6:I33T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T"]}, "AK.2": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2020-12-06", "residual": 0.7507268634926689, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 19.94736842105263, "mutations": ["aa:orf1a:L758V", "aa:orf1a:S2103F", "aa:orf1a:S2132G", "aa:orf1a:V3976F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1848Y", "aa:S:D614G", "aa:S:I834T", "aa:orf7a:V29L", "aa:orf7a:G38V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.385": {"nsamples": 128, "lastcoldate": "2021-05-31", "residual": 0.4262682593423923, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 17.0703125, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:Q675H", "aa:orf3a:A23S", "aa:orf7a:A8S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "AC.1": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2021-02-03", "residual": -1.844941969709544, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 21.846153846153847, "mutations": ["aa:orf1a:S911F", "aa:orf1a:T2166I", "aa:orf1a:M3669I", "aa:orf1a:T3750I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf10:V32L", "aa:orf1a:A4257V"]}, "B.1.1.375": {"nsamples": 43, "lastcoldate": "2021-05-06", "residual": -1.844941969709544, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 25.976744186046513, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1187I", "aa:orf1b:V2233I", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:S:S689R", "aa:orf8:R52K", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:K3353R"]}, "AE.6": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-11-22", "residual": 0.6713628883522283, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 16.166666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:E37D", "aa:orf1a:A1812D", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:P314L"]}, "AE.7": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2020-11-12", "residual": 1.399644071870764, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 15.333333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:S279F", "aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1a:F2321I", "aa:orf1a:T2906I", "aa:orf1b:S2294I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T12I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.258.21": {"nsamples": 108, "lastcoldate": "2021-02-13", "residual": 0.06212766762189545, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 23.37962962962963, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:N:T391I"]}, "B.1.258.18": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2020-12-20", "residual": 0.34690428420195174, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 26.142857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:T4088I", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:orf7b:F19L", "aa:orf8:I9T"]}, "AG.1": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2021-02-03", "residual": 0.4659502469126126, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 14.833333333333334, "mutations": ["aa:orf1a:T4161N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q813H", "aa:orf1b:Q2425H", "aa:S:D614G", "aa:orf8:I10T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.73": {"nsamples": 962, "lastcoldate": "2021-04-30", "residual": -1.2823914402154875, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 21.448024948024948, "mutations": ["aa:orf1a:G519S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:Q1071L", "aa:orf3a:T223N", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.428.2": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2021-04-16", "residual": -1.4014374028486065, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 21.153846153846153, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T346I", "aa:orf1a:H388Y", "aa:orf1a:P1596L", "aa:orf1a:A2690V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:T205I"]}, "B.1.433": {"nsamples": 165, "lastcoldate": "2021-03-19", "residual": 0.30021959296567546, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 15.066666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S2193F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I", "aa:N:D377Y"]}, "B.1.1.486": {"nsamples": 345, "lastcoldate": "2021-04-03", "residual": 1.1942314302760648, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 23.57391304347826, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:T29I", "aa:S:T572I", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:M234I", "aa:S:Q677H", "aa:S:D936N", "aa:orf3a:S58N", "aa:orf3a:H78Y", "aa:orf6:I14T"]}, "B.1.1.467": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2021-02-03", "residual": 0.34690428420195174, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 19.041666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:A354V", "aa:orf1a:D1036E", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Y109C", "aa:orf3a:Q185H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "AA.4": {"nsamples": 97, "lastcoldate": "2021-03-01", "residual": 0.6316809007820081, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 23.422680412371133, "mutations": ["aa:orf1a:E37K", "aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.507": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2021-03-30", "residual": -1.686214019428663, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 15.0, "mutations": ["aa:orf1a:H388Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.36.21": {"nsamples": 501, "lastcoldate": "2021-05-22", "residual": 0.995821492502505, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 24.786427145708583, "mutations": ["aa:orf1a:P286L", "aa:orf1a:A1938S", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:D131Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L54F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:S194L", "aa:N:M234I"]}, "B.1.1.451": {"nsamples": 23, "lastcoldate": "2021-01-05", "residual": -1.8052599821393238, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 15.565217391304348, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:E156D", "aa:S:D614G", "aa:S:Q1208H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:T296I", "aa:N:T362I"]}, "B.1.561": {"nsamples": 956, "lastcoldate": "2021-05-11", "residual": -1.0839815024419277, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 23.623430962343097, "mutations": ["aa:orf1a:V751L", "aa:orf1a:I1912V", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D138Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:I62T", "aa:N:S194L", "aa:N:M234I"]}, "B.1.404": {"nsamples": 351, "lastcoldate": "2021-04-27", "residual": 1.4253206520313304, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 21.60968660968661, "mutations": ["aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K1873N", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:M2259I", "aa:orf1a:I4127V", "aa:orf1a:T484A", "aa:orf1a:M1769I"]}, "B.1.1.316": {"nsamples": 511, "lastcoldate": "2021-04-10", "residual": 1.511687330837827, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 21.38747553816047, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:Q677H", "aa:S:T732S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A1049V", "aa:orf1a:D4085G", "aa:orf1a:K1202N", "aa:orf1a:Q1592R", "aa:S:E1202Q"]}, "B.1.289": {"nsamples": 110, "lastcoldate": "2021-05-17", "residual": 0.1274862353526823, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 11.072727272727272, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:H245Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.1.312": {"nsamples": 435, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": 1.1942314302760648, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 17.33103448275862, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1851S", "aa:S:D614G", "aa:S:Q957L", "aa:orf8:D63G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.22.1": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2021-01-26", "residual": -1.686214019428663, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 23.59375, "mutations": ["aa:orf1a:P1977L", "aa:orf1a:A2994V", "aa:orf1a:A3615V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1428V", "aa:orf1b:Q1441H", "aa:orf1b:S1898A", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S58N", "aa:N:D128Y", "aa:N:D377Y"]}, "B.1.36.24": {"nsamples": 74, "lastcoldate": "2021-05-27", "residual": -1.6535347356020402, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 22.054054054054053, "mutations": ["aa:orf1a:K2067E", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:T151I", "aa:N:S194L", "aa:N:A359S", "aa:N:E378Q"]}, "B.1.1.429": {"nsamples": 159, "lastcoldate": "2021-04-22", "residual": 1.0751854676429455, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 21.18867924528302, "mutations": ["aa:orf1a:T727I", "aa:orf1a:A3357V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:E1202Q", "aa:M:A2V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:L1220F"]}, "B.1.177.39": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2021-03-02", "residual": -0.42806159039777675, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 21.73913043478261, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:S256L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:H40Y", "aa:N:A220V", "aa:N:P365S", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.382": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2020-11-05", "residual": -0.8388868733545499, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 17.5, "mutations": ["aa:orf1a:G2035R", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G1129V", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.160.33": {"nsamples": 119, "lastcoldate": "2021-01-29", "residual": -0.017236307518545102, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 24.613445378151262, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:S:H655Y", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "del:29747:12"]}, "B.1.1.111": {"nsamples": 41, "lastcoldate": "2020-10-12", "residual": -0.6007949480883116, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 13.78048780487805, "mutations": ["aa:orf1a:K1895N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K2557R", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf10:F35S"]}, "B.1.529": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2020-06-05", "residual": -0.8062075895279274, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.333333333333334, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:N679K"]}, "B.1.177.80": {"nsamples": 394, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": -1.844941969709544, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 22.18781725888325, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R2613S", "aa:orf1b:R2613H", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf3a:A23S"]}, "B.1.177.46": {"nsamples": 589, "lastcoldate": "2021-05-17", "residual": 0.9164575174396061, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 18.69100169779287, "mutations": ["aa:orf1a:A3143V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1681F", "aa:S:A222V", "aa:S:A262S", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf7b:M24K", "aa:N:D377Y"]}, "N.5": {"nsamples": 241, "lastcoldate": "2021-05-10", "residual": -0.27633634393803486, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 26.593360995850624, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:Q414R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S171L", "aa:orf6:I33T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T", "aa:S:T778I"]}, "B.1.192": {"nsamples": 38, "lastcoldate": "2020-12-08", "residual": -0.8855715646683678, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 10.31578947368421, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G"]}, "B.1.1.403": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2021-01-24", "residual": 1.399644071870764, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 15.944444444444445, "mutations": ["aa:orf1a:V3281A", "aa:orf1a:A3901V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf7b:N38I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:Y154N"]}, "B.1.429": {"nsamples": 14350, "lastcoldate": "2021-05-24", "residual": -1.6535347356020402, "max_ndiffs": 48, "mean_ndiffs": 28.35665505226481, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:I4205V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1183Y", "aa:S:S13I", "aa:S:W152C", "aa:S:L452R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I"]}, "B.1.1.322": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2021-04-26", "residual": -0.4350642940638328, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 20.955555555555556, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:T732A", "aa:N:S202C", "aa:N:S202T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.229": {"nsamples": 117, "lastcoldate": "2021-02-18", "residual": -0.0639209986772798, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 16.025641025641026, "mutations": ["aa:orf1a:P1158S", "aa:orf1a:I1232V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W131C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:D377Y"]}, "B.1.1.357": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-08-28", "residual": 0.7040421722563927, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 13.875, "mutations": ["aa:orf1a:A1146V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:P262S"]}, "B.1.258.14": {"nsamples": 244, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": -1.4808013779890472, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 19.327868852459016, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:M1573I", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.177.30": {"nsamples": 78, "lastcoldate": "2021-02-08", "residual": -0.6264715282488781, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 20.192307692307693, "mutations": ["aa:orf1a:D983G", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D80Y", "aa:S:N164T", "aa:S:A222V", "aa:S:A262S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W69L", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:S:E583D", "aa:orf1b:D2020N", "aa:orf1a:S1587L"]}, "B.1.1.446": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": -0.5867895406786579, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 16.25, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1848Y", "aa:S:D614G", "aa:S:I1210T", "aa:orf8:E110*", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:29756:7", "aa:orf8:W45S"]}, "Y.1": {"nsamples": 67, "lastcoldate": "2021-03-26", "residual": 1.2012341340196624, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 23.44776119402985, "mutations": ["aa:orf1a:M1014I", "aa:orf1a:M1586I", "aa:orf1a:T1665I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:P1162R", "aa:N:A220V", "aa:N:D377Y", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.85": {"nsamples": 147, "lastcoldate": "2021-03-30", "residual": -0.3020129240986014, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 19.102040816326532, "mutations": ["aa:orf1a:A1082T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.160.10": {"nsamples": 89, "lastcoldate": "2021-02-20", "residual": -1.8052599821393238, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 28.820224719101123, "mutations": ["aa:orf1a:H417Y", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1a:T4065I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:orf1b:T1511I", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf7a:V93F"]}, "B.1.351": {"nsamples": 10472, "lastcoldate": "2021-05-29", "residual": -1.7655779945691035, "max_ndiffs": 49, "mean_ndiffs": 28.171600458365166, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K1655N", "aa:orf1a:K3353R", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D80A", "aa:S:D215G", "del:22281:9", "aa:S:K417N", "aa:S:E484K", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:S:A701V", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S171L", "aa:E:P71L", "aa:N:T205I"]}, "B.1.1.265": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2021-03-15", "residual": -0.14328497381772035, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 21.125, "mutations": ["aa:orf1a:H3580Q", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:N470D", "aa:orf1a:L3644F"]}, "B.1.221.4": {"nsamples": 180, "lastcoldate": "2021-04-02", "residual": 0.5919989132117879, "max_ndiffs": 43, "mean_ndiffs": 23.97222222222222, "mutations": ["aa:orf1a:H1113Y", "aa:orf1a:H1160Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G2610C", "aa:S:S98F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q38R", "aa:orf3a:G172R", "aa:orf3a:V202L", "aa:N:Q9H", "aa:N:S193I", "aa:N:P199L"]}, "B.1.177.37": {"nsamples": 34, "lastcoldate": "2021-02-25", "residual": 1.1615521465269838, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 23.91176470588235, "mutations": ["aa:orf1a:T1543I", "aa:orf1a:N3937S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S2198I", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:N:P365S", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:N9S", "aa:orf1a:K734N", "aa:orf8:S69P"]}, "AM.3": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2020-12-08", "residual": -0.05691829508876538, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 23.285714285714285, "mutations": ["aa:orf1a:H83R", "aa:orf1a:Q526K", "aa:orf1b:I235T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Y1072F", "aa:orf1b:K2557R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Y154H", "aa:orf3a:T223I", "aa:orf8:S67F", "aa:N:D3Y", "aa:N:K127R", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "AA.7": {"nsamples": 71, "lastcoldate": "2021-02-26", "residual": -1.2753887365494314, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 23.91549295774648, "mutations": ["aa:orf1a:E37K", "aa:orf1a:V1339I", "aa:orf1a:T1567I", "aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf3a:S166L", "aa:orf1a:T1754I", "aa:orf1a:M2606V", "aa:orf1b:M187I"]}, "B.1.1.368": {"nsamples": 115, "lastcoldate": "2021-04-25", "residual": 0.30021959296567546, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 16.756521739130434, "mutations": ["aa:orf1a:S3244L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf7b:A15S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:D377Y"]}, "B.1.1.518": {"nsamples": 75, "lastcoldate": "2021-03-24", "residual": -0.5144282692042733, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 20.333333333333332, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A2344T", "aa:orf1a:L3116F", "aa:orf1b:A2431S", "aa:orf3a:G224C"]}, "AM.2": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2020-12-23", "residual": 0.30021959296567546, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 17.857142857142858, "mutations": ["aa:orf1b:I235T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T223I", "del:27946:3", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:H374Y", "aa:orf1b:R945K", "aa:S:D1260Y"]}, "B.1.1.182": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2021-01-30", "residual": -1.4411193904188269, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 18.285714285714285, "mutations": ["aa:orf1a:D3042N", "aa:orf1a:A3755S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K469N", "aa:orf1b:D1381Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G224C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.438.1": {"nsamples": 2246, "lastcoldate": "2021-04-30", "residual": 0.141491642762336, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 20.132235084594836, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:orf1a:M297V", "aa:S:Q675H", "aa:orf3a:L95F", "aa:N:D401Y"]}, "B.1.177.62": {"nsamples": 567, "lastcoldate": "2021-04-29", "residual": -0.6264715282488781, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 22.199294532627867, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:T51I", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:D936Y", "aa:orf3a:D155Y", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "P.2": {"nsamples": 2611, "lastcoldate": "2021-05-16", "residual": -1.732898710742481, "max_ndiffs": 51, "mean_ndiffs": 23.994638069705093, "mutations": ["aa:orf1a:L3468V", "aa:orf1a:L3930F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:S:V1176F", "aa:N:A119S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:M234I"]}, "B.1.160.17": {"nsamples": 508, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": 0.8767755298693858, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 24.23228346456693, "mutations": ["aa:orf1a:E381D", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1a:N4338D", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "AD.1": {"nsamples": 213, "lastcoldate": "2021-02-22", "residual": 0.5919989132117879, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 23.769953051643192, "mutations": ["aa:orf1a:I300F", "aa:orf1a:C2165F", "aa:orf1a:M3761I", "aa:orf1b:E245D", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M2025I", "aa:orf1b:T2084I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:A398V"]}, "B.1.177.70": {"nsamples": 114, "lastcoldate": "2021-01-11", "residual": 0.8767755298693858, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 14.789473684210526, "mutations": ["aa:orf1a:E910G", "aa:orf1a:T2800I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.36.26": {"nsamples": 85, "lastcoldate": "2021-02-11", "residual": -0.7128382069778331, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 22.694117647058825, "mutations": ["aa:orf1a:R426C", "aa:orf1a:T3665I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L54F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:G251D", "aa:M:M109I", "aa:N:S194L", "aa:N:T362I"]}, "D.5": {"nsamples": 100, "lastcoldate": "2021-03-19", "residual": -0.2623309365283812, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 19.53, "mutations": ["aa:orf1a:I300F", "aa:orf1a:T1055I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R2257S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S171L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:29738:23", "aa:orf1a:P2018L"]}, "B.1.549": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2021-01-29", "residual": 0.5523169257191092, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 18.666666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:H417Y", "aa:orf1a:Q1759H", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:Q3729R", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1219S", "aa:orf1b:A1285S", "aa:orf1b:P1666S", "aa:S:D614G", "aa:orf1a:T1626I", "aa:orf1a:L3201F", "aa:orf3a:A31V", "aa:orf3a:S195A", "aa:N:P20L"]}, "V.1": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2021-02-22", "residual": -0.5471075531084375, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 22.65625, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V163I", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "AH.3": {"nsamples": 161, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": -0.3020129240986014, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 20.726708074534162, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1691L", "aa:S:V3G", "aa:S:A352S", "aa:S:D614G", "aa:S:G842S", "aa:orf3a:W45L", "aa:N:P67S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:K1383R"]}, "B.1.363": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2020-09-29", "residual": 1.1148674552131659, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 17.8, "mutations": ["aa:orf1a:R24C", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3930F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1391L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:E:P71S"]}, "AA.2": {"nsamples": 112, "lastcoldate": "2021-02-19", "residual": -0.38137689923904206, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 21.848214285714285, "mutations": ["aa:orf1a:E37K", "aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:N:D128Y"]}, "C.26": {"nsamples": 110, "lastcoldate": "2021-05-12", "residual": -1.2100301688186446, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 19.163636363636364, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.375": {"nsamples": 595, "lastcoldate": "2021-05-22", "residual": 0.4262682593423923, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 21.742857142857144, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T1828A", "aa:orf1a:A4357V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E1264D", "aa:orf1b:A2655V", "del:21765:6", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:T151I", "aa:M:I48V", "aa:N:T205I"]}, "B.1.543": {"nsamples": 50, "lastcoldate": "2021-02-22", "residual": 1.399644071870764, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 14.12, "mutations": ["aa:orf1a:L3776F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:T95N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G174D", "aa:E:S68F", "aa:N:P383L"]}, "B.1.409": {"nsamples": 720, "lastcoldate": "2021-04-18", "residual": 0.995821492502505, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 20.344444444444445, "mutations": ["aa:orf1a:D1088N", "aa:orf1a:V1584M", "aa:orf1a:N1871S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L108F", "aa:orf3a:D155Y", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:S194L"]}, "B.1.585": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2021-02-13", "residual": -1.1960247614089907, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 15.866666666666667, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1131V", "aa:orf1b:T1230I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:D377Y"]}, "B.1.603": {"nsamples": 56, "lastcoldate": "2021-04-14", "residual": -0.05691829508876538, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 25.392857142857142, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T1543K", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A370V", "aa:orf1b:P1000L", "aa:orf1b:V1077L", "aa:orf1b:S1273L", "aa:orf1b:A1428S", "aa:S:N370S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:A99T", "aa:orf3a:T175I", "aa:orf7b:C12Y", "aa:N:P383L", "del:29756:7"]}, "B.1.517": {"nsamples": 1220, "lastcoldate": "2021-05-03", "residual": 0.22085561790277655, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 18.257377049180327, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G989V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P2633S", "aa:S:N501T", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S206F"]}, "B.1.1.415": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2021-01-07", "residual": 1.3459566768908897, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 16.142857142857142, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:S3149F", "aa:orf1a:K4039R", "aa:orf1b:Q866H", "aa:orf3a:K75N", "aa:N:A35T"]}, "B.1.1.522": {"nsamples": 48, "lastcoldate": "2021-04-07", "residual": 0.9818160851703929, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 23.5625, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:G42D", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:H110Y", "aa:orf1a:Q3729K", "aa:S:D138N", "aa:S:P681H", "aa:orf3a:F28L", "aa:orf3a:D173G", "aa:orf6:I37T", "aa:orf8:D119Y"]}, "B.1.1.484": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-07-20", "residual": -1.3290761314517636, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 14.375, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1643S", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:K2579N"]}, "B.1.1.394": {"nsamples": 27, "lastcoldate": "2020-08-31", "residual": 0.7040421722563927, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 15.148148148148149, "mutations": ["aa:orf1a:R398C", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L176F", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:P2079S"]}, "B.1.177.78": {"nsamples": 75, "lastcoldate": "2021-03-03", "residual": -0.3020129240986014, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 26.16, "mutations": ["aa:orf1a:K1247N", "aa:orf1a:A2139V", "aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1b:K82N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q2635H", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:G769V", "aa:N:A220V", "aa:N:D415H", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:E57K", "aa:orf1a:T1637I", "aa:S:S254F"]}, "B.1.160.20": {"nsamples": 87, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": -0.2623309365283812, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 26.436781609195403, "mutations": ["aa:orf1a:T1637I", "aa:orf1a:T1854I", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:S:D1260Y", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf1b:Q2635H"]}, "B.1.160.12": {"nsamples": 105, "lastcoldate": "2021-02-14", "residual": 0.9561395050098264, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 27.504761904761907, "mutations": ["aa:orf1a:Q362L", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1a:A3143V", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:V202L", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "C.36.2": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2021-01-29", "residual": -0.5867895406786579, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 26.40909090909091, "mutations": ["aa:orf1a:T551I", "aa:orf1a:Q1009R", "aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:M1378I", "aa:orf1a:T4090I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:Q677H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:G212V", "aa:orf1a:G3278S"]}, "B.1.1.480": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-06-09", "residual": -0.5611129605180912, "max_ndiffs": 12, "mean_ndiffs": 10.2, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:E1258V", "aa:orf7a:P84S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.579": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-06-18", "residual": -0.27633634393803486, "max_ndiffs": 13, "mean_ndiffs": 10.6, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:Q787R", "aa:orf3a:Q57H", "aa:M:D215N"]}, "B.1.564.1": {"nsamples": 198, "lastcoldate": "2021-02-27", "residual": 1.3202800967303232, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 15.48989898989899, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:R1170C", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S183Y"]}, "AL.1": {"nsamples": 34, "lastcoldate": "2021-03-24", "residual": -1.7258960069988831, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 19.176470588235293, "mutations": ["aa:orf1a:A1151T", "aa:orf1a:A3615V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q38P", "aa:orf3a:D155Y", "aa:N:R195I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.414": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2020-09-11", "residual": -1.4878040817326448, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 15.5, "mutations": ["aa:orf1a:T4090I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:I2687V", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "AA.6": {"nsamples": 47, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": -1.8846239572797643, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 20.829787234042552, "mutations": ["aa:orf1a:E37K", "aa:orf1a:A2345V", "aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "A.23.1": {"nsamples": 695, "lastcoldate": "2021-05-03", "residual": -1.844941969709544, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 25.306474820143883, "mutations": ["aa:orf1a:M3655I", "aa:orf1a:L3667F", "aa:orf1a:M3752I", "aa:S:F157L", "aa:S:Q613H", "aa:S:P681R", "aa:orf8:L84S", "aa:orf8:E92K", "aa:N:S202N"]}, "B.1.221.2": {"nsamples": 126, "lastcoldate": "2021-03-31", "residual": -1.8052599821393238, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 21.49206349206349, "mutations": ["aa:orf1a:H1113Y", "aa:orf1a:E1413D", "aa:orf1a:K3832N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S98F", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q38R", "aa:orf3a:G172R", "aa:orf3a:V202L", "aa:E:L73F", "aa:N:P199L"]}, "B.1.1.333": {"nsamples": 562, "lastcoldate": "2021-05-05", "residual": 0.2675403090615112, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 23.23665480427046, "mutations": ["aa:orf1a:E37D", "aa:orf1a:T2648I", "aa:orf1a:L4182F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L54F", "aa:S:D138Y", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A110V", "aa:orf8:A51V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.563": {"nsamples": 44, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": -0.46074087430194094, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 20.34090909090909, "mutations": ["aa:orf1a:F679L", "aa:orf1a:M1014I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E341G", "aa:orf1b:M2269I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L41F", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S171L", "aa:N:P199L"]}, "B.1.517.1": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2021-01-16", "residual": 0.43327096308599, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 20.97142857142857, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G989V", "aa:orf1a:D2813A", "aa:orf1a:L3585I", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2084I", "aa:orf1b:P2633S", "aa:S:N501T", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:M:R44S", "aa:M:T208I", "aa:N:S206F"]}, "AF.1": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2021-01-27", "residual": -0.5867895406786579, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 23.952380952380953, "mutations": ["aa:orf1a:G989C", "aa:orf1a:M2254I", "aa:orf1a:A2891V", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:N1188S", "aa:orf1b:A1798S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A110S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.258.19": {"nsamples": 131, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": -1.9639879323426632, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 22.19083969465649, "mutations": ["aa:orf1a:A702S", "aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:V1320M", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G"]}, "B.1.160.24": {"nsamples": 180, "lastcoldate": "2021-02-08", "residual": -1.9639879323426632, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 28.07777777777778, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H346Y", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:orf1b:P1325S", "del:21991:3", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:R30L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "B.1.258.15": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": -1.679211315762607, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 20.535714285714285, "mutations": ["aa:orf1a:D930N", "aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:P3371S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:S:V1228L", "aa:orf1a:S838I", "aa:S:M177I"]}, "B.1.258.16": {"nsamples": 552, "lastcoldate": "2021-03-01", "residual": -1.9639879323426632, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 22.70108695652174, "mutations": ["aa:orf1a:T1543I", "aa:orf1a:A2320V", "aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:D2819N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G"]}, "B.1.534": {"nsamples": 71, "lastcoldate": "2021-01-25", "residual": 0.5919989132117879, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 21.47887323943662, "mutations": ["aa:orf1a:I1002T", "aa:orf1a:P1803S", "aa:orf1a:H2092Y", "aa:orf1a:N2603D", "aa:orf1a:K2622N", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:T859I", "aa:S:E1202Q", "aa:N:S194L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "U.2": {"nsamples": 95, "lastcoldate": "2021-03-18", "residual": -1.9639879323426632, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 22.36842105263158, "mutations": ["aa:orf1a:G989S", "aa:orf1a:E2551D", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G2510C", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V77F", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:S:W64C"]}, "B.1.1.420": {"nsamples": 492, "lastcoldate": "2021-05-20", "residual": -1.679211315762607, "max_ndiffs": 43, "mean_ndiffs": 28.82520325203252, "mutations": ["aa:orf1a:T1638I", "aa:orf1a:Q3729R", "aa:orf1b:T76I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:N440K", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W149C", "aa:N:P13S", "aa:N:S197T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.160.9": {"nsamples": 80, "lastcoldate": "2021-02-28", "residual": 0.022445680051675174, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 28.9625, "mutations": ["aa:orf1a:E1142G", "aa:orf1a:K1202N", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:H17Y", "aa:orf8:A65S", "aa:orf8:Y111F", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf3a:I63T"]}, "B.1.1.519": {"nsamples": 13196, "lastcoldate": "2021-05-28", "residual": -1.599847340699708, "max_ndiffs": 50, "mean_ndiffs": 27.997120339496817, "mutations": ["aa:orf1a:P959S", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:I3618V", "aa:orf1a:T4175I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:T478K", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:T732A", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.160.29": {"nsamples": 176, "lastcoldate": "2021-03-30", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 25.988636363636363, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:orf1b:V1639F", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:E239D", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf1a:S443P"]}, "B.1.177.71": {"nsamples": 74, "lastcoldate": "2021-02-09", "residual": 0.6316809007820081, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 15.175675675675675, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:M1237I", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.327": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2021-01-11", "residual": -1.0302941074620537, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 19.8, "mutations": ["aa:orf1a:A1283V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:F105V", "aa:orf8:V32L", "aa:N:S202C", "aa:N:S202T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:518:3", "aa:orf1b:V2475I", "aa:S:I1172V"]}, "B.1.177.76": {"nsamples": 353, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": -0.2226489489581609, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 18.10481586402266, "mutations": ["aa:orf1a:P309L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:A110S", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:A690V", "aa:orf1a:N3484H"]}, "W.2": {"nsamples": 36, "lastcoldate": "2021-03-04", "residual": 0.7110448759224487, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 21.13888888888889, "mutations": ["aa:orf1a:A903V", "aa:orf1a:A2529V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1727L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.34": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2021-03-20", "residual": -0.46074087430194094, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 23.0, "mutations": ["aa:orf1a:I431M", "aa:orf1a:T1567I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1274I", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf7b:V21F", "aa:N:A182S", "aa:N:A220V", "aa:N:P365S", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1b:G2610D"]}, "B.1.177.36": {"nsamples": 41, "lastcoldate": "2021-02-16", "residual": -0.3020129240986014, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 23.024390243902438, "mutations": ["aa:orf1a:E754D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:N:P365S", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.374": {"nsamples": 291, "lastcoldate": "2021-05-04", "residual": -1.1960247614089907, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 22.945017182130584, "mutations": ["aa:orf1a:L27I", "aa:orf1a:T2777I", "aa:orf1a:V3653F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L452Q", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T151I", "aa:orf3a:L219V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.47": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2021-04-26", "residual": 0.7974115548064868, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 19.666666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:L3711F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:S256L", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "AA.8": {"nsamples": 28, "lastcoldate": "2021-02-17", "residual": 0.47295295065621024, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 23.107142857142858, "mutations": ["aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:P199S", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.466.2": {"nsamples": 569, "lastcoldate": "2021-05-28", "residual": -1.9243059448499846, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 23.576449912126538, "mutations": ["aa:orf1a:T1168I", "aa:orf1a:P1640L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I", "aa:orf1a:S944L", "aa:orf1a:L3644F", "aa:orf1b:S1182L", "aa:S:P681R"]}, "A.2.5": {"nsamples": 338, "lastcoldate": "2021-05-26", "residual": 0.7974115548064868, "max_ndiffs": 49, "mean_ndiffs": 36.68934911242604, "mutations": ["aa:orf1a:L4F", "aa:orf1a:K1657E", "aa:orf1a:F3071Y", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:H3580Q", "aa:orf1b:P1000L", "aa:orf8:L84S", "aa:N:M234I", "del:21981:9", "ins:22206:9", "aa:S:L452R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S74F", "aa:orf3a:G196V", "aa:N:S197L", "aa:N:P365S", "aa:N:P383L"]}, "AM.4": {"nsamples": 70, "lastcoldate": "2021-01-22", "residual": 1.2012341340196624, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 24.3, "mutations": ["aa:orf1a:K798N", "aa:orf1b:I235T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T223I", "aa:M:R107H", "aa:orf7a:T14I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:G204V", "aa:orf1a:A3901V"]}, "C.36.1": {"nsamples": 80, "lastcoldate": "2021-05-13", "residual": 1.4790080469336628, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 25.1, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1a:Y3723C", "aa:orf1a:T4090I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1681F", "aa:S:D614G", "aa:S:N641S", "aa:S:Q677H", "aa:orf8:S67F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:G212V", "aa:N:A119S"]}, "B.1.1.348": {"nsamples": 528, "lastcoldate": "2021-05-13", "residual": 0.3328988768698397, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 23.948863636363637, "mutations": ["aa:orf1a:L1175F", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:G1167A", "aa:orf3a:G174D", "aa:N:S2Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:T366I"]}, "L.3": {"nsamples": 167, "lastcoldate": "2021-05-09", "residual": 0.7040421722563927, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 28.197604790419163, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:Y1155F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:L446F", "aa:orf1a:M1378I", "aa:orf1a:P2739L", "aa:orf1a:Y3063S", "aa:orf1a:P3767L", "aa:S:L452R", "aa:S:V1228L"]}, "B.1.427": {"nsamples": 6503, "lastcoldate": "2021-05-23", "residual": 1.021498072740613, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 24.199600184530215, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S3158T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1183Y", "aa:S:S13I", "aa:S:W152C", "aa:S:L452R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I", "aa:orf1b:P976L"]}, "B.1.1.358": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2021-02-04", "residual": -0.467743577967997, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 21.529411764705884, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:R21T", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:H93Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.551": {"nsamples": 334, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": 1.4790080469336628, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 17.79640718562874, "mutations": ["aa:orf1a:P1158L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:P681R", "aa:N:S194L", "aa:N:A398V"]}, "B.1.1.445": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2021-01-15", "residual": -1.1096580826024942, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 27.75, "mutations": ["aa:orf1a:I1128V", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:D27Y", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7b:L25F", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf1a:P2046S"]}, "B.1.160.18": {"nsamples": 119, "lastcoldate": "2021-03-10", "residual": -0.05691829508876538, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 34.6890756302521, "mutations": ["aa:orf1a:V1025A", "aa:orf1a:V1550I", "aa:orf1a:S2083N", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:orf1b:S2339F", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7b:C41F", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "B.1.177.72": {"nsamples": 251, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": -0.6661535158190984, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 17.54183266932271, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L820F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:M:H125Y", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "AM.1": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2021-01-18", "residual": 0.8767755298693858, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 19.571428571428573, "mutations": ["aa:orf1a:D935G", "aa:orf1a:M3655I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S638I", "aa:S:D614G", "aa:S:G1251V", "aa:orf3a:V77I", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf8:S67F"]}, "AJ.1": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": -1.599847340699708, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 21.785714285714285, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A434V", "aa:orf1b:Q2425H", "aa:S:M153I", "aa:S:D614G", "aa:S:K1073N", "aa:orf8:A65V", "aa:N:P13S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.562": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2021-03-02", "residual": 0.7974115548064868, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 20.966666666666665, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2515I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:P13S", "aa:N:A220V", "aa:orf1a:T1543K", "aa:S:E654Q", "aa:orf3a:I118T", "del:27763:6", "del:29738:23"]}, "B.1.177.67": {"nsamples": 84, "lastcoldate": "2021-03-04", "residual": 1.2012341340196624, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 22.11904761904762, "mutations": ["aa:orf1a:L3711F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:D215H", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "AQ.1": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2020-12-30", "residual": 0.2278583215688326, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 17.846153846153847, "mutations": ["aa:orf1a:A872V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E2164A", "aa:S:D614G", "aa:N:V72I", "aa:N:P199S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.435": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2020-12-28", "residual": 0.2675403090615112, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 16.88, "mutations": ["aa:orf1a:I431M", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:T205A", "aa:N:G214S"]}, "B.1.1.336": {"nsamples": 29, "lastcoldate": "2021-05-18", "residual": 1.2805981091601029, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 19.517241379310345, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:orf3a:D173G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.481": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-10-07", "residual": -0.0639209986772798, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 13.8, "mutations": ["aa:orf1a:V2071F", "aa:orf1a:Q3859H", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1259S", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "K.2": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2020-12-27", "residual": -1.4808013779890472, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 17.5, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1095S", "aa:S:D614G", "aa:S:N679K", "aa:orf3a:R30H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.332": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2021-03-16", "residual": 0.4192655556763363, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 20.6, "mutations": ["aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1a:L3930F", "aa:S:D614G", "aa:S:V1176F", "aa:orf3a:G224R", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:G295C", "aa:orf1a:T2087I", "aa:orf1a:L2572I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf7a:L5P"]}, "R.1": {"nsamples": 7186, "lastcoldate": "2021-05-23", "residual": 0.5919989132117879, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 26.301280267186197, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G1362R", "aa:orf1b:P1936H", "aa:S:W152L", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:S:G769V", "aa:M:F28L", "del:28271:1", "aa:N:S187L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:Q418H"]}, "N.9": {"nsamples": 102, "lastcoldate": "2021-04-25", "residual": -0.2623309365283812, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 24.186274509803923, "mutations": ["aa:orf1a:A872T", "aa:orf1a:A2529V", "aa:orf1a:F3605L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:orf6:I33T", "aa:orf7b:E33A", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T"]}, "B.1.351.2": {"nsamples": 666, "lastcoldate": "2021-05-26", "residual": -0.46074087430194094, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 29.13963963963964, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K1655N", "aa:orf1a:N2596S", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1a:A3456V", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:D80A", "aa:S:D215G", "del:22281:9", "aa:S:K417N", "aa:S:E484K", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:S:A701V", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S171L", "aa:E:P71L", "aa:N:T205I"]}, "B.1.258.20": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2021-04-05", "residual": 0.4262682593423923, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 25.977777777777778, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "aa:orf1b:T2432I", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:K67N", "aa:orf3a:G172D"]}, "B.1.393": {"nsamples": 25, "lastcoldate": "2021-04-20", "residual": 1.0285007764066691, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 15.28, "mutations": ["aa:orf1a:A1092T", "aa:orf1a:Q1592R", "aa:orf1a:T1840I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:D402Y"]}, "A.23": {"nsamples": 65, "lastcoldate": "2020-12-27", "residual": 0.26053760539545523, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 18.06153846153846, "mutations": ["aa:orf1a:M3655I", "aa:orf1a:L3667F", "aa:S:F157L", "aa:S:Q613H", "aa:orf8:L84S", "aa:orf8:E92K", "aa:N:S202N"]}, "B.1.588.1": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2020-11-28", "residual": 0.1881763339986123, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 24.666666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T2081I", "aa:S:T20I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:D155Y", "aa:orf8:S24L", "aa:N:M234I", "aa:N:D401Y", "aa:orf1a:A3143V", "aa:N:S193I"]}, "B.1.348": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2021-01-15", "residual": 0.2675403090615112, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 23.416666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:A1082T", "aa:orf1a:K1860T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1201F", "aa:orf1b:Q2415L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "del:28065:3"]}, "B.1.1.450": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2020-12-09", "residual": 0.8370935423767072, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 15.1875, "mutations": ["aa:orf1a:K1230N", "aa:orf1a:D1962E", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:I2273F", "aa:orf1b:I2273T", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.418": {"nsamples": 21, "lastcoldate": "2021-03-03", "residual": -1.4808013779890472, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 20.285714285714285, "mutations": ["aa:orf1a:A516V", "aa:orf1a:N2603D", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D2576G", "aa:S:D614G", "aa:S:T732A", "aa:S:A879S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.438.4": {"nsamples": 18, "lastcoldate": "2021-03-23", "residual": -1.8846239572797643, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 23.38888888888889, "mutations": ["aa:orf1a:M297V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1449F", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:V77F", "aa:orf8:Y105F", "aa:N:D401Y", "aa:N:T166I", "aa:orf1a:K636R", "aa:orf1b:M115I", "aa:orf1b:L1846V"]}, "B.1.160.21": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2021-01-26", "residual": 0.5126349382264306, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 29.945945945945947, "mutations": ["aa:orf1a:E102K", "aa:orf1a:K1233R", "aa:orf1a:V1583F", "aa:orf1a:T2106I", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:S:V622A", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "V.2": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2021-01-21", "residual": -1.235706748979211, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 21.266666666666666, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1760I", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V163I", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.466.1": {"nsamples": 68, "lastcoldate": "2021-04-03", "residual": 0.4986295308167768, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 22.691176470588236, "mutations": ["aa:orf1a:K1053R", "aa:orf1a:P2018Q", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A520V", "aa:orf1b:T2165A", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W45L", "aa:orf3a:A54V", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:P240L", "aa:N:T205I", "aa:N:K249R", "del:29767:10", "aa:orf7a:A105V"]}, "AA.5": {"nsamples": 53, "lastcoldate": "2021-03-02", "residual": 0.47295295065621024, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 23.735849056603772, "mutations": ["aa:orf1a:E37K", "aa:orf1a:P804S", "aa:orf1a:A3623S", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "M.1": {"nsamples": 32, "lastcoldate": "2021-02-17", "residual": -1.3944346991825505, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 23.6875, "mutations": ["aa:orf1a:D1036E", "aa:orf1a:L1762F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:T95I", "aa:S:D614G", "aa:S:A688S", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:N8T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:D402Y", "del:29737:14", "aa:orf6:F2S"]}, "B.1.1.483": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2021-01-05", "residual": -1.718893303332827, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 20.727272727272727, "mutations": ["aa:orf1a:A1283V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1099F", "aa:S:V6F", "aa:S:D198G", "aa:S:D614G", "aa:S:A845S", "aa:S:T859I", "aa:orf3a:V55F", "aa:orf8:T11I", "aa:N:D144Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.461": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2021-02-05", "residual": 1.1008620478810538, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 15.909090909090908, "mutations": ["aa:orf1a:G59S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q2247H", "aa:S:D614G", "aa:S:Q675R", "aa:S:A879S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:V1607L"]}, "B.1.1.324": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2020-12-13", "residual": 0.25353490180694077, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 15.3125, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:T39I", "aa:N:S202C", "aa:N:S202T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "C.29": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": -0.7992048857843297, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 18.58823529411765, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf8:F3L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:P2313L"]}, "B.1.568": {"nsamples": 475, "lastcoldate": "2021-05-09", "residual": -0.5471075531084375, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 22.776842105263157, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1a:L4064I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1339I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:G174D", "aa:orf8:G8V", "aa:N:S190I", "aa:orf1a:P971S"]}, "C.19": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2021-01-04", "residual": -1.3944346991825505, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 23.133333333333333, "mutations": ["aa:orf1a:T654A", "aa:orf1a:E1205K", "aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S2563A", "aa:S:D253G", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S74F", "aa:orf8:I71T", "aa:N:Q7K", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "AB.1": {"nsamples": 104, "lastcoldate": "2021-02-15", "residual": -1.3944346991825505, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 31.692307692307693, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:T223I", "aa:orf7a:T14I", "aa:orf7a:E95Q", "aa:orf8:S24L", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf1a:T1001I", "aa:S:P251L", "aa:S:V1264L", "aa:orf7a:E33V", "aa:orf8:L60F"]}, "N.7": {"nsamples": 17, "lastcoldate": "2020-07-14", "residual": -1.0839815024419277, "max_ndiffs": 16, "mean_ndiffs": 14.764705882352942, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf6:I33T", "aa:N:P168S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T"]}, "B.1.1.517": {"nsamples": 76, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": 1.082188171386543, "max_ndiffs": 36, "mean_ndiffs": 22.026315789473685, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D2142Y", "aa:S:D614G", "aa:S:T732A", "aa:orf8:D34G", "aa:orf8:E64*", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:F1850L"]}, "B.1.475": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2020-07-01", "residual": 1.2665927017504492, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 14.0, "mutations": ["del:241:2", "aa:orf1a:Q2702H", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S193I", "aa:orf6:D53Y"]}, "B.1.428.3": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2021-02-17", "residual": -1.6535347356020402, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 18.1, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T346I", "del:6323:3", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K1507N", "aa:S:N481K", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I", "aa:N:T366I"]}, "A.27": {"nsamples": 320, "lastcoldate": "2021-05-14", "residual": -1.1096580826024942, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 32.303125, "mutations": ["aa:orf1a:P286L", "aa:orf1a:D2980G", "aa:orf1a:N3651S", "aa:orf1b:P1000L", "aa:S:L18F", "aa:S:L452R", "aa:S:N501Y", "aa:S:A653V", "aa:S:H655Y", "aa:S:D796Y", "aa:S:G1219V", "aa:orf3a:V50A", "del:26160:8", "del:27386:1", "aa:orf8:L84S", "del:28248:6", "aa:N:S202N"]}, "B.1.596.1": {"nsamples": 12, "lastcoldate": "2021-03-04", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 24.583333333333332, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:G172V", "aa:N:R195K", "aa:orf1a:V1211F", "aa:orf1a:K1305N", "aa:orf1a:L2869F", "aa:orf1a:P3504L", "aa:orf1b:K2063N", "aa:S:K182R", "aa:S:N501Y", "aa:orf3a:V13L", "aa:orf3a:S74F", "aa:orf3a:E241D", "aa:N:S194L"]}, "B.1.525": {"nsamples": 3036, "lastcoldate": "2021-05-24", "residual": -1.1096580826024942, "max_ndiffs": 51, "mean_ndiffs": 35.060935441370226, "mutations": ["aa:orf1a:T2007I", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:Q52R", "aa:S:A67V", "del:21765:6", "del:21991:3", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:S:Q677H", "aa:S:F888L", "aa:E:L21F", "aa:M:I82T", "del:27205:3", "del:28278:3", "aa:N:A12G", "aa:N:T205I", "del:29728:49"]}, "B.1.214.2": {"nsamples": 946, "lastcoldate": "2021-05-26", "residual": -1.0302941074620537, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 31.250528541226217, "mutations": ["aa:orf1a:I1398V", "aa:orf1a:T1881I", "del:11288:9", "aa:orf1a:A4016V", "aa:orf1a:T4304I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R574G", "ins:22205:9", "aa:S:N450K", "aa:S:D614G", "aa:S:T716I", "del:25446:30", "aa:orf3a:G172C", "del:28271:2", "aa:N:D3H", "aa:N:D3V", "aa:N:D3E", "aa:N:T205I"]}, "B.1.177.74": {"nsamples": 36, "lastcoldate": "2021-03-11", "residual": -0.1759642577218846, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 21.055555555555557, "mutations": ["aa:orf1a:L2609F", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:T141I", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:A1420V"]}, "B.1.526": {"nsamples": 14742, "lastcoldate": "2021-05-27", "residual": -0.1362822701516643, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 24.529439696106362, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3201P", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q1011H", "aa:S:T95I", "aa:S:D253G", "aa:S:D614G", "aa:S:A701V", "aa:orf3a:P42L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:T11I", "del:28271:1", "aa:N:P199L", "aa:N:M234I", "aa:S:E484K"]}, "B.1.478": {"nsamples": 45, "lastcoldate": "2021-02-27", "residual": -0.031241714850657184, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 22.0, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V1493L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L52F", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:G172D", "aa:N:N11I", "aa:orf10:I27T"]}, "B.1.258.22": {"nsamples": 283, "lastcoldate": "2021-03-22", "residual": -1.718893303332827, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 27.363957597173144, "mutations": ["aa:orf1a:L320F", "aa:orf1a:V365F", "aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "aa:orf1b:V2172I", "aa:S:A67V", "del:21765:6", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:N:G34W"]}, "B.1.526.2": {"nsamples": 6741, "lastcoldate": "2021-05-24", "residual": -1.9639879323426632, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 29.934876131137813, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:G1946S", "aa:orf1a:L3201P", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q1011H", "aa:S:T95I", "aa:S:D253G", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:S:Q957R", "aa:orf3a:P42L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7a:L116F", "aa:orf8:T11I", "del:28271:1", "aa:N:P13L", "aa:N:S202R", "del:29738:23"]}, "B.1.1.399": {"nsamples": 5, "lastcoldate": "2020-12-13", "residual": 0.6970394685903366, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 11.2, "mutations": ["aa:orf1a:G192D", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1b:A1491V"]}, "B.1.530": {"nsamples": 13, "lastcoldate": "2021-03-08", "residual": 1.1218701589567635, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 18.692307692307693, "mutations": ["aa:orf1a:Q1009R", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M1156I", "aa:orf1b:S1958G", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:orf3a:A99S", "aa:orf8:S69P", "aa:N:T205I"]}, "B.1.177.66": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2020-12-18", "residual": -0.017236307518545102, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 22.9, "mutations": ["aa:orf1a:L3711F", "aa:orf1a:E3990A", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:H1550Y", "aa:S:L18F", "aa:S:D215H", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:S:V1228L", "aa:E:S67P", "aa:orf8:T11P", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.353": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2021-02-27", "residual": -0.7922021821182736, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 21.483870967741936, "mutations": ["aa:orf1a:D3042N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G1561S", "aa:S:F186S", "aa:S:D215H", "aa:S:T323I", "aa:S:D614G", "aa:S:A1078T", "aa:orf3a:P104L", "aa:orf3a:A110S", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.334": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2021-04-22", "residual": 1.0028241962461026, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 17.375, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:P1158L", "aa:orf1b:P1427S", "aa:S:P681R", "aa:N:A119S", "aa:orf1a:R1464W", "aa:orf1a:V3510I"]}, "B.1.177.61": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2021-02-18", "residual": -1.5204833655592673, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 25.5625, "mutations": ["aa:orf1a:E899D", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2237F", "aa:orf1b:A2585S", "aa:S:L18F", "aa:S:T51I", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:E95*", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:M807R", "aa:orf1a:T1840I", "aa:orf8:V62L"]}, "B.1.1.411": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2021-04-04", "residual": -0.5144282692042733, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 17.27027027027027, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:A591V", "aa:orf1a:S944L", "aa:orf1a:T3506I", "aa:orf1a:A3571V", "aa:S:T19R", "aa:orf3a:W193R"]}, "B.1.539": {"nsamples": 34, "lastcoldate": "2021-03-05", "residual": 1.2409161215898827, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 15.411764705882353, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:I1799T", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:G212C"]}, "B.1.569": {"nsamples": 52, "lastcoldate": "2021-03-22", "residual": -1.2030274650750468, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 17.78846153846154, "mutations": ["aa:orf1a:D223H", "aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:H374Y", "aa:orf1a:A872V", "aa:orf1a:H1113Y", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:T269M", "aa:orf1b:L1099F"]}, "B.1.1.335": {"nsamples": 20, "lastcoldate": "2021-03-16", "residual": -1.1703481812484242, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 22.65, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G172V", "aa:orf8:S24L", "aa:N:P67S", "aa:N:P199L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf1a:L3352F", "aa:orf1b:N1653D", "aa:orf1b:R2613C"]}, "B.1.1.352": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2021-02-13", "residual": 0.06212766762189545, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 21.0, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M620I", "aa:S:E583D", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G188S", "aa:orf8:E59*", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf10:Q29*"]}, "B.1.575": {"nsamples": 1705, "lastcoldate": "2021-05-29", "residual": 0.5453142220530531, "max_ndiffs": 44, "mean_ndiffs": 27.776539589442816, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:T3750I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P970S", "aa:S:S494P", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:T716I", "aa:orf3a:Q57H", "aa:M:I82T", "aa:N:T205I", "aa:orf1a:T2196P", "aa:orf1a:S2224F", "del:28271:1", "del:29711:1"]}, "C.2.1": {"nsamples": 118, "lastcoldate": "2021-03-27", "residual": -1.4341166867527708, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 23.508474576271187, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:L293S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M657T", "aa:orf1b:A1609S", "aa:S:N501T", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:H78Y", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf10:Q29*"]}, "B.1.601": {"nsamples": 14, "lastcoldate": "2021-02-16", "residual": -0.990612119969375, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 16.928571428571427, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T403I", "aa:orf1a:D935G", "aa:orf1a:G3676S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q1204H", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T366I"]}, "P.1": {"nsamples": 15047, "lastcoldate": "2021-06-01", "residual": -1.679211315762607, "max_ndiffs": 52, "mean_ndiffs": 39.50202698212268, "mutations": ["aa:orf1a:S1188L", "aa:orf1a:K1795Q", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E1264D", "aa:S:L18F", "aa:S:T20N", "aa:S:P26S", "aa:S:D138Y", "aa:S:R190S", "aa:S:K417T", "aa:S:E484K", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:S:H655Y", "aa:S:T1027I", "aa:S:V1176F", "aa:orf3a:S253P", "aa:orf8:E92K", "ins:28263:4", "aa:N:P80R", "aa:N:S202C", "aa:N:S202T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.526.1": {"nsamples": 5780, "lastcoldate": "2021-05-25", "residual": -0.8715661572587142, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 32.30553633217993, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K3162E", "aa:orf1a:L3201P", "aa:orf1a:A3209V", "del:11288:9", "aa:orf1a:V3847I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D80G", "del:21991:3", "aa:S:F157S", "aa:S:L452R", "aa:S:D614G", "aa:S:T859N", "aa:S:D950H", "aa:orf3a:P42L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:P104L", "aa:orf8:T11I", "aa:orf8:A51S", "del:28271:1", "aa:N:T205I", "aa:N:M234I", "aa:orf1a:A1679S"]}, "B.1.160.19": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2021-01-25", "residual": -1.1493400701727146, "max_ndiffs": 31, "mean_ndiffs": 27.636363636363637, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:orf1b:M1677I", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:R52I", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T", "aa:orf1a:E233G"]}, "B.1.1.330": {"nsamples": 15, "lastcoldate": "2021-01-04", "residual": -1.0979869097740398, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 22.533333333333335, "mutations": ["aa:orf1a:S2030L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1089L", "aa:S:M153T", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "U.1": {"nsamples": 54, "lastcoldate": "2021-02-08", "residual": -0.5401048494423815, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 20.48148148148148, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G2510C", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:V77F", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:P1803S"]}, "B.1.258.24": {"nsamples": 76, "lastcoldate": "2021-03-17", "residual": -0.8248814660224378, "max_ndiffs": 37, "mean_ndiffs": 26.776315789473685, "mutations": ["aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1a:G400D", "aa:orf1a:L2343M", "aa:orf1a:S2631P", "aa:orf1a:M3655I", "aa:orf1a:L3829F", "aa:orf1b:H1087Y", "aa:S:P681H", "aa:orf3a:T223A"]}, "C.21": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2020-09-15", "residual": 1.0751854676429455, "max_ndiffs": 19, "mean_ndiffs": 14.714285714285714, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:T1597I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:S:E819D", "aa:S:T883A"]}, "B.1.550": {"nsamples": 59, "lastcoldate": "2021-03-14", "residual": 1.3202800967303232, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 16.52542372881356, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L629F", "aa:S:D253G", "aa:S:D614G", "aa:N:S194L"]}, "B.1.428.1": {"nsamples": 35, "lastcoldate": "2020-10-01", "residual": -0.27633634393803486, "max_ndiffs": 14, "mean_ndiffs": 10.942857142857143, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T346I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A522V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I"]}, "A.28": {"nsamples": 237, "lastcoldate": "2021-05-11", "residual": -0.9182508484949905, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 25.050632911392405, "mutations": ["aa:orf1a:V86F", "aa:orf1a:A3529T", "aa:orf1b:A975V", "aa:orf1b:D1183Y", "del:21765:6", "aa:S:N501T", "aa:S:H655Y", "aa:orf3a:S171L", "aa:orf8:L84S", "aa:N:A35V", "aa:N:S202N"]}, "B.1.575.1": {"nsamples": 146, "lastcoldate": "2021-05-29", "residual": -1.3944346991825505, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 26.095890410958905, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:T3750I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P970S", "aa:S:S494P", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:T716I", "aa:orf3a:Q57H", "aa:M:I82T", "del:28271:1", "aa:N:T205I", "aa:N:A414S", "del:29711:1"]}, "B.1.177.64": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2021-01-25", "residual": 0.44494213583690284, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 22.88888888888889, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V658I", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.531": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2021-01-24", "residual": -1.0979869097740398, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 23.2, "mutations": ["aa:orf1a:V862I", "aa:orf1a:I2057T", "aa:orf1a:Q3036R", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1a:A3571V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E735D", "aa:orf1b:D837A", "aa:S:D614G", "aa:S:P1162S", "del:27869:1", "aa:orf7b:E39Q", "aa:orf8:Q27*", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.411": {"nsamples": 283, "lastcoldate": "2021-06-01", "residual": -0.8855715646683678, "max_ndiffs": 47, "mean_ndiffs": 28.434628975265017, "mutations": ["aa:orf1a:T346I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D436G", "aa:orf1b:M657I", "aa:S:D614G", "aa:S:H1159Y", "aa:N:T205I"]}, "B.1.611": {"nsamples": 23, "lastcoldate": "2020-08-11", "residual": 0.4986295308167768, "max_ndiffs": 15, "mean_ndiffs": 13.565217391304348, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:F3271Y", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.615": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2020-08-14", "residual": 0.5383115183869971, "max_ndiffs": 18, "mean_ndiffs": 16.416666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:S984I", "aa:orf1a:K1655N", "aa:orf1a:V3718F", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H"]}, "B.1.604": {"nsamples": 42, "lastcoldate": "2021-04-21", "residual": -0.9182508484949905, "max_ndiffs": 44, "mean_ndiffs": 34.61904761904762, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:D1639N", "aa:orf1a:R2115I", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1000L", "aa:orf1b:N2593S", "aa:S:H49Y", "aa:S:A262S", "aa:S:L452R", "aa:S:N501Y", "aa:S:Q613H", "aa:S:D614G", "aa:S:P681R", "aa:S:D796Y", "aa:orf3a:Q57H", "ins:28273:9", "aa:N:T165I", "aa:N:G215V", "aa:N:T247I", "aa:orf1b:P1223S", "aa:orf1b:A2222V", "aa:S:N978S", "aa:orf3a:T32I", "aa:orf3a:P240L"]}, "B.1.1.345": {"nsamples": 22, "lastcoldate": "2021-03-07", "residual": -0.05691829508876538, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 17.636363636363637, "mutations": ["aa:orf1a:Y2141C", "aa:orf1b:A302S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A2028S", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:H78Y", "aa:orf3a:M260I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf3a:K75N"]}, "B.1.177.49": {"nsamples": 19, "lastcoldate": "2021-02-22", "residual": 1.399644071870764, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 16.894736842105264, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L54F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf8:V62L", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.45": {"nsamples": 2084, "lastcoldate": "2021-02-16", "residual": 0.4659502469126126, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 14.295585412667947, "mutations": ["aa:orf1a:Y1920H", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2178F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "M.2": {"nsamples": 3, "lastcoldate": "2021-03-02", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 22.333333333333332, "mutations": ["aa:orf1a:G519S", "aa:orf1a:D1036E", "aa:orf1a:A3995V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1291S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W69C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.393": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2021-02-06", "residual": 0.12048353168662625, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 23.666666666666668, "mutations": ["aa:orf1a:A872T", "aa:orf1a:S2103F", "aa:orf1a:A2529V", "aa:orf1a:F3605L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K2063N", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:orf6:I33T", "aa:orf7b:E33A", "aa:orf8:V114I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T"]}, "B.1.177.68": {"nsamples": 42, "lastcoldate": "2021-03-10", "residual": 0.3935889755157697, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 19.666666666666668, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:Q14R", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.177.88": {"nsamples": 65, "lastcoldate": "2021-04-20", "residual": -2.0830338950533243, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 25.415384615384614, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1973G", "aa:S:A222V", "aa:S:A262S", "aa:S:P272L", "aa:S:E484K", "aa:S:T572I", "aa:S:D614G", "aa:S:L1063F", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.1.384": {"nsamples": 37, "lastcoldate": "2021-03-04", "residual": -0.5401048494423815, "max_ndiffs": 25, "mean_ndiffs": 20.37837837837838, "mutations": ["aa:orf1b:T284I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K2557R", "aa:S:P479S", "aa:S:D614G", "aa:S:K854N", "aa:S:A1078S", "aa:orf3a:A23S", "aa:orf3a:G224C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:P383S"]}, "B.1.258.23": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2021-01-27", "residual": 1.042506183816323, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 26.2, "mutations": ["aa:orf1a:R73C", "aa:orf1a:I2501T", "aa:orf1a:M4241I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V711I", "aa:orf1b:P976L", "aa:orf1b:H1213Y", "aa:orf1b:A1521S", "del:21765:6", "aa:S:L189F", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:S:V772I", "aa:orf3a:Q185H", "aa:orf7a:I3T", "aa:N:P67S", "aa:N:T334I"]}, "B.1.623": {"nsamples": 810, "lastcoldate": "2021-05-28", "residual": -0.21564624529210485, "max_ndiffs": 43, "mean_ndiffs": 30.32345679012346, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:T2952I", "aa:orf1a:T3202M", "aa:orf1a:H3580Q", "aa:orf1a:P4197S", "aa:orf1a:S4398L", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S494P", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:E1111K", "aa:orf3a:Q57H", "del:27922:35", "aa:N:M234I", "aa:S:K854N"]}, "B.1.1.343": {"nsamples": 8, "lastcoldate": "2021-02-04", "residual": 0.8767755298693858, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 21.875, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S769N", "aa:S:M153T", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf10:T12M"]}, "B.1.160.27": {"nsamples": 61, "lastcoldate": "2021-01-30", "residual": -0.48875168904370675, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 30.098360655737704, "mutations": ["aa:orf1a:P80S", "aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:S:S254Y", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "B.1.438.2": {"nsamples": 49, "lastcoldate": "2021-02-06", "residual": 1.987871181525387, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 21.3265306122449, "mutations": ["aa:orf1a:M297V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S997L", "aa:S:D614G", "aa:S:Q675H", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:L95F", "aa:orf6:W27L", "aa:N:M234I", "aa:N:D401Y"]}, "B.1.36.37": {"nsamples": 107, "lastcoldate": "2021-02-22", "residual": -1.5204833655592673, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 17.39252336448598, "mutations": ["aa:orf1a:V561A", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1895V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:S194L", "aa:orf1a:I476V", "aa:orf1a:T1754I"]}, "B.1.1.422": {"nsamples": 3, "lastcoldate": "2021-03-17", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 21.0, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:K2063R", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.29": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2021-01-28", "residual": -1.4341166867527708, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 19.0, "mutations": ["aa:orf1a:L3338F", "aa:orf1a:M3655V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:N:A220V", "aa:N:A252S", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.160.25": {"nsamples": 76, "lastcoldate": "2021-03-26", "residual": 0.43327096308599, "max_ndiffs": 34, "mean_ndiffs": 29.223684210526315, "mutations": ["aa:orf1a:M3087I", "aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A517V", "aa:orf1b:V767L", "aa:orf1b:K1141R", "aa:orf1b:E1184D", "aa:orf1b:A1525S", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:T190I", "aa:N:M234I", "aa:N:A376T"]}, "C.1.1": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2021-01-15", "residual": -0.4210588867317207, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 23.636363636363637, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:S477N", "aa:S:D614G", "aa:orf8:R52K", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:L2062F", "aa:orf1b:T1336I", "aa:S:A688S", "aa:S:S689R", "aa:S:M1237I", "aa:orf3a:L86F", "aa:orf8:P93L"]}, "B.1.1.338": {"nsamples": 50, "lastcoldate": "2021-03-01", "residual": -0.1362822701516643, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 18.34, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R2308C", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:P365L", "aa:orf10:R24C", "aa:orf3a:D173G"]}, "B.1.214.3": {"nsamples": 79, "lastcoldate": "2021-04-19", "residual": -1.1096580826024942, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 28.468354430379748, "mutations": ["aa:orf1a:I1398V", "aa:orf1a:T1881I", "del:11283:9", "aa:orf1a:Y3722C", "aa:orf1a:A4016V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R574G", "aa:S:T95I", "aa:S:T478K", "aa:S:D614G", "aa:S:T716I", "del:28271:2", "aa:N:D3H", "aa:N:D3V", "aa:N:D3E", "aa:N:T205I"]}, "B.1.214.1": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2021-02-26", "residual": 0.47295295065621024, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 18.73076923076923, "mutations": ["aa:orf1a:I1398V", "aa:orf1a:T1881I", "aa:orf1a:A4016V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1511I", "aa:N:T205I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:W193L"]}, "A.2.5.1": {"nsamples": 76, "lastcoldate": "2021-05-23", "residual": 0.1088123589357134, "max_ndiffs": 47, "mean_ndiffs": 37.19736842105263, "mutations": ["aa:orf1a:L4F", "aa:orf1a:A486V", "aa:orf1a:K1657E", "aa:orf1a:F3071Y", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:H3580Q", "aa:orf1b:P1000L", "del:21981:9", "ins:22206:9", "aa:S:L452R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S74F", "aa:orf3a:G196V", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S197L", "aa:N:M234I", "aa:N:P365S", "aa:N:P383L"]}, "AD.2.1": {"nsamples": 11, "lastcoldate": "2021-02-27", "residual": -1.1096580826024942, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 22.272727272727273, "mutations": ["aa:orf1a:I300F", "aa:orf1a:L681F", "aa:orf1a:H1545Y", "aa:orf1a:P1786L", "aa:orf1b:E245D", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M2025I", "aa:orf1b:T2084I", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T223I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:A398V"]}, "B.1.499.1": {"nsamples": 4, "lastcoldate": "2021-03-26", "residual": -1.679211315762607, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 24.75, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L747F", "aa:orf1a:S3884L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1844V", "aa:S:D614G", "aa:S:A626S", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf7b:H42Y", "aa:N:S197L"]}, "C.34": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2020-12-06", "residual": 0.9094548136960084, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 16.375, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:G3278S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "R.2": {"nsamples": 41, "lastcoldate": "2021-04-12", "residual": 0.7180475796660464, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 23.48780487804878, "mutations": ["aa:orf1a:A1049V", "aa:orf1a:K1202N", "aa:orf1a:Q1592R", "aa:orf1a:D4085G", "aa:orf1b:A302S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:S:Q677H", "aa:S:T732S", "aa:S:E1202Q", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.1.318": {"nsamples": 1437, "lastcoldate": "2021-05-26", "residual": 1.0541773565672359, "max_ndiffs": 43, "mean_ndiffs": 34.32637439109256, "mutations": ["aa:orf1a:E1196V", "aa:orf1a:K2511N", "aa:orf1a:T2936I", "aa:orf1a:A3209V", "aa:orf1a:T3284I", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2371M", "aa:S:T95I", "del:21991:3", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:D796H", "aa:M:I82T", "del:27887:15", "aa:orf8:E106*", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:28896:3"]}, "B.1.351.3": {"nsamples": 516, "lastcoldate": "2021-05-22", "residual": -1.1773508849144803, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 31.143410852713178, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:K1655N", "aa:orf1a:P2046L", "aa:orf1a:N2596S", "aa:orf1a:K3353R", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:I1074V", "aa:S:L18F", "aa:S:D80A", "aa:S:D215G", "del:22281:9", "aa:S:K417N", "aa:S:E484K", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:S:A701V", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S171L", "aa:E:P71L", "aa:N:T205I"]}, "AE.3": {"nsamples": 9, "lastcoldate": "2020-08-21", "residual": -1.6535347356020402, "max_ndiffs": 17, "mean_ndiffs": 14.11111111111111, "mutations": ["aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1a:T2274I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:L116F", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.369.1": {"nsamples": 26, "lastcoldate": "2021-01-21", "residual": -1.4737986743229912, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 21.23076923076923, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:P732S", "aa:orf1a:G1125C", "aa:orf1a:R1170C", "aa:orf1a:A4394V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Y1192C", "aa:orf1b:A2132T", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:L15F", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf6:I32V", "aa:orf8:V62L", "aa:N:A152S", "aa:N:S183Y"]}, "U.3": {"nsamples": 194, "lastcoldate": "2021-04-15", "residual": 0.7297187524169592, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 22.221649484536083, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:L18F", "aa:S:A222V", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G18V", "aa:orf3a:V77F", "aa:N:A220V", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.573": {"nsamples": 161, "lastcoldate": "2020-10-03", "residual": 0.13448893909627996, "max_ndiffs": 21, "mean_ndiffs": 14.937888198757763, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "del:1598:6", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:P364L", "aa:orf1b:A788V", "aa:orf1a:K3353R"]}, "B.1.1.464.1": {"nsamples": 137, "lastcoldate": "2020-12-30", "residual": -0.2623309365283812, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 22.547445255474454, "mutations": ["aa:orf1a:T814I", "aa:orf1a:T1168N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E1288D", "aa:orf1b:T2163I", "aa:orf1b:A2585S", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:G172C", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:T4364I"]}, "B.1.214.4": {"nsamples": 101, "lastcoldate": "2021-03-15", "residual": 1.2992719856546135, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 24.455445544554454, "mutations": ["aa:orf1a:H110Y", "aa:orf1a:I1398V", "aa:orf1a:T1881I", "del:11283:9", "aa:orf1a:A4016V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R574G", "aa:S:D614G", "aa:S:T716I", "del:28271:2", "aa:N:D3H", "aa:N:D3V", "aa:N:D3E", "aa:N:T205I"]}, "P.1.2": {"nsamples": 535, "lastcoldate": "2021-05-22", "residual": 1.5840486022346698, "max_ndiffs": 49, "mean_ndiffs": 40.850467289719624, "mutations": ["aa:orf1a:S1188L", "aa:orf1a:K1795Q", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E1264D", "aa:S:L18F", "aa:S:T20N", "aa:S:P26S", "aa:S:D138Y", "aa:S:R190S", "aa:S:K417T", "aa:S:E484K", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:S:H655Y", "aa:S:T1027I", "aa:S:V1176F", "aa:orf3a:S253P", "aa:orf8:E92K", "ins:28263:4", "aa:N:P80R", "aa:N:S202C", "aa:N:S202T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "C.37": {"nsamples": 622, "lastcoldate": "2021-05-29", "residual": -1.599847340699708, "max_ndiffs": 47, "mean_ndiffs": 32.660771704180064, "mutations": ["aa:orf1a:T1246I", "aa:orf1a:P2287S", "aa:orf1a:F2387V", "aa:orf1a:L3201P", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:G3278S", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:G75V", "aa:S:T76I", "del:22299:21", "aa:S:L452Q", "aa:S:F490S", "aa:S:D614G", "aa:S:T859N", "aa:N:P13L", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:G214C", "aa:N:T366I"]}, "XA": {"nsamples": 38, "lastcoldate": "2021-04-16", "residual": 0.0411195565461857, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 36.6578947368421, "mutations": ["aa:orf1a:M585T", "aa:orf1a:K3353R", "aa:orf1b:P160S", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E2315K", "del:21765:6", "del:21991:3", "aa:S:N501Y", "aa:S:T549I", "aa:S:A570D", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:T716I", "aa:S:S982A", "aa:S:D1118H", "aa:orf3a:D155Y", "aa:orf8:Q27*", "aa:orf8:R52I", "aa:orf8:K68*", "aa:orf8:Y73C", "del:28271:1", "aa:N:D3H", "aa:N:D3V", "aa:N:D3E", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:S235F", "aa:orf1a:L2609F"]}, "AH.1": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2021-01-15", "residual": -0.48875168904370675, "max_ndiffs": 20, "mean_ndiffs": 17.833333333333332, "mutations": ["aa:orf1a:I114T", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:V3G", "aa:S:D614G", "aa:S:T859I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.177.89": {"nsamples": 31, "lastcoldate": "2021-02-16", "residual": -0.09660028258144403, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 23.64516129032258, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:V2237F", "aa:S:A222V", "aa:S:P272L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S58N", "aa:N:A220V", "aa:N:D377Y", "aa:orf10:V30L", "aa:orf1a:R24C"]}, "B.1.177.31": {"nsamples": 16, "lastcoldate": "2021-02-16", "residual": -0.5004228618721612, "max_ndiffs": 24, "mean_ndiffs": 19.6875, "mutations": ["aa:orf1b:A176S", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf7a:T39I", "aa:orf7a:D51Y", "aa:N:A220V", "aa:N:A376T", "aa:orf10:V30L"]}, "B.1.429.1": {"nsamples": 10, "lastcoldate": "2021-04-08", "residual": -0.1362822701516643, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 30.7, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:I4205V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D1183Y", "aa:S:S13I", "aa:S:W152C", "aa:S:L452R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf8:V100L", "aa:N:P142S", "aa:N:T205I", "aa:N:M234I", "aa:orf1a:V1477I"]}, "P.1.1": {"nsamples": 718, "lastcoldate": "2021-05-26", "residual": 1.0541773565672359, "max_ndiffs": 51, "mean_ndiffs": 38.58635097493036, "mutations": ["aa:orf1a:S1188L", "aa:orf1a:K1795Q", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:E1264D", "aa:S:L18F", "aa:S:T20N", "aa:S:P26S", "aa:S:D138Y", "aa:S:R190S", "aa:S:K417T", "aa:S:E484K", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:S:H655Y", "aa:S:T1027I", "aa:S:V1176F", "aa:orf3a:S253P", "aa:orf8:E92K", "ins:28263:4", "aa:N:P80R", "aa:N:S202C", "aa:N:S202T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.526.3": {"nsamples": 87, "lastcoldate": "2021-05-17", "residual": 1.6237305898048902, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 21.586206896551722, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:L3201P", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:P42L", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:M234I", "aa:orf1b:Q1011H", "aa:orf8:T11I", "del:28271:1"]}, "P.3": {"nsamples": 86, "lastcoldate": "2021-05-13", "residual": 1.9481891939551668, "max_ndiffs": 41, "mean_ndiffs": 33.31395348837209, "mutations": ["aa:orf1a:D1554G", "aa:orf1a:S2625F", "aa:orf1a:D2980N", "aa:orf1a:L3201P", "aa:orf1a:D3681E", "aa:orf1a:L3930F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:L1203F", "aa:orf1b:A1291V", "del:21981:9", "del:22289:6", "aa:S:E484K", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:E1092K", "aa:S:H1101Y", "aa:S:V1176F", "aa:orf8:K2Q", "del:28271:1", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "A.2.4": {"nsamples": 46, "lastcoldate": "2021-04-14", "residual": -1.2170328724847006, "max_ndiffs": 32, "mean_ndiffs": 14.26086956521739, "mutations": ["aa:orf1a:F3071Y", "aa:orf3a:G196V", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S197L"]}, "B.1.619": {"nsamples": 489, "lastcoldate": "2021-05-26", "residual": 0.0411195565461857, "max_ndiffs": 50, "mean_ndiffs": 37.56850715746421, "mutations": ["aa:orf1a:A2123V", "aa:orf1a:E2607K", "del:11288:9", "aa:orf1a:M3752I", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:I210T", "aa:S:N440K", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:S:D936N", "aa:S:S939F", "aa:S:T1027I", "aa:M:I82T", "aa:orf7a:E22D", "del:28271:1", "aa:N:P13L", "aa:N:S201I", "aa:N:T205I"]}, "A.2.5.2": {"nsamples": 48, "lastcoldate": "2021-05-19", "residual": 0.1088123589357134, "max_ndiffs": 39, "mean_ndiffs": 34.4375, "mutations": ["aa:orf1a:L4F", "aa:orf1a:K1657E", "aa:orf1a:F3071Y", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:H3580Q", "aa:orf1b:M620T", "aa:orf1b:P1000L", "aa:S:L452R", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:S74F", "aa:orf3a:G196V", "aa:orf7a:A105S", "aa:orf8:L84S", "aa:N:S197L", "aa:N:M234I", "aa:N:P365S", "aa:N:P383L", "ins:22206:9"]}, "B.1.616": {"nsamples": 30, "lastcoldate": "2021-04-23", "residual": 0.0014375689759654256, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 40.266666666666666, "mutations": ["aa:orf1a:T265I", "aa:orf1a:N1324S", "aa:orf1a:T1638I", "aa:orf1a:S2261Y", "aa:orf1a:Y3160H", "aa:orf1a:A3523V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Q813R", "aa:orf1b:L1681F", "aa:orf1b:T2537I", "aa:orf1b:K2674R", "aa:S:H66D", "aa:S:G142V", "del:21991:3", "aa:S:D215G", "aa:S:V483A", "aa:S:D614G", "aa:S:H655Y", "aa:S:G669S", "aa:S:Q949R", "aa:S:N1187D", "aa:orf3a:Q57H", "aa:E:F20L", "aa:E:T30I", "aa:M:H125Y", "del:27267:29", "aa:orf7a:*122R", "aa:N:T325I", "aa:orf10:A8V", "aa:orf1a:T619I"]}, "AU.3": {"nsamples": 62, "lastcoldate": "2021-04-29", "residual": 0.935131393856575, "max_ndiffs": 29, "mean_ndiffs": 24.951612903225808, "mutations": ["aa:orf1a:S944L", "aa:orf1a:T1168I", "aa:orf1a:P1640L", "aa:orf1a:T2615I", "aa:orf1a:L3644F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1182L", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:S:P681R", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I", "aa:N:D348H", "aa:orf1b:T2040I"]}, "AU.1": {"nsamples": 79, "lastcoldate": "2021-04-01", "residual": -0.16429308489343009, "max_ndiffs": 27, "mean_ndiffs": 23.88607594936709, "mutations": ["aa:orf1a:A690V", "aa:orf1a:A776V", "aa:orf1a:P804L", "aa:orf1a:T1168I", "aa:orf1a:P1640L", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:R2308C", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I", "aa:orf10:P10S", "aa:orf1b:A1057G"]}, "B.1.618": {"nsamples": 80, "lastcoldate": "2021-04-08", "residual": 0.3072222966317315, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 30.175, "mutations": ["aa:S:D614G", "aa:N:M234I", "aa:orf1a:S1189G", "aa:orf1a:S1515F", "aa:orf1b:D260N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:Y1200C", "del:21993:6", "aa:S:E484K", "aa:orf3a:T151I", "aa:orf7b:E33*", "aa:orf8:Q29L", "aa:N:G18S", "aa:N:A119S", "aa:N:A217S", "aa:orf7a:P34S", "aa:N:E367Q"]}, "B.1.1.442": {"nsamples": 33, "lastcoldate": "2021-04-13", "residual": -1.61385274803182, "max_ndiffs": 30, "mean_ndiffs": 15.151515151515152, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "del:3879:30", "aa:N:T379I"]}, "B.1.617.1": {"nsamples": 1773, "lastcoldate": "2021-05-31", "residual": 0.7974115548064868, "max_ndiffs": 50, "mean_ndiffs": 31.679075014100395, "mutations": ["aa:orf1a:T1567I", "aa:orf1a:T3646A", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:G1129C", "aa:orf1b:M1352I", "aa:orf1b:K2310R", "aa:orf1b:S2312A", "aa:S:G142D", "aa:S:E154K", "aa:S:L452R", "aa:S:E484Q", "aa:S:D614G", "aa:S:P681R", "aa:S:Q1071H", "aa:orf3a:S26L", "aa:M:I82S", "aa:orf7a:V82A", "del:28271:1", "aa:N:R203M", "aa:N:D377Y"]}, "AU.2": {"nsamples": 172, "lastcoldate": "2021-04-14", "residual": 1.3786359607175125, "max_ndiffs": 35, "mean_ndiffs": 26.406976744186046, "mutations": ["aa:orf1a:S944L", "aa:orf1a:T1168I", "aa:orf1a:P1640L", "aa:orf1a:I3618V", "aa:orf1a:L3644F", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S1182L", "aa:orf1b:D2179Y", "aa:S:N439K", "aa:S:D614G", "aa:S:P681R", "aa:S:G1251V", "aa:orf3a:Q57H", "aa:N:T205I"]}, "N.10": {"nsamples": 24, "lastcoldate": "2021-04-26", "residual": -1.4737986743229912, "max_ndiffs": 38, "mean_ndiffs": 34.458333333333336, "mutations": ["aa:orf1a:P1640L", "aa:orf1a:P3371S", "aa:orf1a:P3395S", "aa:orf1a:V3718A", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:P9L", "del:21982:12", "aa:S:I210V", "del:22194:3", "del:22327:9", "aa:S:V445A", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:orf6:I33T", "del:27794:4", "aa:N:Q70R", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:I292T", "del:29726:1"]}, "B.1.1.404": {"nsamples": 3, "lastcoldate": "2020-12-31", "residual": 0.8370935423767072, "max_ndiffs": 22, "mean_ndiffs": 21.333333333333332, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D2361Y", "aa:S:D614G", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R"]}, "B.1.438.3": {"nsamples": 6, "lastcoldate": "2021-03-18", "residual": 1.5840486022346698, "max_ndiffs": 23, "mean_ndiffs": 19.833333333333332, "mutations": ["aa:orf1a:M297V", "aa:orf1a:R1628C", "aa:orf1a:M3221I", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:D2142Y", "aa:S:D614G", "aa:S:Q675H", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:L95F", "aa:N:M234I", "aa:N:D401Y"]}, "B.1.622": {"nsamples": 43, "lastcoldate": "2021-04-03", "residual": 0.08080154411640597, "max_ndiffs": 28, "mean_ndiffs": 24.209302325581394, "mutations": ["aa:orf1a:H110Y", "aa:orf1a:S428N", "aa:orf1a:T2196N", "aa:orf1a:M3621I", "aa:orf1a:L3977V", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S2312L", "aa:S:D614G", "aa:orf3a:T14I", "aa:orf3a:Q57H", "aa:orf3a:S216P", "aa:N:Q70R", "aa:N:S187L"]}, "B.1.620": {"nsamples": 258, "lastcoldate": "2021-05-24", "residual": 0.43327096308599, "max_ndiffs": 44, "mean_ndiffs": 31.43798449612403, "mutations": ["aa:orf1a:T403I", "aa:orf1a:V1991I", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:A1215S", "aa:S:P26S", "del:21765:6", "aa:S:V126A", "del:21991:3", "del:22286:7", "del:22294:2", "aa:S:S477N", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:T1027I", "aa:S:D1118H", "del:27795:3", "aa:N:A220V"]}, "B.1.243.1": {"nsamples": 7, "lastcoldate": "2021-04-30", "residual": 1.5840486022346698, "max_ndiffs": 26, "mean_ndiffs": 22.571428571428573, "mutations": ["del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1511I", "aa:S:V213G", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "ins:28265:3", "aa:N:S194L", "del:29747:12"]}, "B.1.617.2": {"nsamples": 16324, "lastcoldate": "2021-05-31", "residual": 0.7577295672362666, "max_ndiffs": 53, "mean_ndiffs": 37.589622641509436, "mutations": ["aa:orf1b:P314L", "aa:S:T19R", "aa:S:G142D", "del:22029:6", "aa:S:L452R", "aa:S:T478K", "aa:S:D614G", "aa:S:P681R", "aa:S:D950N", "aa:orf3a:S26L", "aa:M:I82T", "aa:orf7a:V82A", "aa:orf7a:T120I", "del:28271:1", "aa:N:D63G", "aa:N:R203M", "aa:N:D377Y", "aa:orf1a:A1306S", "aa:orf1a:P2046L", "aa:orf1a:P2287S", "aa:orf1a:V2930L", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:T3646A", "aa:orf1b:G662S", "aa:orf1b:P1000L", "aa:orf1b:A1918V", "aa:orf7b:T40I", "del:28248:6", "aa:N:G215C", "aa:S:T95I"]}, "B.1.621": {"nsamples": 201, "lastcoldate": "2021-05-29", "residual": 1.749779256181607, "max_ndiffs": 42, "mean_ndiffs": 35.64179104477612, "mutations": ["aa:orf1a:T1055A", "aa:orf1a:T1538I", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:Q3729R", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1342S", "aa:S:T95I", "ins:21991:3", "aa:S:Y144S", "aa:S:Y145N", "aa:S:R346K", "aa:S:E484K", "aa:S:N501Y", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:D950N", "aa:orf3a:Q57H", "del:26158:4", "aa:orf8:T11K", "aa:orf8:P38S", "aa:orf8:S67F", "aa:N:T205I"]}, "B.1.617.3": {"nsamples": 74, "lastcoldate": "2021-04-26", "residual": 0.6106727897062983, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 29.87837837837838, "mutations": ["aa:orf1a:A2344V", "aa:orf1a:T2648I", "aa:orf1a:A3457S", "aa:orf1a:A3686V", "aa:orf1b:P314L", "aa:S:T19R", "aa:S:L452R", "aa:S:E484Q", "aa:S:D614G", "aa:S:P681R", "aa:S:D950N", "aa:orf7a:V82A", "aa:orf8:T26I", "del:28271:1", "aa:N:P67S", "aa:N:R203M", "aa:N:D377Y", "aa:orf1a:A819T"]}, "B.1.1.523": {"nsamples": 117, "lastcoldate": "2021-05-31", "residual": 0.5919989132117879, "max_ndiffs": 40, "mean_ndiffs": 34.8034188034188, "mutations": ["aa:orf1a:N449D", "aa:orf1a:M902V", "aa:orf1a:R2115I", "aa:orf1a:V3566I", "aa:orf1a:V3653F", "aa:orf1a:T4364I", "aa:orf1b:S220N", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:P1000L", "aa:orf1b:L1378M", "del:22028:9", "aa:S:F306L", "aa:S:E484K", "aa:S:S494P", "aa:S:D614G", "aa:S:E780A", "aa:S:D839V", "aa:S:T1027I", "aa:orf3a:S171L", "aa:orf3a:V201F", "aa:M:I82T", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:G212C", "ins:26499:3"]}, "AT.1": {"nsamples": 55, "lastcoldate": "2021-05-20", "residual": -0.9322562559046442, "max_ndiffs": 48, "mean_ndiffs": 42.32727272727273, "mutations": ["aa:orf1a:S376L", "aa:orf1a:V1006F", "aa:orf1a:T1093A", "aa:orf1a:T2247N", "aa:orf1a:T3255I", "aa:orf1a:Q3729R", "aa:orf1a:S4119T", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:T1173N", "aa:orf1b:V1905L", "aa:orf1b:A2431V", "aa:S:P9L", "del:21967:27", "aa:S:D215G", "aa:S:H245P", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "ins:23599:12", "aa:S:E780K", "aa:orf3a:L95M", "aa:M:L16I", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:L39I", "aa:orf1a:L39*", "aa:orf1b:A190S"]}, "B.1.617": {"nsamples": 1, "lastcoldate": "2021-02-25", "residual": -0.3627030226669899, "max_ndiffs": 33, "mean_ndiffs": 33.0, "mutations": ["del:313:1", "del:5356:1", "aa:orf1a:A1812D", "aa:orf1b:P314L", "del:16852:1", "del:17523:1", "del:18100:1", "aa:orf1b:T1952P", "aa:orf1b:T1952K", "aa:orf1b:A1954T", "aa:orf1b:A2306V", "aa:orf1b:H2583R", "aa:S:L452R", "aa:S:E484Q", "aa:S:D614G", "del:23603:1", "del:24774:1", "aa:orf3a:S26L", "del:25677:1", "aa:M:I82S", "aa:orf8:P93S", "aa:orf8:E106Q", "del:28254:1", "del:28881:3", "del:28915:1", "del:29555:1", "del:29692:1"]}, "AV.1": {"nsamples": 84, "lastcoldate": "2021-05-26", "residual": 1.38563866446111, "max_ndiffs": 46, "mean_ndiffs": 41.773809523809526, "mutations": ["aa:orf1a:G519S", "aa:orf1a:A591V", "aa:orf1a:H1160Y", "aa:orf1a:P1640L", "aa:orf1a:N2405S", "aa:orf1a:A3209V", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:S425A", "aa:orf1b:A1643V", "aa:S:D80G", "aa:S:T95I", "aa:S:G142D", "del:21991:3", "aa:S:N439K", "aa:S:E484K", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:I1130V", "aa:S:D1139H", "del:26158:4", "aa:M:A63T", "aa:M:H125Y", "del:28271:2", "aa:N:I157V", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:orf1a:D75G", "aa:orf1a:K1745I", "aa:orf1b:T1404M"]}, "None": {"nsamples": 1, "lastcoldate": "2021-05-16", "residual": -0.031241714850657184, "max_ndiffs": 44, "mean_ndiffs": 44.0, "mutations": ["aa:orf1a:T350I", "aa:orf1a:I671V", "aa:orf1a:T1001I", "aa:orf1a:V1291F", "aa:orf1a:A1708D", "aa:orf1a:T1976I", "aa:orf1a:I2230T", "del:11288:9", "aa:orf1b:P314L", "aa:orf1b:M2025I", "del:21765:6", "del:21991:3", "aa:S:D427N", "aa:S:N501Y", "aa:S:A570D", "aa:S:D614G", "aa:S:P681H", "aa:S:T716I", "aa:S:S982A", "aa:S:D1118H", "aa:orf3a:G188C", "aa:orf7b:L32F", "aa:orf8:Q27*", "aa:orf8:R52I", "aa:orf8:Y73C", "del:28271:1", "aa:N:D3H", "aa:N:D3V", "aa:N:D3E", "aa:N:R203K", "aa:N:G204R", "aa:N:S235F"]}}}